综合国内外的实践，以及我们访谈的有关专家的观点，我们建议：
（1）全国哲学社会科学规划办公室有必要成立专门的办公室支持和指导跨学科研究。高校也要在校级层面成立跨学科委员会，并划拨相应的跨学科基金
毛泽东在《人的正确思想从哪里来？》非常精辟地论述道：“人的正确思想，只能从社会实践中来。”[37]社会实践是哲学社会科学的活水源头，哲学社会科学的发展迫切需要理论联系实际。中国的改革和发展是举世瞩目的，为我国哲学社会科学工作者提供了世界上难得的科学理论试验田。但是，当下我国学术界流行的一些理论是由发达国家的学者提出来的，这些理论来很难正确地解释发展中国家的现象。哲学社会科学工作者要有“先天下之忧而忧，后天下之乐而乐”的责任感，要为政府、社会发现关键的问题，并提出解决问题的方案。在这个过程中，我们需要组织多个学科的专家合作研究，同时也有可能为全球知识界创造出新的理论和新的研究领域。
（2）设立支持跨学科研究的“种子项目”或“预研究项目”
国家社会科学基金重大项目的立项时强调要组织跨学科、跨单位的科研团队开展研究（“鼓励跨学科、跨地区、跨单位联合投标，鼓励与实际部门开展合作研究”）。一般项目的申报也欢迎跨学科的研究项目，以“尽量靠近”原则选择为主的学科进行申报
我们认为，前沿的跨学科研究有一定的难度，其科研进程和成果难以预计，有一定的科研风险，其研究价值也难以达成共识，所以政府的科研资助部门（全国哲学社会科学规划办公室）和大学有必要为跨学科研究专门设立“种子项目”或“预研究项目”，为学者们所提出的跨学科研究项目提供一定的预研经费，根据研究进展，花1—3年进行审核，审核合格或优秀的再划拨后续经费；或者，由全国哲学社会科学规划办公室直接设立国家社会科学基金重大项目。
（3）应该允许二位甚至多位合作者以“共同研究负责人”（Co－PI）的身份申请课题，承认他们的地位和贡献相等或相近。承认多位学者合作完成的科研成果有多位“第一作者”、“通讯作者”，他们在成果的贡献上同等重要。
（4）资助跨学科的学术会议、旅费、培训(www.xing528.com)
跨学科研究的前提是学者们能有一个良好的交流网络和工作环境。为学者们的跨学科会议提供会务资助、旅行资助，从而让学者们能有机会认识、交流，并学会其他学科的语言、文化和知识。研究生是科研的主力军。通过暑期培训班的方式培养研究生和青年教师掌握多学科的知识和研究方法是较快发展跨学科研究人力资源的方式。
要求开放、共享政府公共资金支持的研究项目的调研数据，发挥其最大效益，避免仅仅为课题组所有、单位所有。2011年开始，美国国家基金会要求申请人提供项目研究所得数据的共享计划。[38]
制定数据采集、保存的标准和规范，建立若干个研究领域的数据库；在北京、上海等地建立数据共享中心，保证学者们可以通过网络等方式获取数据。
（6）政府应支持高校创建大型的跨学科研究中心
我们认为，大型的跨学科研究中心应建立在高校，由政府、高校、企业、社会各界共同建设，这样会把基地建设、科学研究和人才培养等各项工作充分地结合起来，发挥每一份资源的最大效率。建议全国哲学社会科学规划办公室大力支持高校成为“智库”（Think Tank，也称“思想库”）[39]。
2014年3月，国家自然科学基金委员会杨卫主任谈到，在当前和今后一段时期，科学基金有四项战略使命，其中一项使命是：“延交叉之远，把推动学科交叉融合、破解复杂难题作为科学基金工作的战略重点，探索围绕重大科学目标凝练大型科学研究计划，试点支持跨学科研究中心等。”[40]
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