IlluminaR公司开发的光纤微珠芯片技术高通量

Illumina R公司开发了一种超高通量新技术——光纤微珠芯片（fi beroptic bead array）。这种技术是目前世界上最先进的对全基因组SNP位点进行扫描分析的技术之一，是HapMap（人类单体型计划）项目的主要技术平台，HapMap一期数据的70%都出自于Illumina R这一平台。

这项技术采用光纤材料和直径3μm的微硅珠，在每根光纤的末端蚀刻出一个微孔，可容纳一个微珠。每个微珠表面可偶联上近百万条相同的寡核苷酸序列，该核苷酸序列包含两部分，一是特殊的地址序列（address或ZIP code），一是根据基因序列信息确定的探针序列（图2-6）。

把包含多条不同寡核苷酸地址序列的微珠汇聚到同一根管子里，构成微珠池，然后加入光纤，微珠可以自行与光纤末端的微孔结合组装。当入射光光子通过在光纤材料内部的内反射传输到末端时，如果微孔中结合有微珠，就会被激发产生荧光信号，如果微孔中没有结合上微珠，则无荧光信号产生。利用解码技术对微孔中的微珠进行解码，通过对每一颗种微珠的类型、位置、数量、信号强弱进行解读，不合格的微珠信道被关闭。

用于光纤微珠芯片分析的DNA模板通过等位基因特异性延伸生成，与此同时通过连接反应在其5′和3′端分别加上通用引物序列以及地址序列和通用引物序列。模板制备完成后，再用一对通用引物进行PCR扩增，扩增产物与结合到微孔的带有寡核苷酸的纤维束进行杂交。

图2-6　光纤微珠芯片技术

Illumina R的96-束光纤微珠芯片能够在一个实验平行处理15万个检测，每天可进行100多万次检测。因为是探查预定义的寡核苷酸地址序列，因此本方法的精确度比直接检测基因组序列变异方法更好。(www.xing528.com)

（王　果　刘　洁）

参 考 文 献

［1］　Kwok PY.Methods for genotyping single nucleotide polymorphisms.Annu Rev Genomics Hum Gen，2001，2：235-258

［2］　Syvanen AC.Accessing genetic variation：genotyping single nucleotide polymorphisms.Nat Rev Genet，2001，2：930-938

［3］　Tsuchihashi Z，Dracopoli NC.Progress in high throughput SNP genotyping methods.Pharmacogen J，2002，2：103-110