深圳市在《深圳市碳排放权交易管理暂行办法》中对第三方核查机构的基本条件做出了限定，包括注册地点、注册时间、核查机构规模、内部管理、违约记录等。具体包括：第三方核查机构必须是在本市注册2年以上，具有独立法人资格的企事业单位、社会团体或者依法设立的分支机构；且在本市拥有固定的办公场所和必要设施；10 名以上专职核查人员；具有明确的内部管理制度；没有碳核查从业违法违规行为记录；以及具备一定的经济偿付能力，并设立了应对风险的基金或者购买相应的风险责任保险。
上海市在《上海市碳排放核查第三方机构管理暂行办法》中规定，第三方核查机构需要在本地注册，而且规定了最低的注册资本金，也规定了从业人员规模等。具体包括：第三方核查机构需在本地注册，企业法人注册资本不低于1000万元，事业法人不低于500万元，具有固定场所及健全的财务制度；具有碳排放核查从业经验；6名以上核查人员；健全的内部质量管理制度等。
北京市在《北京市碳排放权交易核查机构管理办法（试行）》中规定，申请备案的核查机构条件包括：本地注册，注册资金在300万元人民币以上，近两年法人年检均合格；拥有固定办公场所及健全的财务会计制度；3名以上核查员，以及从业经验及内部质量管理制度等。
可见各个试点对于核查机构的规定存在很大的差异性，为了全面比较各个试点的具体情况，我们用表3-1对此进行了总结。显然，从制度完备性来看，北京、上海、广东、湖北和深圳市表现较好，对各个方面都做了较为详细的规定。但是，天津、重庆的制度建设较为落后，并未对第三方核查机构做出较为详细的规定。有地域限制的是北京、上海和深圳，显然这样的规定不利于核查机构之间的竞争，属于较为不合理的规定，带有明显的地方保护主义。关于注册期限的限制只有深圳和北京有，显然这样的限制也缺乏严谨性和公平性，应该是对资质做出限制，而不是简单地限制注册年限，这带有明显的保护既有核查机构的意味。对注册资本有限制的是北京、上海和广东。但是，只有上海对机构类型做出了限制，但是也只是简单地将其分为企业法人和事业法人，而未对具体的行业背景做出限制。对企业规模的限制差异最大，最多的为10人，最少的为3人，显然这样的设置门槛并没有充足的依据，仅仅是地方主管部门的主观判断，或者仅仅从前期参与的核查机构条件进行设置。深圳、北京、上海和湖北都需要从业经验。只有深圳和天津具有连续委托的限制，其他省市并无相关规定。在所有试点碳市场中只有深圳市有关于违约记录的限制。(www.xing528.com)
总体而言，就各个试点对核查机构的限制而言，存在明显的地方保护主义，也存在明显的既得利益者保护，不利于在全国范围内展开公平的竞争，也不利于形成良好的市场竞争环境，破坏了行业的竞争生态，从而不利于行业的长远发展。
表3-1 核查机构资质标准的比较
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