为了合理确定碳市场的配额分配，各个试点省市经过多次商议和探讨，形成了各自特色的确定方法。比如北京市和天津市采用“历史法+标杆法”模式；广东省和湖北省采用“历史法+标杆法”结合的模式；上海市采用“历史法+标杆法”+“先期减排”模式；深圳市采用“标杆法+竞争性博弈”模式；重庆市采用“自主申报”模式。具体如下。
北京市配额分配方法以历史法和基准值法为基础，为体现行业水平的差别，又采用了配额调整系数（控排系数），同时对先期减排行动给予总量2%以内的配额奖励。同时北京市又根据既有设施和新增设施进行细化分类，其中既有设施的配额分配均采用历史法，新增设施的配额分配采用行业先进值法。
表2-13 北京市碳市场配额确定方法
天津市配额分配方法以历史法和基准值法为基础，对电力、热力、热电联产行业的纳入企业依据基准值法分配配额；对钢铁、化工、石化、油气开采等行业的纳入企业采用历史法分配配额；新增设施配额由纳入企业因启用新增设施进行申请。新增设施按照纳入企业所属行业碳强度先进值及实际活动水平进行配额的核定。
（1）电力热力行业既有产能配额核定方法。对电力、热力、热电联产行业的纳入企业依据基准值法分配配额。2013年，基准水平依据纳入企业2009—2012年正常工况下单位产出二氧化碳排放的平均值确定。2014年、2015年基准水平按照上一年度基准值下降0.2%确定。
根据当年基准水平，按照2009—2012年正常工况下年平均发电/供热量的90%，向纳入企业分配基本配额。次年履约期间，依据纳入企业实际发电量/供热量，核发调整配额。
（2）其他行业既有产能配额核定方法。对钢铁、化工、石化、油气开采等行业的纳入企业采用历史法分配配额。以历史排放为依据，综合考虑先期减碳行动、技术先进水平及行业发展规划等，向纳入企业分配基本配额。基本配额：其中：H排放基数，为纳入企业2009—2012年正常工况下二氧化碳排放量年平均值；B绩效系数，综合考虑纳入企业先期减碳成效及企业控制温室气体排放技术水平确定；C行业控排系数，2013年取值为1，2014—2015年取值当年公布。
（3）新增设施配额核定方法。纳入企业因启用新增设施产生的排放，可申请新增设施配额。新增设施将按照纳入企业所属行业碳强度先进值及实际活动水平（产值/工业增加值/产量）进行配额的核定，具体核定方法如下。其中，A：新增设施配额数量；P：新增设施碳排放所对应的2013年实际活动水平，例如产值、工业增加值、产量等；B：新增设施所属行业碳强度先进值，行业碳强度先进值是主管部门在参照国内外同一行业、同类型设施、同类产品的先进碳排放水平，结合本市相关行业实际情况后综合确定。
表2-14 天津市碳市场配额确定方法
上海市基于试点企业二氧化碳排放水平，兼顾行业发展阶段和行业的不同特点，按各行业一次性分配2013—2015年试点企业配额、各年度碳排放权配额。其配额分配方法和天津市类似，也包含历史法和基准值法。对于工业（除电力行业外），以及商场、宾馆、商务办公等建筑，采用历史排放法；对于电力、航空、港口、机场等行业，采用基准值法。新增设施配额由纳入企业因启用新增设施进行申请。新增设施按照纳入企业所属行业碳强度先进值及实际活动水平进行配额的核定。
表2-15 上海市碳市场配额确定方法
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重庆市配额分配方法和其余试点省市不同，根据《重庆市碳排放权配额管理细则（试行）》显示，其采用自主申报方式。该细则要求：
配额管理单位每年应当在规定时间内通过碳排放电子申报系统和加盖公章的书面文件向市发改委申报本年度排放量。
配额管理单位申报量之和低于年度配额总量控制上限的，其年度配额按申报量确定。配额管理单位申报量之和高于年度配额总量控制上限的，按以下规定确定年度配额：
配额管理单位申报量高于其历史最高年度排放量的，以两者平均量作为其年度配额分配基数；配额管理单位申报量低于其历史最高年度排放量的，以申报量作为分配基数。
配额管理单位分配基数之和低于年度配额总量控制上限的，其年度配额按分配基数确定；配额管理单位分配基数之和超过年度配额总量控制上限的，其年度配额按分配基数所占权重确定。
湖北省基于试点企业二氧化碳排放水平，兼顾行业发展阶段和行业的不同特点，其配额分配方法和天津市、上海市类似，也采用历史法与基准值法相结合的方法，并且实行事前分配与事后调节相结合的方式。电力行业之外的工业企业的配额采用历史法计算。计算公式为：企业年度初始配额=历史排放基数×总量调整系数；电力行业的配额采用历史法和基准值法相结合来分配。计算公式为：企业年度初始配额=历史排放基数×总量调整系数。
表2-16 湖北省碳市场配额确定方法
广东省基于试点企业二氧化碳排放水平，其配额分配方法和天津市、上海市、湖北省类似，也采用历史法与基准值法相结合的方法，其中对电力行业的燃煤燃气纯发电机组和燃煤热电联产机组、水泥行业的普通水泥熟料生产和粉磨、钢铁行业长流程企业使用基准值法分配配额；对电力行业的燃气热电联产机组和资源综合利用发电机组（使用煤矸石、油页岩等燃料）、水泥行业的矿山开采、微粉粉磨和特种水泥（白水泥等）生产、钢铁行业短流程企业和其他钢铁企业以及石化行业企业使用历史法分配配额。
深圳市试点配额切分方法别具一格，采用了将基准值法与博弈结合的独特方法，其中对电力、供水企业使用产品基准值法；对于制造行业，由于细分行业众多，政府很难把握纳入企业未来配额需求的变化，因而采取以行业碳强度基准值为基础，通过企业之间竞争博弈来确定配额的切分。政府的作用主要在于设定行业配额总量、制定博弈规则以及组织实施博弈。
表2-17 中国七试点省市配额分配方法
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