功能连接数据的分析，即空间遥远的神经生理事件之间的相关性（Friston et al.，1993），成为功能数据的一个有价值的补充。尤其是功能性静息状态测量中的连接性分析显示了一种新的方法，可以更深入地了解不同大脑区域协作的数量或质量（参见Voss et al.，2010a），因为它们有可能揭示与任务无关的结果。
Burdette等人分析了海马与其他大脑区域的功能连通性（Burdette et al.，2010）。干预4个月后，fMRI测量静息脑血流量显示，与健康教育组相比，有氧训练组的海马脑血流量（cerebral blood flow，CBF）显著增加，该结果也得到了确认（Pereira et al.，2007）。此外，研究结果表明，海马仅显示与运动组前扣带皮质的更高连通性。然而，该研究是使用每组5～6名参与者的非常小的样本进行的，并且缺少干预前扫描。因此，应谨慎处理研究结论。
对默认模式网络（DMN）的分析在功能连接研究领域中得到了普及。DMN描述了一组显示静息活动和任务处理期间活动减少的大脑区域（Raichle et al.，2001）。它包括前额叶、顶叶、内侧颞部和视觉区域的部位，如后扣带皮质、额中回、外侧顶叶区和舌回。在两项与年轻受试者的比较研究中，研究者分析了有氧适能、DMN中的功能连接性和认知表现之间的关联（Voss et al.，2010a，b）。第一项横断面研究（Voss et al.，2010a）显示了DMN区域内和区域之间功能连接的显著的年龄相关缺陷。良好的心血管健康与年龄敏感的额叶区域以及老年人的额叶、颞区之间的DMN的更高功能连接性相关。此外，在空间记忆和执行控制任务中，这些区域内的功能连接促成了更好的认知行为成绩。一项为期12个月的干预研究（Voss et al.，2010b）支持了横断面数据，并显示心血管训练改善了老化大脑在额叶、枕叶和颞叶区域的静息功能效率，与6个月训练后的非显著趋势相比，12个月训练后，执行控制功能明显改善。(www.xing528.com)
因此，研究结果表明，高体能老年人或有氧干预后更高的认知能力可能是基于休息时任务相关大脑区域内和区域之间的更高功能连接。Voss等（2010b）认为这确实可以证明DMN的更高功能连接性与更好的执行控制功能有关。其他认知领域是否也会受益于运动引起的更高连接性目前尚不清楚。由于海马与其他几个大脑区域的功能连接（Burdette et al.，2010）也通过心血管活动得到增强，记忆功能也可能受到积极影响。
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