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DNA扩增技术:PCR的诞生

时间:2023-11-22 理论教育 版权反馈
【摘要】:科学家的性格特点就是“创造“。 利用自然界的物质条件来创造从未有过的新生事物,是所有科学家的共同“爱好”。 在发现了DNA复制过程的奥秘以后,科学家们就想利用这些奥秘来人工合成DNA。 既然细胞核能制造DNA,那为什么不能在人工的条件下,按照人的意愿来制造出和细胞里的DNA一样的DNA呢?当然,科学家不能抛开自然界来另搞一套,科学家的创造是要站在大自然这个巨人的肩膀上才能完成的。 那么,自然界可以

DNA扩增技术:PCR的诞生

科学家的性格特点就是“创造“。 利用自然界的物质条件来创造从未有过的新生事物,是所有科学家的共同“爱好”。 在发现了DNA复制过程的奥秘以后,科学家们就想利用这些奥秘来人工合成DNA。 既然细胞核能制造DNA,那为什么不能在人工的条件下,按照人的意愿来制造出和细胞里的DNA一样的DNA呢?

当然,科学家不能抛开自然界来另搞一套,科学家的创造是要站在大自然这个巨人的肩膀上才能完成的。 那么,自然界可以利用来合成DNA的“原材料”有哪些呢? DNA聚合酶;然后,必须有DNA的“模板”和引物。 注意,引物的作用是在DNA的需要被扩增的位置建立部分双链,因此它既可以是RNA,也可以是DNA。 此外,还要有DNA聚合酶需要的核苷三磷酸。 有了这些原材料,就可以来尝试照天然“模板”的样子人工合成DNA了。

20世纪后半叶,科学家们已经注意到:DNA聚合酶加引物就可能把一段DNA复制几次。 有几个大学教授就用普通的DNA聚合酶和一对引物,在通常的DNA聚合酶反应中,把一小段DNA扩增了4倍。 这可以说是走向用DNA聚合酶在无细胞条件下合成DNA的第一次尝试[1]

那时,美国有一家生物化学公司叫希特斯(Cetus)。 希特斯公司的产品都是些生物化学试剂,是卖给科研单位的。 公司里有个研究人员叫莫里斯(K.Mullis),他的工作是合成小分子的DNA。 莫里斯是个思想活跃的人,他常常想怎样合成分子量更大的DNA、怎样按照已知的序列合成DNA。 有次他在晚上开车和女朋友一起出游的时候,忽然想到可以利用两个分别与互补链的一端互补的短链DNA,作为DNA聚合酶的引物。 这样DNA聚合酶在完成了一条链的合成后,就可以利用和另一条链互补的另一个引物,再合成一条链。 只要能够反复地使DNA聚合酶依次用两个引物进行DNA合成,就应当能不断合成两条互补的DNA链。 如果这两条链能重新通过碱基配对“复性”成一条双链,那不就能实现DNA的扩增了吗? 他把自己的想法汇报给了公司的领导,引起了公司领导的兴趣,公司特别免除了他的DNA合成任务,指示他带领几个同事,专心进行用DNA聚合酶扩增DNA的研究。

功夫不负有心人,几年后,莫里斯等人终于初步做成了这项研究。 他们的做法是:利用分别与DNA的两端互补的两个短DNA片段作为引物,在通常的DNA聚合酶的反应条件下,进行DNA复制。 当复制完成后,对反应液加温,当温度高过该段DNA的变性温度后,DNA双链就分开成为两条单链。 然后降低反应液的温度,当温度降低到引物和互补DNA链的复性温度后,该段DNA链就和互补的引物重新结合成为双链,在DNA单链上形成部分的双链区,因而给DNA聚合酶提供再次进行DNA复制的条件。 如此,可以把一条DNA链“放大”(扩增)许多倍。 由于DNA聚合酶极高的专一性,扩增产物纯度可接近100%。 莫里斯称这技术为“聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)”[2]

但是他们还只是初步做成了这项技术,它还有很大的缺点。 当时用的DNA聚合酶是怕热的。 这里要说一说,在生物化学和分子遗传学实验中所使用的酶,绝大多数都是怕热的,许多酶在室温——25℃下就会很快失活,也就是坏掉。 因此,DNA聚合酶的反应还没进行几个“回合”(我们以后就叫它“循环”),酶就失活了,只好再向反应液中补充酶。 这样就使DNA复制进行不了多久。 也许就因为这一点,莫里斯的第一篇关于聚合酶链式反应的论文被美国著名的《科学》(Science)杂志拒绝。 为了增加反应所能进行的循环次数,要能找到一种不怕热的DNA聚合酶多好!(www.xing528.com)

大自然的宝藏是何等的丰富! 不怕热的酶确实是有的,那就是生活在高温条件下的生物所含有的酶。 虽然地球上绝大多数生物都生活在较低的温度下,比如适合人和脊椎动物的环境温度在25℃左右(这里不说人工的温度调节如取暖和冷气,也不说动植物适应环境的特性如冬眠和落叶等),但是也有少数生物——主要是细菌,生活在海底火山温泉的热水中,这些热水的温度可以高达70℃。

只要取得这些嗜热的细菌,在人工的高温条件下培养,就可以从它们体内提取到耐热的DNA聚合酶。

莫里斯的同事赛基(R.Saiki)等人就从一种细菌“水生栖热菌(学名Thermus aquaticus)”提取了它的DNA聚合酶——他们叫它“Taq DNA聚合酶”,Taq是这种细菌的学名的缩写。 赛基等使用Taq DNA聚合酶,第一次成功地实现了一千万倍的DNA专一扩增,以赛基为第一作者的论文被《科学》杂志接受发表,至此,聚合酶链式反应(我们以后就用它的英文缩写来称呼它——PCR)这种强大的科研实验技术才算开发成功。

理论上,就是在酶、引物和四种核苷三磷酸的量都足够的时候,PCR将能以2n次方扩增DNA的量,即n次循环反应能把DNA扩增2n倍。 例如,假设进行的PCR有25个循环,那么理想情况下,DNA就能被扩增225倍即33554432倍,而且极其纯粹! 这样的扩增倍数,在起始时要扩增的DNA(“模板”)的浓度极小(例如1pg/100μl,即每100微升10-12克)的情况下,是完全可以达到的。

为了PCR技术的开发成功,希特斯公司经过该奖励谁的一番争吵以后,只发给了莫里斯1万美元奖金。 莫里斯一气之下辞职不干了。 后来希特斯公司把PCR技术卖给了“罗氏分子系统公司(Roche Molecular Systems Ltd.)”,售价竟是3亿美元! 不过,过了10年,当PCR已经完全公开、它的巨大能力得到世界科学界的公认后,莫里斯得到了诺贝尔奖

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