1. 充当miRNA海绵并调节miRNA活性
研究发现,环状RNA含有大量的MERs,可以发挥竞争性内源RNA的作用,成为竞争性内源RNA中的一位新成员。小脑变性相关蛋白1反义转录物是一种环状RNA,它是小脑变性相关蛋白1基因的环状天然反义转录物,也被称为miR-7的环状RNA海绵,含有67个与miR-7结合的位点,与miR-7结合能力比其他已知转录物高10 倍,进一步分析发现,CDR1as是一种miRNA的拮抗剂,可以充当miR-7海绵,有效影响miR-7靶基因活性。另外miR-671能够与CDR1as完全互补结合引起CDR1as降解。Hansen等指出小鼠性别特异性基因Sry环状RNA能够充当miR-138海绵,调节其表达水平。然而,生物信息学分析表明,仅少数环状RNA具有大量的miRNA结合位点,许多环状RNA仅包含少数MREs,因此,环状RNA作为海绵体抑制miRNA活性是否为一普遍现象尚存争议。环状RNAs、miRNAs与竞争性内源RNA之间如何形成调控网络保持平衡,调控机体生命活动,有待进一步深入研究与探索。
2. 调控基因表达
Li等发现EIciRNA通过与U1核内小核糖核蛋白和RNA聚合酶Ⅱ共同作用于基因转录起始位点上游300bp处,增强基因转录,反式调控基因表达。Ashwal-Fluss等发现剪接因子MBL的第二个外显子可以环化形成环状RNA,能够与pre-mRNA经典的线性剪接相互竞争,影响线性RNA的形成,从而调节相关基因的表达。环状RNA是小鼠肢体发育所必需的Fmn基因的一个重要转录本,在组织中丰度很高,敲除Fmn外显子4或5后引起环状RNA缺失,出现不完全渗透肾发育不全,环状RNA可能与小鼠的肾脏发育有关。其可能作为mRNA陷阱隔离转录起始位点,阻止mRNA翻译,导致Fmn蛋白表达异常。内含子环状RNA是RNA聚合酶Ⅱ的正向调节因子,对基因发挥顺式调节作用。(www.xing528.com)
3. 其他功能
环状RNA还能够与多种蛋白质结合,影响其活性,如与AGO蛋白结合,影响mRNA的转录翻译。环状RNA具有起始密码子或者开放阅读框,有报道体外某些重组环状RNA能够依赖内部核糖体进入位点方式翻译蛋白质,但目前尚未发现内源性环状RNA能够翻译蛋白质。
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