随着对RNA分子研究的不断深入,人们发现pre-mRNA中的外显子转录本还可被非线性地反向剪接成环状RNA。目前根据环状RNA在基因组中的来源及其构成序列不同,可将其分为外显子环状RNA、内含子环状RNA和由外显子和内含子共同构成的环状RNA。Jeck等提出外显子环状RNA形成的两种模型,即套索驱动的环化模型和内含子配对驱动的环化模型。Zhang等观察到Alu重复序列的不同配对方式,使得同一基因可以产生多种不同的环状RNA分子。环状RNA两侧内含子重复序列能够增强环状RNA的形成,但发现并非其形成的必要条件,而5’端剪接受体是环状RNA形成所必需的。Zheng等应用CRISPR/Cas9技术,去除circHIPK3侧翼Alu序列,发现下游Alu序列删除后,环化被抑制,而上游Alu删除后反倒增加了circHIPK3的生成,随后删除上游大的内含子,结果circHIPK3显著下调,表明带Alu互补重复序列的侧翼长内含子是circHIPK3生成所必需的。
Zhang等接着又发现内含子来源的环状RNA,将其命名为内含子环状RNA。该环状RNA依赖于位于pre-mRNA5’端附近富含GU的一致序列及阻止RNA分枝及降解CC富集区。Li等在研究与RNA聚合酶Ⅱ相互作用的非编码RNA时发现两个环状RNA:circEIF3J和circPAIP2外显子之间均包含内含子序列,将这类环状RNA命名为EIciRNA。Conn等发现RNA结合蛋白QKI促进环状RNA的形成;而Ivanov等则发现RNA剪接酶ADAR1能够结合在双链RNA上阻止环状RNA形成。因此,RNA结合蛋白在环状RNA形成中可能起促进或阻止作用。(www.xing528.com)
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