1.工程的单一性
（1）用途不同。如有发电、防洪、灌溉、引水、泄洪、过船、过木、过鱼等水电工程，不同用途的工程，就会有不同的工程内容和不同的实物形态。
（2）自然条件不同。水利水电工程不仅是要建筑在某一固定地点之上，而且具体位置的选择受到水资源和地形地质等自然条件制约，而各个工程地点的自然条件又不可能完全相同，如气象、地形、地质、水文、水能等自然条件的不同，就会使水工建筑物有差异。
（3）等级、标准不同。即使有用途相同的建筑物，其工程设计的等级和标准也不一定相同。如要根据工程规模和重要性确定水工建筑物的设计等级、地震烈度、洪水标准等，标准不同就会使水工建筑物在设计时产生差异。
（4）社会环境不同。各个水利水电工程项目所在地的经济和社会发展的水平，人均耕地多少，人文传统，民族习惯，有无重要文物古迹、工矿、军事设施等等不可能都一样，这就会对枢纽布置和水工建筑物的设计有影响，出现差异，特别是对拦河坝的坝型、坝高、放空能力、水库库容大小等有很大影响。(www.xing528.com)
（5）建设周期较长。水利水电工程一般规模大建设周期较长，这为每一个工程提供了在建设过程中采用新技术、新工艺、新结构、新材料、新设备的有利条件，从而更加容易产生各个工程之间的差异。
2.施工过程中的风险性
水利水电工程绝大部分工作是在露天作业，并要与洪水作斗争，因而对气候变化异常敏感。严寒、酷暑、降水都会降低劳动效率，造成洪水损失，并增加防汛、防寒、降温、混凝土温控、雨季施工等项费用。同时勘测总是只能做到钻一定数量的钻孔和挖少量探洞（井），客观上存在一定的工程地质和水文地质风险。
3.工程建设的流动性
工程建设的流动性使工程施工和建设受到当地的软硬环境的影响。特别是砂石料、土料的价格，主要取决于当地的自然资源条件，设备、钢材、水泥、木材等材料价格及供应，主要取决于当地的交通运输条件和经济发展水平。当地经济发展水平和生活水平也会影响到劳动力市场的工资及技术水平。
由于上述特点，大中型水利水电工程从来没有标准设计。从20 世纪50年代开始，水利水电工程建筑定额就是量价分开的，每一个工程的概估算都是要从该工程的基础单价开始编制而成。
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