在中世纪的欧洲，教会是社会的主导，为了宣扬教义的需要，教会充分利用音乐的作用，除发展了圣咏之外，还发明了记谱法，这些对后来音乐教育的发展起到了积极作用。但是，中世纪的音乐教育更多的是为宗教服务的机械式的教唱教学，接触到唱歌训练的人多隶属于教会的唱诗班等。直到后来这一情况才开始有所好转，中世纪出现的大学在后来成为人们自由学习知识和技能的教育机构，而音乐也成为大学中的重要课程。为响应阿方索十世于1254年颁布的大学规程，为了让学生都可以听到音乐讲座，阿方索十世在塞拉曼卡大学设立了第一个有记载的音乐讲座职位。到中世纪末，音乐在牛津大学和剑桥大学已成为独立的学科。中世纪的大学已经有了学位授予的制度，比如塞拉曼加大学授予文法学位和修辞学位；一些意大利大学也出现了授予音乐学位并颁发教学执照的记录。[36]
在文艺复兴以后，学校继续发挥着音乐教育的主要作用。大学这一新生事物的建立在文艺复兴时期确立了以培训学生为主的原则，圭多强调艺术实践方面的训练方式也被引入大学，并且在大学中盛行开来。意大利佛罗伦萨、米兰都是音乐盛行的地方，是文艺复兴时期音乐的中心，吸引了欧洲各国的音乐家，如荷兰作曲家廷克托里斯、西班牙作曲家拉密斯·达·帕莱亚到拿波里教音乐。这时期，波沦亚、帕多瓦、巴维亚等城市大学均开设了音乐系。[37]
这些变化，使许多学者在各国大学中开设了音乐课程，如当时的著名学者，身为数学家、天文学家的缪里斯曾于1320年前后在巴黎大学讲授音乐理论大课。特别是缪里斯写的五本音乐专著在法国和意大利有着广泛的影响，《思辨音乐》和其他文论就是这些讲座的讲稿。这些著作不仅在巴黎成为14世纪和15世纪时艺术、音乐理论课的基础，而且布拉格大学（1390年）、克拉科夫大学（1409年）、莱比锡大学（1410年）、埃尔富特大学（1412年）、罗斯托克大学（1419年）、维也纳大学（1431年）和英戈尔施塔特大学（1472年）等学府的学校章程也都提到它是必修的教材。学习《思辨音乐》的期限一般为一个月，布拉格、莱比锡和维也纳等地的大学要为此安排16 次大课。
布拉格大学（1367年）不仅为算术、几何、天文学而且也为音乐设立平时的（非假日）讲座教席。维也纳大学（1370年）要求必须著有音乐书和算术书才能获得学士证书。科洛涅大学（1389年）要求必须有大致由音乐和实践组成的一个月的“两部分”学习。克拉科大学（1400年）要求谋取教师职位者必须听一个月的音乐讲座。牛津大学（1431年）要求教师候选人学习为期一年的音乐。另外，有些大学的规程还明确了必“听”书目，如布拉格大学、维也纳大学以及后来的莱比锡大学规定必“听”默斯的《音乐》；牛津大学要求艺术和哲学预科生必须听授波依修斯的《音乐》。[38](www.xing528.com)
作为一门文科学科，音乐学习借助于一些大学活动得以补充，如一些学术性练习、弥撒和叙任，还有非正式的唱歌、跳舞以及器乐演奏。牛津大学和剑桥大学的一些学院曾源源不断地向唱诗班歌手提供宗教礼拜乐曲；牛津大学的昆斯学院要求礼拜堂职员熟练素歌和复调以教授唱诗班学员；新学院和万灵学院要求所有入学申请人必须娴熟音乐。在大学任教的一些理论家的作品表明，在音乐教学中也有古老科学和艺术的延续。15世纪中叶，英国的大学已规定授予音乐学位。1464年，剑桥大学的亨利·阿宾东成为第一位有记载的英国音乐学位——音乐学士学位的获得者，后来又获得了博士学位。[39]剑桥大学的学位授予很严格，要求学位申请人必须同时有理论和实践经验的证明。然而，真正的标准是到17世纪初才建立起来的。
在整个文艺复兴时期，大学中推动了音乐教学的科学性，音乐教学质量的发展突飞猛进，由此，音乐学科的系统性大大提高，欧洲近代专业音乐教育在其促进下呼之欲出。
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