生物在海洋中无处不在,但在接近大陆和海岛的周围特别稠密。浅海区是生产力最高的海洋生态系统,特别是上涌区,水流将营养物质带到表水层。主要的初级生产者有硅藻、腰鞭毛藻(甲藻)等;消费者中浮游动物为桡足类、磷虾等较大的甲壳类,还有孔虫类、放射虫类和砂壳纤毛虫等原生动物;底栖生物消费者为蛤类、海蛇尾类、多毛类、双壳类、甲壳类等。自游生物和漂浮生物为第二级和第三级消费者,如鱼类、大型甲壳动物、龟鳖类、哺乳类(鲸鱼、海豹等)和海浮鸟类等。
河口区比海洋其他区域有较高的生产力。河口生态系统的生产者利用丰富的营养物质,在全年内都能进行光合作用,主要初级生产者有海藻、海草等大型水生植物,硅藻等小型底栖植物和浮游植物;河口区一些含红色素的甲藻突然大量繁殖会形成“赤潮”,由于周期性地出现,并蔓延到沿岸水域,鱼类和其他自游生物会中毒大量死亡。河口区消费者包括地方性的半咸水动物(已适应于低盐条件下的河口湾特有种类)、海洋动物(入侵的海洋种类)和淡水动物(入侵的广盐性淡水动物)。例如,牡蛎、泥蚶和蟹等都是完全在河口湾生活的,而油蚌只是幼年期在河口区生活,几种重要的虾类的成年个体在近海生活和产卵,而幼体进入河口湾中。鲑、鳗鲡等由海水向淡水洄游,在河口湾停留时间相当长。如此多的经济鱼类依靠河口区生活,保护这些河口栖息地在经济上、生态上都具有重要意义。
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远洋区的生物群落全部由营浮游生活和底栖生活的生物组成。浮游植物以“微型浮游植物”占优势。该区上涌带常见群生硅藻,消费者为多种鱼类;而珊瑚礁以藻类和腔肠动物(如珊瑚虫)的共生关系为特征;在海水上层,蓝细菌和固氮蓝藻是重要的自养性浮游生物,动物最为丰富,有金枪鱼、飞鱼、乌贼、鲨鱼、鲸等;随着海水深度增加,生产者不能生存,消费者依靠碎屑食物和上层生物为生,多为肉食者,如在远洋海水中层有磷虾类、鱼等,在远洋底层有甲壳类、多毛类、海参类,以及宽咽鱼、深海鳗和其他多种鱼类。
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