1. 第一段最後 的“懷後來兮何處屢回顧”句，“後”的減字在版本（A）和（B）均是“中指九十勾五絃”，而版本（C）是“中指九十勾四絃”。如設二絃是C，前者是C#，後者是Bb，這句的首五個音便是：
或
要決定那一個是正確，可以參考泛音段落的最後一句[24]：
由於整個泛音段落是第一段的重複加少許變奏，兩段的最後一句應該是對應的。如果“後”字是Bb，該句的首五個音便與泛音段最後一句完全對應，音樂便更暢順。如此，版本（A）和（B）應該是錯誤，而這錯誤很有可能源自版本（X）。
2. 第三段“過金谷兮花謝委塵土”句，上文已指出，第四和五個音“名指十徽勾二絃上十”明顯是錯誤。其他學者把第四個音的按“十”改爲“十一”或“卜”，這從字型的考慮，都是有理的，前者是E，而後者是D，整句的旋律便是：
但兩句的旋律均不暢順。因此，Picken選擇第四個音爲“十一”時，亦同時把這句首三個音的減字（一絃十徽、二絃十徽、一絃十徽）全改成“十一”，旋律變成了：
如此，旋律較暢順，但較難解釋到，爲何全曲衆多十一徽按音之中，手誤集中出現於此句開始的數個。
我的選擇[25]，則是把首四個音都改爲“卜”（即“徽外”），旋律變成了：(www.xing528.com)
如此選擇的理據有二。首先，“卜”與“十”容易混淆，而全曲沒有其他位置使用“卜”，並無“爲何手誤衹在此出現”的疑問。其次，這旋律的首五個音與下一句“悲佳人兮薄命誰爲主”的首五個音形成平行五度關係：
由於此兩句的曲詞和指法都是對應的，其旋律爲平行五度便十分合理。
3. 第三段末句“妾自傷兮遲暮髮將素”的最後五個音，三版本均是：
姜夔定此曲爲“側商”調，樂曲其他的樂段均以“商”音C爲結束音，如此，第三段以B音結束便顯得不暢順。此B音的位置是六絃“六七”，按一般理解“六七”是“六徽四”，是B音。但是，如果把“六七”理解爲“六徽二”，此音便是C，旋律便較合理：
另外，未使用徽分的琴譜，“六徽二”亦可以記錄爲“六下”。由於“七”與“下”的字型相似，“六七”亦可能是“六下”的手誤。再參考第一段末句“懷後來兮何處屢回顧”的最後五個音：
兩段的結束音的指法是對應的，如把第三段的結束音改爲C後，旋律對應得更好。除了我之外，一些其他學者亦作如此改動，不過，其他學者把第三段結束音改爲C之餘，亦把該句“暮”字的B音 （也是六絃“六七”）改爲C，Picken 更把第一段末句“處”字的B音改爲C。
我認爲，這兩個B音都不應該改動。首先，三個版本此兩處的減字均顯示B音。其次，第三段的結束旋律暢順，第一段C、B、降B三音相連，驟耳聽起來雖然有點怪異，但符合此曲“側商”使用半音的理解[26]。
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