成土母质主要为第四纪沉积物，主要成因为冲积、洪积、湖积、风积、冰水积等堆积类型。该区域的成土母质大部分是更新世末期沉积的黄土状亚砂土（Q3），沉积土层深厚。区内土壤具有明显的过渡性，由东南向西北，土壤为由黑土→淡黑钙土→风沙土、碱土过渡[50]。
土壤类型的过渡可分为如下几个地段：哈达山—套浩太段北侧为古河道，地面物质属冲积物，质地较重；南侧为冰水堆积，套浩太—后八方段主要为砂性黄土沉积物，第四纪上更新统黄土与湖相沉积物相间分布于各泡沼洼地周围，质地较黏，为中壤或砂壤质，含碳酸钙较多。月亮泡—于家亮子段为黄土沉积物，质地大多为中壤。于家亮子—苏公坨段为霍林河冲、洪积物，质地多为黏壤质，含碳酸钙及可溶性盐分。苏公坨—双辽段土壤质地较轻，一般为砂壤质及砂质，以中细砂、粉细砂为主。
本次主要研究湖泊的土壤特点如下。
查干湖及周边土壤以黑钙土和盐碱草甸土为主，黑钙土主要种植农作物，盐碱草甸土多为盐碱化草场[48]。黑钙土和盐碱草甸土具体分布为：
（1）淡黑钙土：主要分布于查干湖湿地保护区东部浅岗高平地上，腐殖质层约为20～40cm。
（2）草甸淡黑钙土：主要分布于查干湖湿地保护区岗地边缘区域，地表平坦，腐殖质层约为30～40cm。
（3）盐化草甸淡黑钙土：主要分布于查干湖湿地保护区西部岗坡脚盐渍土边缘地带，地表平坦，腐殖质层约为30～40cm。
（4）草甸土：主要分布于查干湖湿地保护区，为低平区域，与盐化草甸土、盐土、碱土呈复区分布。该类型土壤腐殖质层厚度约为20～40cm，有机质含量在约为2%～3%。(www.xing528.com)
（5）盐化草甸土：主要分布于查干湖湿地保护区低平处，与草甸土、盐土、碱土呈复区分布。该土壤类型主要特点是土壤可溶盐含量较高，盐分类型以氯化物苏打为主。
（6）盐化潜育草甸土：主要分布于查干湖湿地保护区低洼处。该类型土壤腐植质层厚度约为30～60cm，有机质含量在约为2%～5%；该土壤类型主要特点是土壤可溶盐含量较高，盐分类型以氯化物苏打为主。
（7）盐土：主要分布于查干湖湿地保护区平坦地势微凹地形，与碱土、草甸土及不同程度盐化草甸土呈复区分布。地表呈白色或灰白色，积盐季节有大量盐分累积地表形成盐结皮。该土壤类型主要特点是土壤可溶盐含量大于0.7%，盐分类型以氯化物苏打为主，伴有较重的碱化，土壤呈分散状态，通透性差，土壤理化形状较为恶劣。
（8）碱土：碱土与盐土、草甸土、盐化草甸土交错斑块状分布，主要分布在盐渍土区局部略高处和凹平地边缘，该土壤类型主要特点是土壤可溶盐含量并不高，土壤碱化度高，一般在45%以上，土壤质地较重。
大布苏泡土壤主要为盐碱土、草甸土、沼泽土、风沙土和黑钙土。
向海土壤主要为栗钙土、盐碱土、草甸土和风积沙土。沼泽区土壤主要为沼泽土和盐化草甸沼泽土。
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