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实验试剂:EMSA检测试剂盒及底物平衡缓冲液的使用方法

时间:2023-11-02 理论教育 版权反馈
【摘要】:4×洗涤液EMSA检测试剂盒提供,4℃保存,使用时用MilliQ水4倍体积稀释。底物平衡缓冲液EMSA检测试剂盒提供,4℃保存。

实验试剂:EMSA检测试剂盒及底物平衡缓冲液的使用方法

1.原核生物中进行外源蛋白诱导,外源蛋白提取、纯化和浓缩所用试剂

(1)LB液体培养基(低盐)蛋白胨 10g,酵母粉5g,NaCl 5g,用蒸馏水溶解后,调pH至7.3,定容至1000mL,室温保存。

(2)1mol/L IPTG(异丙基硫代-D-半乳糖苷)IPTG 2.383g,用蒸馏水溶解后,定容到10mL,用0.22μm滤膜过滤除菌,分装于1.5mL离心管中,-20℃冻存。

(3)1×PBS(pH 7.4)NaCl 8.2g,KCl 0.2g,Na2HPO40.24g,用蒸馏水溶解后,定容到1000mL,室温保存。

(4)缓冲液I NaH2PO4·2H2O 1.48g,Na2HPO4·12H2O 14.5g,NaCl 29.3g,用蒸馏水溶解后,调pH至7.4,定容至1000mL,室温保存。

(5)缓冲液II NaH2PO4·2H2O 0.74g,Na2HPO4·12H2O 7.25g,NaCl 14.7g,咪唑17g,用蒸馏水溶解后,调pH至7.4,定容至500mL,室温保存。

(6)Triton X-100室温保存。

(7)缓冲液2咪唑浓度20mmol/L,96mL缓冲液I加4mL缓冲液II,充分混匀,室温保存。

(8)缓冲液3咪唑浓度50mmol/L,90mL缓冲液I加10mL缓冲液II,充分混匀,室温保存。

(9)缓冲液4咪唑浓度100mmol/L,80mL缓冲液I加20mL缓冲液II,充分混匀,室温保存。

(10)缓冲液5咪唑浓度200mmol/L,60mL缓冲液I加40mL缓冲液II,充分混匀,室温保存。

(11)缓冲液6咪唑浓度300mmol/L,40mL缓冲液I加60mL缓冲液II,充分混匀,室温保存。

(12)缓冲液7咪唑浓度400mmol/L,20mL缓冲液I加80mL缓冲液II,充分混匀,室温保存。

(13)4mol/L NaCl NaCl 23.4g,用蒸馏水溶解后,定容至100mL,室温保存。

(14)超滤缓冲液母液1——0.2mol/L Gly(甘氨酸):1.54g Gly,用蒸馏水溶解后,定容至100mL,4℃保存;母液2——0.2mol/L NaOH:取0.8g NaOH,用蒸馏水溶解后,定容至100mL,4℃保存。取50mL母液1加6mL母液2,调pH至8.8,用蒸馏水定容至200mL,4℃保存。

(15)5μg/μL溶菌酶 从 100μg/μL的储存液取50μL,用MilliQ水定容到 1mL,4℃保存。

2.SDS-PAGE蛋白检测所用试剂(适用于分子质量在10ku以上的蛋白分子)

(1)30%丙烯酰胺(质量体积分数)Acr(丙烯酰胺)29.2g,Bis(亚甲基双丙烯酰胺)0.8g,用蒸馏水溶解后,定容至100mL,过滤,4℃保存。

(2)10% SDS(十二烷基磺酸钠)10g SDS用蒸馏水溶解后,定容至100mL,过滤,室温备用。

(3)1.5mol/L Tris-HCl(pH 8.8)Tris(三羟甲基氨基甲烷)18.2g,用蒸馏水溶解后,调pH值至8.8,定容至100mL,4℃保存。

(4)1mol/L Tris-HCl(pH 6.8)Tris 121.1g,用蒸馏水溶解后,调pH至6.8,定容至100mL,4℃保存。

(5)10% AP(过硫酸铵)AP 0.1g,用蒸馏水溶解后,定容至1mL,4℃保存,但时间不宜超过一周。

(6)TEMED(四甲基乙二胺)Bio-Rad公司(美国)产品,4℃保存。

(7)1mol/L DTT(二硫苏糖醇)DTT 0.154g,用蒸馏水溶解后,定容至 1mL,-20℃冻存。(www.xing528.com)

(8)2×SDS-PAGE上样缓冲液 1mol/L Tris-HCl(pH 6.8)5mL,1mol/L DTT 0.1mL,SDS 2g,溴酚蓝0.1g,甘油 10mL,用蒸馏水溶解后,定容至50mL,分装于1.5mL离心管中,4℃保存,使用时按等体积加入。

(9)1×SDS-PAGE电极缓冲液(pH 8.3)Tris 3.0g,Gly 14.4g,SDS 1g,用蒸馏水溶解后,定容至1000mL,室温保存。

(10)脱色液 无水乙醇100mL,HAc(乙酸)100mL,用蒸馏水溶解后,定容至1000mL,室温保存。

(11)考马斯亮蓝R-250染色液 考马斯亮蓝R2505g在500mL脱色液中溶解,过滤,用棕色瓶在室温保存。

3.EMSA检测所用试剂

(1)5×TBE Tris 54g,硼酸 27.5g,EDTA 2.93g,用蒸馏水溶解后,调pH至8.0,定容至1000mL,室温保存。

(2)0.5×TBE取5×TBE 100mL,用蒸馏水稀释至1000mL,室温保存。

(3)Gly-NaOH缓冲液 即超滤Buffer。

(4)1mol/L KCl-20℃冻存。

(5)0.1mol/L DTT取1mol/L DTT 0.1mL,用蒸馏水稀释至1mL,-20℃冻存。

(6)0.1% BSA(牛血清白蛋白)-20℃冻存。

(7)5μg/μL BSA取BSA 5mg,用蒸馏水溶解后,定容至1mL,分装在1.5mL离心管中,-20℃冻存。

(8)5×上样缓冲液EMSA检测试剂盒提供,4℃保存。

(9)封闭液EMSA检测试剂盒提供,4℃保存。

(10)4×洗涤液EMSA检测试剂盒提供,4℃保存,使用时用MilliQ水4倍体积稀释。

(11)底物平衡缓冲液EMSA检测试剂盒提供,4℃保存。

(12)稳定过氧化氢溶液EMSA检测试剂盒提供,4℃保存。

(13)鲁米诺/增强溶液EMSA检测试剂盒提供,4℃保存。

(14)显影液 使用上海冠龙照相器材公司的D76显影粉,将小袋内药粉溶解于约50℃的750mL蒸馏水中,搅动至完全溶解之后,再将大袋内药粉倒入,继续搅动使之完全溶解,加水定容至1000mL,避光,于棕色瓶中室温保存。

(15)定影液 使用上海冠龙照相器材公司的酸性定影粉,准备20℃左右的800mL蒸馏水,将药粉缓缓倒入,搅拌使之完全溶解,加水定容至1000mL,避光,于棕色瓶中室温保存。

4.部分需购买试剂

pET-32a(+)载体(Novagen),溶菌酶(BBI),Ni-NTA SefinoseTM6快流速凝胶柱(BBI),咪唑(BBI),超滤管(Millipore),生物素标记探针合成(SBS),Light-Shift化学发光EMSA试剂盒(Pierce)。

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