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丝状真菌基因组DNA制备实验

时间:2023-11-02 理论教育 版权反馈
【摘要】:去上清,以70%乙醇洗涤沉淀两次,真空干燥后用适量TE缓冲液完全溶解。取上清,加入0.6倍体积异丙醇,混匀,-20℃放置20min,12000r/min离心10min。以含50μg/mL RNase的超纯水完全溶解沉淀,37℃温育1h,-20℃保存备用。

丝状真菌基因组DNA制备实验

1.丝状真菌基因组的大量提取

(1)以每克经过滤抽干的菌丝体加4mL CTAB抽提液(2% CTAB;100mmol/L Tris-HCl,pH 8.0;20mmol/L EDTA,pH 8.0;1.4mol/L NaCl),加入2-巯基乙醇(2-

ME)至终浓度为2%(体积分数)。

(2)菌丝体加入液氮冷冻,研磨至细小粉末状。把粉末加入到预热的2-ME/CTAB抽提液中,涡旋混匀,65℃保温45~60min,不时颠倒混匀。

(3)加入等体积苯酚氯仿∶异戊醇溶液,颠倒混匀,12000r/min离心20min。

(4)取上层水相至另一离心管中,加入0.5~0.6倍体积冰冷的异丙醇,颠倒混匀,4℃放置20min,12000r/min离心10min。

(5)去上清,以70%乙醇洗涤沉淀两次,真空干燥后用适量TE缓冲液完全溶解。

(6)加入等体积冰预冷的5mol/L LiCl,混匀,12000r/min离心10min。

(7)转上清至另一新离心管中,加0.5~0.6倍体积冰冷的异丙醇,混匀,-20℃放置20min,12000r/min离心10min。(www.xing528.com)

(8)70%乙醇洗涤沉淀,真空干燥。

(9)以含50μg/mL RNase的超纯水完全溶解沉淀,37℃温育1h,-20℃保存备用。

2.丝状真菌基因组的小量提取

(1)约0.1g的菌丝体置于1.5mL的离心管中,加入300μL的提取缓冲液(100mmol/L Tris-HCl,pH 8.0;100mmol/L EDTA;250mmol/L NaCl;1% SDS),用带塑料钻头的手持式电钻进行研磨约30s。

(2)加入等体积氯仿∶异戊醇(24∶1)抽提,12000r/min离心15min。

(3)取上清,加入0.6倍体积异丙醇,混匀,-20℃放置20min,12000r/min离心10min。

(4)70%乙醇洗涤沉淀,真空干燥。

(5)以含50μg/mL RNase的超纯水完全溶解沉淀,37℃温育1h,-20℃保存备用。

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