1.实验材料
2.实验设备
移液器,冷冻高速离心机,台式高速离心机,水浴锅,陶瓷研钵,50mL离心管(有盖)及5mL和1.5mL离心管,弯成钩状的小玻璃棒。
3.实验试剂
(1)提取缓冲液Ⅰ 100mmol/L Tris-HCl(pH 8.0),20mmol/L EDTA,500mmol/L NaCl,1.5%SDS。
(2)提取缓冲液Ⅱ 18.6g葡萄糖,6.9g二乙基二硫代碳酸钠,6.0g PVP(聚乙烯吡咯烷酮),240μL巯基乙醇,加水至300mL。
(3)氯仿∶戊醇∶乙醇(80∶4∶16)。
(4)RNase A母液 10μg/μL。
(5)其他试剂液氮,异丙醇,TE缓冲液,无水乙醇,70%乙醇,3mol/L NaAc。
4.操作步骤
(1)水稻幼苗或其他禾本科植物基因组DNA提取。
①在50mL离心管中加入20mL提取缓冲液Ⅰ,60℃水浴预热。
②水稻幼苗或叶子5~10g,剪碎,在研钵中加液氮磨成粉状后立即倒入预热的离心管中,剧烈摇动混匀,60℃水浴保温30~60min,不时摇动。
③加入20mL氯仿∶戊醇∶乙醇溶液,颠倒混匀(需戴手套,防止损伤皮肤),室温下静置5~10min,使水相和有机相分层。
④室温下5000r/min离心5min。
⑤仔细移取上清至另一50mL离心管,加入1倍体积的异丙醇,混匀,室温下放置片刻即出现絮状DNA沉淀。(www.xing528.com)
⑥在1.5mL EP管中加入1mL TE。用钩状玻璃棒捞出DNA絮团,在干净吸水纸上吸干,转入含TE的离心管中,DNA很快溶解于TE。
⑦如DNA不形成絮状沉淀,则可用5000r/min离心5min,再将沉淀移入TE管中。这样收集的沉淀,往往难溶解于TE,可在60℃水浴放置15min以上,以帮助溶解。
⑧将DNA溶液3000r/min离心5min,上清倒入干净的5mL离心管。
⑨加入5μL RNase A(10μg/μL),37℃ 10min,除去RNA(若RNA对DNA的操作、分析无影响,可省略该步骤)。
⑩加入1/10体积的3mol/L NaAc及2倍体积的冰乙醇,混匀,-20℃放置20min左右,DNA形成絮状沉淀。
⑪用玻璃棒捞出DNA沉淀,70%乙醇漂洗,再在干净吸水纸上吸干。
⑫将DNA重溶解于1mL TE,-20℃ 贮存。
⑬取2μL DNA样品在0.7%琼脂糖胶上电泳,检测DNA的分子大小。同时取15μL稀释20倍,测定OD260/OD280,检测DNA含量及质量。
(2)从李(苹果)叶子提取基因组DNA。
①取3~5g嫩叶,液氮磨成粉状。
②加入提取缓冲液Ⅱ 10mL,再研磨至溶浆状。10000r/min离心10min。
③去上清,沉淀加提取缓冲液Ⅰ20mL,混匀。65℃水浴30~60min,常摇动。
④同本节(1)中步骤③~⑬操作。
5.注意事项
5g样品可保证获得500μg DNA,足供RFLP、PCR等分析之用。
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