达尔文写《物种起源》这本大书，花了20多年的时间。书中那么多内容，先讲什么，后讲什么，其中的学问可大着呢！全书可以分成三个部分，每一部分达尔文想要达到一项目标。150多年来的实践证明，他对全书的精心布局，收到 了很好的效果。
直截了当的开头
《物种起源》第一部分包括开头四章。达尔文从人工选择与自然选择的比较入手，阐明了生存斗争是自然选择的推手。 自然选择解释了为什么说地球上的生物不是造物主特地一一地创造出来，而是通过逐渐地演变而来的，解释了为什么说所有生物都有着共同的祖先，地球上的生物多样性，是亿万年生物演化的结果。
别出心裁的过渡
按理说，接下来达尔文应该介绍支持自然选择学说的大量证据。可是他觉得如果读者对他的理论过于怀疑的话，也许根本就不会耐心读下去。他在第二部分（即我们现在要复习的中间四章），把批评者可能提出的疑问作为难点提出来，加以解释，吸引读者往下读。
化解难点
●第五章化解跟变异有关的疑问：达尔文通过实际经验说明，无论变异的原因是什么，只要对生物有利，经自然选择逐渐累积，引起构造的重要变异，生物才能互相竞争，适者生存。(www.xing528.com)
●第六章化解对过渡类型缺失以及像眼睛这类极度完善器官演化的疑问：对过渡类型缺失，达尔文认为，由于只有少数过渡类型会侥幸保存为化石，地质记录又很不完整，这些化石目前还没有被发现。在后面第九、第十两章里，他将用地质学的证据来进一步化解这一疑问。至于眼睛，在完善及复杂的眼睛与非常不完善的简单眼睛之间，也有无数过渡阶段，每一阶段对生物本身都曾是有用的，因此，完善而复杂的眼睛也是通过自然选择形成的。
●第七章用了鸠占鹊巢、蚁类蓄奴、蜜蜂筑巢的例子，说明这些本能都不是天赋或特创的，而是自然选择的结果。
●第八章用实例说明变种与物种之间 、混种与杂种之间、能育性与不育性之间，都是逐渐过渡、通过自然选择的，杂交不育性绝 不是天赋。
下一章开始进入第三部分——证据。
【注释】
[1]杂交不育性是指不同物种之间杂交之后，不会生育后代。即使在极少数情况下（像马和驴杂交）会生育出后代（如 骡子），但其后代（即骡子）绝不会再生育。
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