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BATMAN数据库介绍

时间:2023-10-30 理论教育 版权反馈
【摘要】:图3-49(一)Example 1使用办法Example 1用于查询药方有关化合物及其靶向基因。例:点击 “Example 1”输入药方拼音(全大写),注意这里只可以分析公认的药方名称,如六味地黄汤;下拉点击 “start”;等待分析完毕,出现分析结果。图3-53我们可根据研究的中药项目使用BATMAN进行分析及构建网络图谱。如需要了解三七的信息,就输入“SAN QI”进行检索。下载的数据可用于药物网络调控分析,疾病治疗药物的预测。其方法类似Example 1分析办法,不再赘述。

BATMAN数据库介绍

数据库网址:bionet.ncpsb.org/batman-tcm/

指南:bionet.ncpsb.org/batman-tcm/index.php/Home/document/index

BATMAN是第一个专门用于研究中医分子机制的在线生物信息学分析工具,它主要用于中药成分的目标预测和潜在目标的网络药理学分析,旨在帮助人们理解多组分靶向和多途径中医的组合治疗机制,为实验验证提供线索。

图3-49

(一)Example 1使用办法

Example 1用于查询药方有关化合物及其靶向基因。

例:点击 “Example 1”输入药方拼音(全大写),注意这里只可以分析公认的药方名称,如六味地黄汤(LIU WEI DI HUANG TANG);下拉点击 “start”;等待分析完毕,出现分析结果。

图3-50

Result 1:Target Prediction Result显示的是预测到的化合物和基因。

图3-51

Result 2:Bioinformatics analyses of potential targets显示的是对这些基因进行的通路、疾病和GO功能注释。(www.xing528.com)

图3-52

Result 3:Network visualization显示的是建立的网络关系。

图3-53

我们可根据研究的中药项目使用BATMAN进行分析及构建网络图谱。

(二)Example 2使用方法

选择 “Example 2”,输入单种药材大写全拼音。如需要了解三七的信息,就输入“SAN QI”进行检索。

图3-54

重复Example 1的分析步骤出现此页面(图3-55)。

图3-55

点击 “Download all the target prediction results”可下载数据压缩包,也可以直接在下方查看有关信息。下载的数据可用于药物网络调控分析,疾病治疗药物的预测。其方法类似Example 1分析办法,不再赘述。

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