文献信息数据库是文献信息检索系统的基础，在进行医学类科研文献信息检索时，外文文献检索优先选择Medline（PubMed）、EMBASES，中文文献信息则优先选择中国生物医学文献数据库（CBM）、CNKI。另外，需要注意利用网络学术搜索引擎（Google Scholar、Scirus、百度学术）及OA期刊获得尽可能全面的信息。还需要注意利用网络检索策略的构建，检索方法的选择和检索技巧的掌握在以查全和查新为目的的检索过程中起着关键性的作用。通过对检索策略的反复调整而达到满意的检索效果。
现阶段目标为通过对检索到的相关文献信息进行整理、分析和综合，以确定所选课题是否具有立项价值。因此该阶段检索目标为查全，在文献检索过程中应当遵循以下原则。
（一）使用主题词检索
有主题词的数据库应尽量采用主题词检索途径（MeSH Database）。《医学主题词表》（Medical Subject Headings，简称MeSH）是美国国立医学图书馆（NLM）编制的用于标引和检索生物医学文献的权威性英文主题词表。《医学主题词表》由两大部分构成：第一部分是按主题词字顺排列的 “字顺表”（Alphabetical List）；第二部分是 “树状结构表”（Tree Structures），又称 “范畴表”。MeSH汇集约18000多个医学主题词，它在文献检索过程中准确揭示文献内容的主题，对文献主题进行分析，从自然语言转换成规范检索语言。
NLM提供四种方式联机免费获取其电子版及相关信息：①MeSH Browser；②UMLS（Unified MedicalLanguageSystem）一体化医学语言系统；③MeSH网站（http：/www.nim.nih.gov/mesh），包括MeSH的全部内容及MeSH相关信息；④MeSH数据库，为用户检索MEDLINE PubMed提供帮助。
（二）非主题词数据库检索时，充分考虑同类词
同类词包括同义词、近义词、缩略词、相关词等。在使用关键词或自由词的数据库检索时，以提供的关键词为参考，选用同义词、近义词等以逻辑方式加入检索式中。使用同义词检索的目的是尽量全面地把不同作者用不同词汇撰写的文献都检索出来，确保没有遗漏，提高检索结果的全面性，提高查全率。
（三）扩展检索
扩展检索的基本原理是系统基于词表，半自动或自动地对多个检索词执行逻辑 “OR”运算。基于词表的扩展检索主要有下位词扩展和同义词扩展检索功能。下位词（hyponym）是指在概念上范围更窄的主题词。以 “皮牵引在骨折患者治疗中的应用研究”为例，检索词 “骨折”是一个很宽泛的概念，它的下位词还包括 “股骨骨折”“下肢骨骨折”“肋骨骨折”“胸椎骨骨折”“锁骨骨折”“骨盆骨折”等等。检索过程中应该将这些下位词分别与 “皮牵引”进行组配检索，然后再将结果进行 “或”运算。当主题词是一个非常宽泛的概念时，应该选择比较具体和规范的下位词作为检索词，以利于文献的查全、查准。
在扩展检索时还可以减少AND连接的概念，或用OR增加同义词或相关词、增加回溯检索年限和删除一些非关键的检索词等方法以扩大检索范围。如中国知网包含1994年至今90%以上的中文印刷本期刊，在检索文献较少时，可以增加回溯检索年限。
（四）尽量不使用虚词作为检索词
检索时应尽量不使用无实质意义的概念和重复概念。检索中常遇到的检索意义不大且比较泛指的概念有展望、发展趋势、现状、近况、应用、作用、利用、用途、方法、影响、制备、干预、评价、预防、评估等。若检索时涉及虚词，则应将其尽可能全地进行“或”运算，以免漏检。
（五）跨库检索(www.xing528.com)
每个数据库的收录范围都有一定的局限性，检索者需尽可能在多个数据库中检索，以提高查全率。一个课题多个数据库检索时，可以遵循以下原则：先中文，后外文；先专业，后综合；先文摘，后全文。在使用中文医学文献检索数据库时，可在 “中国知网”“维普信息资源系统”“万方数据知识服务平台”等数据库分别检索课题，并进行去重综合。而要了解国外的研究水平时，还应该选择外文数据库，如PubMed、Ovid数据库和Embase等。在对以 “艾滋病”为主题的相关课题进行检索时，可以先检索艾滋病文献数据库（AIDSLINE），再检索PubMed等数据库。在检索 “癌症”为主题的相关文献时可以先检索癌症文献数据库（CANCERLIT）。在检索遗传病相关文献时，可以优先检索在线人类孟德尔遗传数据库（Online Mendelian Inheritancein Man，OMIM）。OMIM（https：//www.omim.org/），是在美国John Hopkins大学医学院Victor A.McKusick教授编撰的 《人类孟德尔遗传》一书的基础上发展起来的在线数据库，其内容包括所有已知的遗传病、遗传决定的性状及其基因，除了简略描述各种疾病的临床特征、诊断、鉴别诊断、治疗与预防外等文本资料外，还提供已知有关疾病相关基因的连锁关系、染色体定位、组成结构和功能、动物模型，并附有其相关的图片、研究历史和参考文献。
OMIM不仅是人类基因和遗传疾病的数据库，更是不断更新的知识库，其内容几乎每天更新，通过它研究者可获知最新人类基因定位的信息，并且OMIM在其专业性的基础上确保其准确性和权威性。OMIM在其遗传病领域更具有全面性，它是从200多种杂志发表的论文和专著中积累资料，并增加新内容，删除旧条目编辑而成。从OMIM中不仅可获取单基因病方面的资料，而且可获取染色体病、多基因病、线粒体病方面的资料；不仅列出了导致特定疾病的基因，不少条目还列出了致病基因的等位变异体（allelic variants）。通过记录间的链接还可以查询Medline、GenBank等数据库。OMIM中的文献经过专家的精选，文献量远少于PubMed，可使科研人员从浩瀚的文献中解脱出来，快速掌握某种疾病的遗传知识。如经PubMed检索，1998年至2008年有关Marfan syndrome（马方综合征）的文献有1684篇，而通过检索OMIM，检出80条记录，其中#154700（MARFAN SYNDROME），列出了132篇重要的参考文献，通过阅读这些文献，对马方综合征从基础到临床就有了全面的了解。因此在研究遗传病领域时，遵循先专业后综合的原则时可以先检索OMIM，再检索其他更具有综合性的数据库。
常用预防医学网站有：
1.世界卫生组织（World Health Organization，WHO）（http：//www.who.int）网站主页有新闻和重大事件等的报道，网页大体由三个主要区域组成：卫生主题（Health Topics）、国家（Countries）和 WHO Sites。
2.美国预防医学会（American College of Preventive Medicine，ACPM），旨在预防疾病和提高人类健康水平，从事预防医学的研究、实践和教育工作，是一个全国性的专业学会。
3.美国疾病控制与预防中心（Centers for DiseaseControl and Prevention，CDC）（http：//www.cdc.gov）是美国卫生和人类服务部下属的公共卫生服务机构之一，主要栏目有新闻（In the News）、出版物、软件及其他产品、卫生主题、旅游卫生、数据与统计等。
4.泛美卫生组织（Pan Hmerican Heath Drganization，PAHO）（http：//www.paho.org）是一个有着100多年历史的公共卫生国际机构，旨在提高美洲地区人们的健康和生活水平，侧重于预防医学和卫生学的内容。
常用临床医学网站：
1.神经外科在线（Neurosurgery：//On-call）（http：//www.neurosurgery.org/index.asp）是由American Association of Neurological Surgeons和Congress of Neurological Surgeons共同建立的一个官方网站，为患者、医生、卫生保健人员和普通人士提供关于神经外科信息资源的在线服务。
2.美国传染病学会（Infectious Disease Society of America，IDSA）（http：//www.idsociety.org）专为IDSA会员提供关于快速诊断、生物恐怖和医学失误方面的特殊会议和医学继续教育；在线阅读有The Jjournal of Infectious Disease（JID）和Clinical Infectious Disease（CID）两个期刊。
3.Josline糖尿病中心（Josline Diabetes Center）（http：//josline.harvard.edu/main.shtml）是一个国际性的糖尿病治疗、研究和教育机构。在糖尿病治疗方面的重要进步包括妊娠期糖尿病的治疗、应用激光外科治疗糖尿病眼病，以及糖尿病早期的诊断。
4.美国心脏协会（American Heart Association，AHA）（http：//americanheart.org/）是美国全国性的非政府机构，是历史悠久的国际上有较大影响的心血管学术团体，其宗旨是降低心血管疾病的致残率和死亡率。该网站提供了丰富的科研、医疗、教学资源和信息。
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