1998年6月12～27日，受暴雨影响，鄱阳湖水系暴发洪水，抚河、信江、昌江水位先后超过历史最高水位；洞庭湖水系的资水、沅江和湘江也发生了洪水。两湖洪水汇入长江，致使长江中下游干流监利以下水位迅速上涨，从6月24日起相继超过警戒水位。期间由于暴雨频降，到8月16日，宜昌出现第六次洪峰，流量63300立方米／秒，为1998年的最大洪峰。这次洪峰在向中下游推进过程中，与清江、洞庭湖以及汉江的洪水遭遇，中游各水文站于8月中旬相继达到最高水位。之后又有第七次、第八次洪峰出现。
同年入汛之后，松花江上游嫩江流域降水量明显偏多，先后发生三次大洪水。其中第三次洪水发生在8月上中旬，为嫩江全流域型大洪水。支流诺敏河古城子水文站、雅鲁河碾子山水文站、洮儿河洮南水文站水位均超过历史记录，洪水重现期为100～1000年。在嫩江堤防6处漫堤决口的情况下，齐齐哈尔、江桥、大赉站的洪峰流量都超过了1932年。
此外，同年6月份，珠江流域的西江发生了百年一遇的大洪水。西江支流桂江上游桂林水文站6月份连续出现4次洪峰，最高水位达147．70米，为历史实测最高值。受上游干支流来水和区间降雨的共同影响，西江干流梧州最大流量52900立方米／秒，水位26．51米，为20世纪第二位大洪水。6月中下旬，福建闽江支流建溪、富屯溪流域出现持续性暴雨，致使闽江干流发生大洪水。闽江干流水口电站最大入库流量37000立方米／秒，洪水经水库调蓄后，干流竹岐水文站最高水位16．95米，最大流量33800立方米／秒，为20世纪最大洪水，洪水重现期约为100年。(www.xing528.com)
1998年洪水大、影响范围广、持续时间长，洪涝灾害严重。全国共有29个省（自治区、直辖市）遭受了不同程度的洪涝灾害。据各省统计，农田受灾面积2229万公顷（3．34亿亩），成灾面积1378万公顷（2．07亿亩），死亡4150人，倒塌房屋685万间，直接经济损失2551亿元。江西、湖南、湖北、黑龙江、内蒙古、吉林等省（区）受灾最重。
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