【摘要】：50mL 10 g/L变性琼脂糖凝胶：10倍电泳缓冲液5mL，琼脂糖0.5 g，0.1%DEPC水36.5mL，加热溶化，稍冷却，加入8.5mL 37%甲醛。
1.制备凝胶（1.0%）
称取0.30 g琼脂糖，加30mL×TAE电泳缓冲液，微波炉加热熔化，注意观察，勿使沸腾的琼脂糖溢出容器外。稍冷却后加入适量荧光染料混匀，倒入制胶托盘内，插好样品梳，水平放置，待琼脂糖溶液凝固。
2.准备样品
将制备的RNA样品定量，依据RNA溶液的浓度，取适量的RNA（如3μL）并用水补充至一定体积（如10μL），然后加入6倍上样缓冲液（如2μL），混匀，放置在冰上待用。
3.上样
将载有琼脂糖凝胶的制胶托盘放置于电泳槽内，加入电泳缓冲液浸过凝胶上表层，然后将样品点入上样孔。以60～80 V的电压电泳约30min。如条件允许应进行电泳缓冲液循环，否则，在一定时间（如10min）将两极附近的缓冲液调换混匀，以防止一侧过热而出现RNA降解。待溴酚蓝迁移至凝胶长度的2/3～4/5处结束电泳。
4.在凝胶成像系统观察并分析(www.xing528.com)
RNA的变性琼脂糖凝胶电泳与DNA的操作相同。使用的主要试剂如下。
（1）0.1%DEPC水：200mL双蒸去离子水加0.2mLDEPC（焦碳酸二乙酯），充分搅拌混匀，室温放置过夜，高压灭菌。
（2）10倍电泳缓冲液：吗啉代丙烷磺酸（MOPS）0.4mol/L（pH值为7.0），NaAc 0.1 mol/L，乙二胺四乙酸（EDTA）10mmol/L。
（3）50mL 10 g/L变性琼脂糖凝胶：10倍电泳缓冲液5mL，琼脂糖0.5 g，0.1%DEPC水36.5mL，加热溶化，稍冷却，加入8.5mL 37%甲醛。
（4）上样缓冲液：50%甘油，1mmol/LEDTA，4 g/L溴酚蓝，40 g/L二甲苯蓝。
（5）去离子甲酰胺。
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