在重组DNA技术中,常需要一些基本工具酶进行基因操作。如对目的基因进行处理时,需利用序列特异的限制性核酸内切酶在准确的位置切割DNA,使较大的DNA分子成为一定大小的DNA片段;构建重组DNA分子时,必须在DNA连接酶催化下才能使DNA片段与克隆载体共价连接。此外,还有一些工具酶也都是重组DNA时必不可少的。
(一)限制性核酸内切酶
限制性核酸内切酶是基因工程必需的工具酶,具有特别的重要意义。所谓限制性核酸内切酶(restriction endonuclease)就是识别DNA的特异序列,并在识别位点或其周围切割双链DNA的一类内切酶。目前已知的限制性核酸内切酶有1 800余种,主要是从细菌中提取的。限制性核酸内切酶具有高度专一性,能识别的核苷酸序列通常是4~8个碱基对。限制性核酸内切酶的切口有两种类型。一种为黏性末端,即两链的切口错开2~4个碱基。因为两个末端的碱基互补配对,易于配合。常见的有5′末端突出的黏性末端和3′末端突出的黏性末端。另一种为平头末端,即在同一水平上切断DNA的双链。同一种限制性内切酶所产生的黏性末端是相同的,相同的黏性末端的碱基具有互补性,通过连接酶可把它们连接起来,因而,具有黏性末端的DNA片段容易结合进载体DNA分子中,表24-1中列举了几种最常用的限制性核酸内切酶。
表24-1 限制酶识别序列和切割方式举例
续表
注:↓表示切割位点(www.xing528.com)
(二)其他工具酶
1.DNA聚合酶 这类酶需DNA模板,也需要引物,催化5′→3′核苷酸链的延长。常用的有大肠埃希菌聚合酶I和耐热DNA聚合酶。耐热DNA聚合酶是一类从水栖耐高温菌中分离到的DNA聚合酶,具有5′→3′聚合酶活性,催化DNA合成的活性可适应相当宽的温度范围。在95℃的半衰期为35min,对聚合酶链反应(PCR)技术的发展起关键作用。
2.DNA连接酶 DNA连接酶可催化一个DNA链的5′-P末端与另一个DNA链的3′-OH末端通过磷酸二酯键而连接起来。它可催化平头末端或黏性末端的DNA链之间的连接,但连接平头末端的效率远低于后者。
3.其他 如反转录酶、多聚核苷酸激酶、碱性磷酸酶等。
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