蛋白质的生物合成包括3个阶段:氨基酸活化、肽链合成、多肽链合成后的加工修饰。此过程原核生物与真核生物不全相同,以原核生物为例介绍。
(一)氨基酸的活化
氨基酸的羧基以酯键的形式连接在tRNA的3′末端上,形成氨基酰-tRNA,即氨基酸的活化。反应在细胞质进行,由氨基酰-tRNA合成酶(下面反应式中用“酶”代表)催化,ATP供能。反应分两步进行:
反应中,ATP分解成AMP和焦磷酸并释放能量,使氨基酸的羧基活化,形成氨基酰-AMP-酶中间复合物,其中的活化氨基酰进一步转移到tRNA的3′-CCA末端腺苷酸(A)的核糖2′或3′位的游离-OH上,以酯键连接,形成氨基酰-tRNA。转运氨基酸至核糖体上,按mRNA遗传密码指导的顺序,参与肽链合成。
(二)肽链的合成
在核糖体上按mRNA密码顺序,氨基酸缩合成肽链的过程称核糖体循环(ribosome cycle)。此循环可分为起始、延伸、终止3个阶段。
1.起始阶段 起始阶段主要由核糖体大、小亚基、模板mRNA及具有启动作用的甲酰蛋氨酰-tRNA共同构成起始复合体,这一过程需要Mg2+、GTP及几种IF参与(图23-2)。mRNA分子阅读框中第一个密码子既代表起始密码子,又是甲硫氨酸密码子,但原核生物参加形成起始复合体的氨基酰-tRNA是甲酰甲硫氨酰-tRNA(fmet-tRNAfmet)。称为起始fMet-tRNAfmet。
图23-2 翻译的起始阶段
起始复合体的形成首先由IF3、小亚基、IFl和mRNA形成一个复合物,同时IF2、起始fmet-tRNAfmet和GPT也结合成一个复合物,然后上述两种复合物再组成30S起始复合物。之后,IF3脱落,IF1,2和GTP仍结合在复合物中;大亚基结合到小亚基上,形成70S起始复合体。复合体中的GTP水解为GDP和Pi脱落,同时IF1,2也释放出来。70S起始复合体含mRNA链的两个密码子,其中第1个是起始密码子AUG对应于核糖体的P位,起始fmet-tRNAfmet的反密码子恰好与之互补结合;mRNA的第2个密码子对应于核糖体的A位,以便接受相对应的氨基酰-tRNA。
2.肽链的延伸 起始复合体形成后,随即对mRNA链上的遗传信息进行连续翻译,即各种氨基酰-tRNA按mRNA的密码子顺序在核糖体上一一对号入座,由tRNA带到核糖体上的氨基酸依次以肽键相连接,直到新生肽链达到应有的长度为止。新生肽链每增长一个氨基酸单位都要经过进位、转肽和移位的过程,这一阶段需要EF、GTP、Mg2+和K+参与。
(1)进位(注册):在起始复合体中,起始fMet-tRNAfmet在核糖体的P位,A位空着,依照核糖体A位处mRNA上的第2个密码子,相应氨基酰-tRNA的反密码子与之互补结合,进入到A位。进位必需EF-T(由Tu、Ts两亚基组成)和GTP参与。当EF-T与GTP结合后,释出Ts,与氨基酰-tRNA结合成氨基酰-tRNA-Tu-GTP复合物,将氨基酰-tRNA送至核蛋白体的A位。之后Tu-GTP分解释出Pi,Tu-GDP脱下,Ts促进Tu-GDP中GDP脱落,与Tu重新结合成EF-T(Tu-Ts)。这样在第1次进位后,核蛋白体P位及A位各结合了一个氨基酰-tRNA。
(2)转肽(成肽):在大亚基中的转肽酶催化下,P位上甲酰蛋氨酰-tRNAfmet中的甲酰甲硫氨酰基转移到A位,并通过其活化的酰基与A位上氨基酰-tRNA中氨基酰的氨基结合,形成第一个肽键。这样在核糖体A位生成了二肽酰-tRNA,之后P位上空载的tRNA从核蛋白体上脱落下来。转肽过程需要Mg2+和K+。肽链的合成方向从N端→C端。
(3)移位(转位):在EF-G、GTP和Mg2+的参与下,GTP分解供能,核糖体沿mRNA由5′端向3′端移动一个密码子位置,使原先在A位上的二肽酰-tRNA移至P位,而mRNA链上的下一个密码子进入A位,以便另一个相应的氨基酰-tRNA进位。然后再进行转肽,形成三肽酰-tRNA,接着再移位。进位、转肽、移位反复进行,肽链就按mRNA密码顺序所决定的氨基酸顺序不断延长,直至出现终止密码为止(图23-3)。
图23-3 翻译的延长(www.xing528.com)
3.肽链合成的终止 当肽链合成至A位上出现终止密码(UAG、UAA或UGA)时,各种氨基酰-tRNA都不能进位,只有终止因子能够识别终止密码并与之结合。终止因子和核糖体结合后,使转肽酶活性改变为催化P位上肽酰-tRNA水解酶的作用,从而使合成的多肽链从tRNA上释放出来,这一步也需要GTP分解供能。接着,tRNA也从P位上脱落,核糖体再解聚为大、小亚基,并与mRNA分离。至此,多肽链的合成过程即告完成(图23-4)。
图23-4 翻译过程的终止
实际上,细胞内合成多肽时并不是单个核糖体,而是每分子mRNA常结合着多个核糖体。1分子mRNA上结合多个核糖体所形成的多聚体称多核糖体,多核糖体才是合成肽链的功能单位。多核糖体上核糖体的数目依mRNA的长度而定。一般多个核糖体之间相隔90多个核苷酸的距离,所以mRNA越长,结合核糖体越多。在多核糖体中,每一个核糖体上都有一条正在增长的新生肽链。距mRNA3′端越近,新生肽链越长,直到肽链完全合成为止(图23-5)。通过多核糖体的形式提高了mRNA的利用率,即提高了多肽链合成的效率。
图23-5 多核糖体
(三)多肽链合成后的加工修饰
许多新合成的多肽链还无生物活性,需经加工修饰,才能成为具有一定生物活性的完整的蛋白质分子。主要的加工修饰如下:
1.切除 多肽链N-端的甲酰甲硫氨酸可于肽链合成后或在肽链延长过程中,被肽链脱甲酰基酶和对甲硫氨酸特异的氨基肽酶作用下先后切除。
2.水解 在特异的蛋白酶作用下水解掉肽链上的某些氨基酸残基或肽段。
3.亚基聚合 由两条或两条以上肽链构成的蛋白质(如血红蛋白),亚基与亚基之间通过非共价聚合成四级结构。
4.连接辅基(辅酶) 结合蛋白质的酶蛋白部分一定要与相应的辅基(辅酶)结合后才有生物学功能。
5.修饰 氨基酸残基侧链基团经磷酸化、羟基化或甲基化等反应对肽链进行化学修饰。如胶原蛋白中某些脯氨酸和赖氨酸经羟化生成羟脯氨酸和羟赖氨酸,才能进而成熟为胶原纤维。
6.二硫键的形成 多肽链内部或多肽链间所形成的二硫键,是多肽链中空间位置相近的半胱氨酸残基的巯基氧化而形成的,二硫键的形成对维持蛋白质空间结构起着重要作用。
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