引导扇区即是分区的第一个扇区，这个扇区对文件卷来说至关重要，因为所有与文件系统有关的信息，都存储在这个扇区上，FAT32也不例外。FAT32文件系统驱动程序在试图分析一个分区是不是FAT32文件卷的时候，首先读取这个扇区，然后根据这个扇区内的数据做进一步判断。需要注意的是，这个引导扇区并不一定是真正的引导扇区，因为里面可能没有引导代码。如果对应的分区不是活动分区，则是否存在引导代码，对系统来说是不重要的。但是文件系统相关的信息一定要存在，否则文件系统驱动程序将无法识别这个分区。
引导扇区一般为512B，其中对文件系统有用的数据，是从偏移0x0B（即十进制的11）开始的。从0x0B开始的53个字节，有一个专业的名字，叫做BPB（BIOS Parameter Block，BIOS参数块）。至于为什么叫这个名字，我们无需理会，只需知道这部分数据对所有FAT文件系统，包括FAT12/16和FAT32，都是通用的。接下来从偏移0x40开始的26个字节，叫做扩展BPB，只有FAT32卷中才存在。下面我们详细解释引导扇区的每个字段，了解了这些字段的含义，对FAT文件系统的工作原理也就有一个大致了解了。为了解释方便，我们以表格的形式呈现，如表12-1所示。
表12-1 引导扇区各字段的含义
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（续）
从0x5A往后，就是真正的引导代码了，如果存在的话。引导扇区的最后两个字节是0x55AA，用于标志一个合法的引导扇区的结束。这样通过分析上述各个变量，FAT文件卷的全局信息就可以把握了。实际上，文件系统的实现代码，也是通过综合分析上述各个字段，来判断出文件系统的类型（是FAT12/16还是FAT32），进而得到FAT表的开始位置和长度、根目录的开始位置等信息。这样一个可用的文件卷就建立起来。
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