2.2.2.1 鸭舌草的遗传多样性
18个RAPD引物扩增出116条清晰的带纹，平均每个引物扩增出6.4条带，其中34条为多态性片段，多态性片段占29.31%，如图2-4所示。
图2-4 随机引物S217对鸭舌草杭州种群的RAPD扩增电泳图
基于RAPD分析的结果表明，鸭舌草7个种群内有不同程度的遗传变异。鸭舌草Nei's基因多样性为0.0848，Shannon指数为0.1313(表2-4)。每个种群都能检测到不同数量的多态性变异位点，多态性位点百分率从最低的长沙种群的6.80%到勐腊种群的14.71%。Nei's遗传多样性从最低的0.0228到0.0471。Shannon指数从最低的0.0344到最高的0.0725(表2-4)。
表2-4 RAPD检测鸭舌草种群遗传变异统计
续表
注:PPB:多态性位点所占总位点的百分比；H:基因多样性；I:Shannon指数。
如图2-5所示，从ISSR分析结果可以看出，14个ISSR引物扩增出111条清晰的带纹，平均每个引物扩增出7.9条带，其中87条为多态性片段，多态性片段占78.38%。
图2-5 ISSR引物UBC857对鸭舌草武汉种群的ISSR扩增电泳图
Nei's遗传多样性为0.7732，Shannon指数为0.1467(表2-5)。每个种群检测到不同的遗传多样性，多态性位点比率从最低的长沙种群的9.01%到勐腊种群的25.23%。Nei's遗传多样性从最低的0.0274到0.0932。Shannon指数从最低的0.0426到最高的0.1384。ISSR标记无论是检测的多态性片段，还是揭示的遗传多样性指数，都要高于RAPD标记，表明ISSR能够检测出更多的遗传变异位点。
表2-5 ISSR检测鸭舌草种群遗传变异统计
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注:PPB:多态性位点所占总位点的百分比；H:基因多样性；I:Shannon指数。
2.2.2.2 鸭舌草种群间的遗传分化
通过RAPD分子标记分析发现，在鸭舌草种群存在显著的遗传分化(P＜0.001)。鸭舌草种群间的基因分化系数(ΦST)是0.74，表明大部分的遗传变异存在于种群间，而种群内遗传变异水平相对较低。
ISSR分析显示，在种群之间基因分化系数(ΦST)为0.76，虽然略高于RAPD标记，但与RAPD分析所得的结果一致。Mantel测验地理距离和遗传距离的相关性，结果表明，无论是RAPD还是ISSR标记分析，RAPD分析和ISSR分析所揭示的遗传距离与地理距离之间的相关系数分别是0.48和0.45，表明鸭舌草7个种群的地理距离和遗传距离没有相关性。
2.2.2.3 鸭舌草种群间的遗传关系
种群间遗传距离见表2-6，ISSR分析与RAPD分析存在很大的不同。ISSR分析显示，富阳和海南的遗传距离最大为0.4563，而南昌和长沙种群的遗传距离最小，仅为0.2037。通过RAPD分析得到的结果则是，南昌和海南种群的遗传距离最远，南昌和武汉种群遗传距离最近。
表2-6 ISSR和RAPD标记检测到种群间的Nei's遗传距离统计
注:****以上部分为ISSR分析结果，以下部分为RAPD分析结果。
从RAPD和ISSR聚类分析也得到了相似的结果。RAPD聚类分析显示，7个种群分为两个大支。其中，长沙、三亚和勐腊3个种群聚成一支，而其余4个种群聚在一起，Jaccard相似性系数在0.882和0.950之间。如图2-6所示。
ISSR分析的聚类图显示，Jaccard系数相似性在0.772和0.830之间，富阳和江宁种群聚成一支，而其余5个种群聚成另外一支。基于两种标记分析之间存在很大的不同，为了评价RAPD和ISSR的相关性，用7个种群间的Jaccard系数进行了Mantel测验。结果显示，相关系数r＝0.45，表明在鸭舌草的遗传变异分析中，RAPD和ISSR两种分析方法没有表现出相关性。如图2-7所示。
图2-6 鸭舌草7个种群基于Jaccard相似性系数的RAPD标记聚类分析
图2-7 鸭舌草7个种群基于Jaccard相似性系数的ISSR标记聚类分析
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