二战结束前，柏林是德国的科技和学术中心，也是政治、经济、文化中心。随着二战结束，东西德国分裂，东西柏林分裂，原先的帝国首都成了斗争前线。西柏林成了西方展示富裕的窗口，东柏林也是民主德国展示自己优越制度的首都。大学也分裂了，在西柏林区域的大学组建了美式的柏林自由大学，宣称自己是原来柏林大学的继承者，而东柏林区域的柏林大学主楼里，大学也重建了起来，并于1949年正式改名为柏林洪堡大学。战后初年，洪堡大学为适应形势的需要建立了工农系，专门招收工农干部入校学习和培训，然后派往生产第一线和学术机构。柏林洪堡大学成为民主德国控制思想的重要关注点，承担了许多非学术的任务。在20世纪五六十年代，民主德国也进行了改革，柏林洪堡大学重新走上了学术研究的道路，其指导思想是民主德国统一社会党界定的原则。同时开始与苏联及东欧集团的大学之间建立了密切的合作。到20世纪70年代，洪堡大学开始与西欧和美洲许多大学有了正式的学术合作。
两德合并之后，在建设东部的浪潮中，洪堡大学迎来了一个新的发展时期。原有的思想政治老师全部被请出大学。这时，学校的管理主体是来自联邦德国的教授。原有民主德国的教师需要通过审查委员会的审查才能够继续任教。大部分民主德国教师都以自己辞职或者被要求辞职、转岗的方式离开了大学。柏林洪堡大学重新走上了联邦德国20世纪50年代的老路，以团体自治方式开展学术管理和研究。20世纪90年代初，柏林州政府想恢复洪堡大学旧时的名气，将其塑造成为德国最好的大学，一度增长得十分迅速。然而，到了90年代末，因为柏林州财政预算紧张，甚至有传言要把柏林自由大学和洪堡大学合并。后来，确定了独立发展、但是要学科协调的原则。柏林自由大学获得的资源相对较多，而柏林洪堡大学在短短的几年之内惨遭两次精简，实力有所减弱。2010年，这所大学庆祝200周年的时候，柏林洪堡大学重新焕发了荣光，该校在THE世界大学排名位列全球第五十多位，2012年跻身德国精英大学行列。(www.xing528.com)
柏林洪堡大学基本上沿袭了历史上传统的柏林大学模式，虽然在小的方面有所变化，但是大的框架仍然如旧。按照本书对于大学模式的分析框架，可以清楚地看到这一点。在2006年大学章程的基础上，2013年出台了新的修订版。《柏林洪堡大学章程》明确规定了大学的各类事务[1]。今天，可以总结以下的特征：
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