袁崇焕虽然书生意气，擅杀了毛文龙，但他仍不失为一员忠心耿耿的猛将。宁远大捷就是在袁崇焕的指挥下取得的。面对小小的宁远城，后金甚至赔上了努尔哈赤的性命。面对这种状况，皇太极便动起了绕道进攻关内的心思。而袁崇焕对后金的这一计谋也早有预防，他曾经多次向崇祯帝上奏，要求加强对河北其他前线地区的防御。但这一建议并没有得到崇祯帝的充分重视，甚至袁崇焕派出的援军也被遣还。
崇祯二年（1629）十月，皇太极亲率十万大军绕道内蒙古，越过喜峰口攻入长城，兵分三路，进入河北一带，包围遵化。毫无防备的北京城顿时直接暴露在后金的铁蹄之下。袁崇焕连忙率军星夜兼程返回北京勤王救驾。彼时，后金军已攻陷多处隘口，准备进攻通州，但袁崇焕竟然抢在后金军之前返回通州，准备守城战。皇太极得知这一消息，大惊失色，以为山海关的通路已经被明军严密封锁，无奈只得放弃通州，向西进攻北京。
眼看兵凶战危，袁崇焕竟然忘记了明廷祖制“非禁卫军不得入京畿”，率9000骑兵直抵广渠门外并在此扎营。与清军大战一日，袁崇焕暂时击退了后金军的围城态势。
见战不下袁崇焕，后金军便退至京郊一带，肆意烧杀抢掠，企图以此激怒袁崇焕兴兵进攻，孤军深入。不料袁崇焕虽然对此不予理睬，但朝内不少官员却纷纷中计。他们的田宅庄园大多在城外，后金军此举让他们大受损失，痛心疾首之余他们就将一腔邪火转移到了袁崇焕身上，认为正是其处置失当，才让后金军兵临城下。
数日之后，后金军又卷土重来，在左安门一带展开攻击。但在袁崇焕的抵抗下又是无功而返。
袁崇焕组织的几次战斗，给明王朝赢得了喘息的时间。各地勤王保驾的军队纷纷赶到，在数量上对后金军也形成了优势。皇太极见势不妙，便决定将袁崇焕先行除掉，为此假意做出退兵议和的姿态，暗中却定下了一条毒辣的“反间计”。
皇太极指使后金军官讨论关于袁崇焕通敌卖国的虚假消息，又故意让被俘获的太监听到，并假意疏忽让其逃跑。太监自然会将这些虚假消息带回给崇祯帝。
不幸的是，崇祯帝刚愎自用，生性多疑。原本因为毛文龙之死，他就对袁崇焕心存芥蒂，如今有大量“证据”显示袁崇焕是“汉奸”，他自然更是深信不疑了。
可叹袁崇焕对于此事一无所知，还在积极准备对后金的作战；而那厢崇祯皇帝却准备动手了。崇祯二年（1629）十二月初一，崇祯帝声称要商议军饷筹集之法，将袁崇焕等人召至宫中。全无防备的袁崇焕一进宫，便被锦衣卫拿下。崇祯帝严厉斥责袁崇焕，历数他种种“罪恶”，并将他投入锦衣卫大牢。(www.xing528.com)
皇太极见诡计得逞，立刻与明军在永定门大战数日。没有了袁崇焕的指挥，明军明显不是后金军的对手，后金军突破了明军的防守阵地，攻到了北京城下。
危在旦夕的时刻，又是袁崇焕将个人待遇置之度外，给祖大寿手书一封，要求他以国家大局为重，回兵与后金作战。祖大寿得此书信，深为袁崇焕所感动，便回兵京师，重新击退了后金军的攻势。
皇太极无奈，只好撤军。北京保卫战算是以明军的全面胜利告终。
祖大寿因其战功被崇祯帝大加封赏，但他不仅不领袁崇焕召唤祖大寿的情，相反还奇怪地认为，大明朝文官武将人才济济，没有你袁崇焕，我崇祯一样可以平定天下。如果说，这之前他还心存一丝无人可用的忧虑的话，那么在后金退兵以后，他反而坚定了诛杀袁崇焕的决心。
崇祯三年（1630）八月初五，崇祯帝凌迟处死袁崇焕之心已决，十六日，中秋节刚过，崇祯皇帝先是在乾清宫暖阁召见辅臣成基命等，而后又在平台召见文武大臣，宣布了袁崇焕的九大罪状，并迫不及待地命令刑部侍郎涂国鼎前去西市监斩。当日午时，“风霾昼闭，白日无光”，袁崇焕被押赴北京西市以惨无人道的“磔刑”处死，时年46岁。
袁崇焕文官出身，半路出家任武职，却令骁勇多智的努尔哈赤和皇太极两代英雄均在他手下铩羽而归，不能不让人折服。他天生的军事才能和独有的战略眼光几乎可与岳飞比肩，而他的下场却比岳飞更加悲惨。如果崇祯帝不是那样多疑，不是那样刚愎自用，也许中国的历史将被袁崇焕改写。
袁崇焕一死，明朝亡国已经是不可逆转的局势。
崇祯虽然自己认定“朕非亡国之君，臣皆误国之臣”，但他的行为真是自毁长城，令忠臣寒心。即使他连发“罪己诏”，也避免不了众叛亲离的下场。
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