明天顺六年（1462）五月，山西汾州（今汾阳）官兵捕获了十六个造反的人，经审问，他们供认的同谋者竟达千余人。很快，这些同谋者被陆续捕获，不料在审讯时，他们却异口同声高呼“冤枉”。审讯官告诉他们是在押的十六个人指供的，他们都说这十六个人和他们一直怀有仇怨，故意借机报复。面对如此局面，参加审讯的绝大多数官员都不愿仔细分辨，竟想把被捕者全以“逆党”之罪处死，只有藩台祝颢持异议。在商量结案时，祝颢对其他官员说道：“既然十六个在押犯指证了那些同谋者，那么这些同谋者为什么不和他们同时参加造反的行动呢？这十六个人又为什么这么快就供认出这么多的同谋者呢？其中定有蹊跷。即使这些人参与造反，按照朝廷法律，凡造反者，首恶必究，胁从不治，更何况这些被牵连的人呢？”祝颢把自己的意见奏报朝廷，经重新审理最终释放了这一千多人，祝颢办案的名声也传播开了。
不久以后，祝颢又奉命与朝廷派来的使臣赴崞（ɡuō）县监斩七个死囚。刽子手依次杀了五个，轮到最后两个时，不料他们连呼“冤枉”，恨恨不已。祝颢见了，连忙制止刽子手用刑，叫人把那两名死囚押到面前来。祝颢开口问道：“你们既已死到临头，为什么大呼冤枉？”这两名囚犯回答道：“我们都是安分守法的小人，根本就没有犯下死罪，只因熬不过严刑拷打而被迫承认。今天我们见大人亲临，又听说您非常仁慈，才敢衔冤呼救，请大人仔细辨明案情，还我们清白之名。”祝颢听后对使臣说：“看来此案还需重审，若仓促行刑，恐怕会误杀无辜百姓。”使臣心中虽然并不赞同祝颢，但也不便坚持原判，只得同意将两名囚犯带回重审。
回到衙门后，祝颢调来全部案卷仔细研究，发现案件果有疑问，但要完全证明这两名囚犯无罪，最主要的证据一时难以到手。他也知道使臣心中本来就不服，若无有力证据在手，使臣不会就此罢休。祝颢陷入了沉思。(www.xing528.com)
第二天，使臣本想和祝颢审理案子，忽然来了一名差役，告诉他祝颢生病推迟审期。使臣以为既然祝颢病了，推迟几天审案也无关紧要。不料祝颢这一病，毫无痊愈迹象，使臣出于关心与礼貌，来到祝颢家中探病。到了祝家，使臣发现祝颢并未病倒在床，而是在仔细阅读案卷，心里觉得十分奇怪，赶忙上前询问祝颢的病情。祝颢说：“其实我并没有生病，只因为有两名无罪者被判处死刑，我一时不能为其辨明冤屈，这才是我的心腹大病啊！”使臣恍然大悟，不由被祝颢认真负责的精神所感动。后来，在使臣的协助下，祝颢查明实情，终于将两名被冤枉的百姓无罪释放。（《寓圃杂记》沈习康）
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