雍正在内政方面的多项改革举措，使清代的政治体制大体上得到了完善。
譬如，他改革八旗制度，裁抑原满洲部落贵族的特权，撤销旗下护军，禁止八旗宗藩与外廷交通、接受私谒，八旗兵权统归皇帝一人。雍正采取了极其严酷的措施，大杀满族亲贵，直接委派亲信管理各地旗务，全面剥夺了原八旗旗主的兵权。这样一来，八旗就能直接听命于皇帝，成为中央集权制下的常备军。八旗兵共分满、汉、蒙，各置八旗，总共有二十四旗。其中一部分留守京师，称“禁旅八旗”；一部分驻守地方，称“驻防八旗”。所有八旗中，仍以满八旗为主。除此之外，还有绿营兵，由收编后的明降军和汉族地主武装组成，配合八旗兵驻防北京和全国各地，由此在全国形成十分严密的军事控制体系。
雍正进一步加强对总督、巡抚和地方政府的控制。明代的总督、巡抚大多为临时委任，负有监察或特殊军事统领之责，行省一级最高行政长官为布政使。明代后期因军事控制的需要，才在各地增设总督，也非普遍现象。与明代不同的是，清代将督、抚制度化后，总督、巡抚成了固定的封疆大吏，代表皇帝总揽一省或数省的军政大权。督、抚们可以通过“奏折”或“密折”，直接向皇帝汇报军政大计，皇帝有密谕，则通过“廷寄”迅速直接地传到督、抚那里。
下面是一则康熙五十七年雍正尚为“四王爷”时与心腹戴铎的来往密折：[37]
奴才戴铎谨启：主子万福万安。奴才素受隆恩，合家时时祈祷，日夜思维，愧无仰报。近因大学士李光地告假回闽，今又奉特旨，带病进京，闻系为立储之事，诏彼密议。奴才闻知惊心，特于彼处相探。彼云“目下诸王，八王最贤”等语。奴才密向彼云：“八王柔懦无为，不及我四王爷聪明天纵，才德兼全，且恩威并济，大有作为。大人如肯相为，将来富贵共之。”彼亦首肯。但奴才看目下诸王各各生心。前奴才路过江南时，曾为密访，闻常州府武进县一人，名杨道升者，此人颇有才学，兼通天文，此乃从前耿王之人也，被三王爷差人请去，养在府中，其意何为？又闻十四王爷，虚贤下士，颇有所图。即如李光地之门人程万策者，闻十四王爷见彼，待以高座，呼以先生。诸王如此，则奴才受恩之人，愈觉代主子畏惧矣。求主子刻刻留心。此紧要时，诚难懈怠也。谨启。
蒙批：“杨道升在王府已有数年，此乃人人皆知。”“程万策之旁，我辈岂有把放屁当焚香之理。”“你在京城时，如此等言语，我何曾向你说过一句。你在外如此小任，骤敢如此大胆，你之死生，轻若鸿毛，我之名节，关之千古。我作你的主子，正是前世了。”
《雍正十二月行乐图轴》（局部）之赛龙舟
这是雍正登基前的紧要关头，戴铎为他打探的朝廷和各王子派系的动向，十分真切。彼时的“四王爷”虽然表面上批评戴铎胆大妄议国家大政，要重视自己的名声，但心底里还是需要这样的奴才为他驱使服务的。
雍正亲政后，这种密折应用的范围扩大了，许多官员都获得了使用奏折的权力。奏折逐渐成为清朝最重要的官文书。由于奏折具有密、速、详的特点，皇帝通过奏折多方面地了解下情，对各级官僚机构的控制也大大强化。
雍正的勤政，在清朝历代皇帝中算是出了名的。现在保存下来的雍正朱批奏折，只有十三年，但却相当于乾隆六十年公文批复的工作量，比康熙还要勤奋，实在令人叹服。
雍正每天办公，从早到晚，从不间断。他每天批阅的奏折，多时达五六十件。奏折中很小的事情，他都要仔细览读，从不轻视，更不会拖延耽搁。奏折中的用语都是白话，十分生动有趣。收录在《清代官员履历档案全编》中的雍正批示，是这方面的一个反映。看看他对下面这些地方官员的评价：
陕西凉州镇标中营守备王锡：鬼头些的人，相貌倒好。
候补贵州平越县知县杨兴道：人着实不妥，鬼而横，不似端人。
河南管河道祝兆鹏：明白，去得，似过聪明人。细问，老成人，将来可用。
广东平海营中军守备戴进：老实人，相貌卑小，像老婆子。
云南开化镇标左营守备史应贵：痴胖子，似醉眼，人亦明白，识字，像买卖人。
直隶正定镇标左营游击佟儨：赤红脸，似酒气，像公子哥儿，紧肉，胖子。
江西广信府知府佟鑍：深知之人，急性，公子哥儿，良心似有，出得力的。
进士出身候选知府姜潮俊：不似科甲，像一实力办理之人，将来可道员，尚可上进。
直隶宣化人、江苏泰州知州褚世暄：甚像汉军，好小材料，非大气，人亦小聪明，伶俐人。
德清人、南昌府知府许镇：人苍，着实明白，只恐有浙江习气。
海盐县人、柳州府知府钱元昌：人甚老成明白，将来可道员，不似浙江人，好相貌，须参白。
河南人、太仓直隶州知州王溯维：过于聪明，像浙江、汉军人。有才有本领人，气度庄大，神气不真诚，未看透，人贼苍。
定海镇标左营游击张文耀：人明白，不似福建人，说话亦不土音，此人若能操守，总兵有余之官。(www.xing528.com)
这些评语，简单明了，容易理解，且精准地反映了雍正的态度和评价。
许多奏折中的批示，雍正还会把自己情感表示出来，令人可亲。收在《雍正朱批谕旨》中的大量批谕，都可以看到。比如：[38]
“好事好事！此等事览而不嘉悦者，除非呆皇帝也！”
“李枝英竟不是个人，大笑话！真笑话！……有面传口谕，朕笑的了不得，真武夫矣。”
“朕生平从不负人；人或负朕，上天默助，必获报复。”
“真正累了你了，不但朕，怡亲王都心疼你落眼泪。阿弥陀佛，好一大险！”
“该！该！该！该！只是便易了满丕等，都走开了。不要饶他们，都连引在内方畅快！”
“少不机密一点，仔细头！”
“可谓良心丧尽，无耻之小人也！”
雍正的政治改革中，赋役制度的调整，对后世影响极大。
清初，中央鉴于明朝后期赋役的紊乱以及战争的破坏，在入关后大力整顿赋役制度。顺治三年着手编纂全国的《赋役全书》，费时十一年才完成；康熙中期重订《简明赋役全书》，对赋税征收的操作手段实行改革。为了改变地亩、人丁双重赋役标准所造成的征收上的混乱和弊端，清政府在明代“一条鞭法”的基础上，进一步深化改革。
康熙五十一年（1712）二月，朝廷宣布以明代万历十年（1582）的全国丁银额为征税准则，所谓“盛世滋生人丁，永不加赋”。康熙帝在给大学士和九卿等有关官员的谕旨中这样说道：“朕览各省督抚奏编审人丁数目，并未将加增之数尽行开报。今海宇承平已久，户口日繁，若按见在人丁加征钱粮，实有不可。人丁虽增，地亩并未加广，应令直省督抚，将见今钱粮册内有名丁数，勿增勿减，永为定额。其自后所生人丁，不必征收钱粮，编审时，止将增出实数察明，另造清册题报。”又说，“直隶、各省督抚及有司官编审人丁时，不将所生实数开明具报者，特恐加征钱粮，是以隐匿，不据实奏闻。岂知朕并不为加赋，止欲知其数耳！”[39]
这项政策，在中国赋役制度史上有着重要意义。不过，这在根本上仍不能解决在丁额数字上的混乱和虚假作弊，所以，在康熙末年，四川、广东等省开始试行将丁口之赋摊入地亩的征收办法。[40]
雍正元年（1723）六月，山东巡抚黄炳首先上奏提出，要按地摊丁，丁银摊入地亩征收，以苏民困。他认为，有地则纳丁银，无地则去丁银，可以使贫富负担趋向平均。雍正认为摊丁问题关系重大，并没有马上接受黄炳的建议，反而说他“冒昧渎陈”。[41]但是一个月后，直隶巡抚李维钧（后任总督）上奏中同样的提议，却得到了雍正赏识。李维钧作了详细的汇报，准备将地亩分上、中、下三等，丁银按地亩等级摊入，这样更符合实际情况。第二年，即批准先在山西实行，而后云南、河南、陕西、甘肃、安徽、江西等省相继实行“地丁合一”。这种“摊丁入地”的赋税改革，使中国历史上带有浓厚人身依附性质的人丁税基本被废除。
后来，人们常常将清代的“摊丁入地”和明代的一条鞭法联系起来进行考察，把一条鞭法看成是“摊丁入地”的前驱，而“摊丁入地”又是一条鞭法的继续和深化，这是很有道理的。
从年轻时代侍从康熙巡幸四方，到中年以后亲政天下，雍正一直十分勤勉，是个奋发有为的君主。除了在雍正元年奉送康熙和仁寿皇太后灵柩去河北遵化的东陵外，他在位十三年间，哪儿也没去，更不会去游山玩水了，都在京城里操持国家大事。唯一的奢侈消遣，是在京郊修建圆明园和名山宝刹。
一般认为，雍正在生活上用度是较为简单的，甚至连纸张的使用，也要求节俭。他经常说：“用不着的东西，再不必进。”江宁织造曹頫进了一百把锦扇，雍正虽然觉得墨色不错，但说“此种扇不必进”。[42]这也是雍正为政的态度。
雍正有十个儿子，长到成年的，有弘时、弘历、弘昼、弘瞻四人。在雍正十一年时，弘历被封为宝亲王，可以参与一些政务大事，是雍正心中储君的重要人选。对他们的教育，雍正也抓得很紧。六岁以上，都要到上书房读书。雍正即位后，下令由朱轼、张廷玉、嵇曾筠、徐元梦等饱学硕儒，负责皇子们的教育工作，专门设立懋勤殿，举行拜师礼。
根据《清实录》的记载，雍正十三年（1735）八月二十一日，雍正在圆明园得病；次日照常工作；二十三日病情加剧，当天晚上，紧急召见宝亲王弘历、和亲王弘昼、庄亲王允禄、礼亲王允礼、大学士鄂尔泰、张廷玉等人，宣布传位给弘历后，于深夜辞世。[43]
在清代历史上，终身勤奋的帝王唯雍正一人而已。惜乎太过操劳，以致运命不长。他留下的遗诏，是他作为帝王的人生写照，也是写给下一代的政治嘱托。
雍正认为，他的一生，“无日不兢兢业业”，时刻牢记先皇康熙的教诲，“惟仰体圣祖之心以为心，仰法圣祖之政以为政，勤求治理，抚育蒸黎。无一事不竭其周详，无一时不深其祗敬”。他对弘历的评价很高，认为是先皇康熙生前最喜欢的孙子：“宝亲王皇四子弘历，秉性仁慈，居心孝友，圣祖皇考于诸孙之中，最为钟爱，抚养宫中，恩逾常格。”至于立弘历为储君，其实在雍正元年八月，他于乾清宫召见诸王、满汉大臣，亲拟密旨时，就已经确定了。他也解释了在位时期，为政以严，是因为：“国家刑罚禁令之设，所以诘奸除暴，惩贪黜邪，以端风俗，以肃官方者也……从前朕见人情浇薄，官吏营私，相习成风，罔知省改，势不得不惩治整理，以戒将来。今人心共知儆惕矣！”对另外几个儿子也有很好的评价：庄亲王心地淳良，和平谨慎；果亲王至性忠直，才识俱优，等等，都寄予了厚望。
对他信任的大臣，在遗诏中予以高度赞扬：“大学士张廷玉器量纯全，抒诚供职，其纂修《圣祖仁皇帝实录》，宣力独多……大学士鄂尔泰志秉忠贞，才优经济，安民察吏，绥靖边疆，洵为不世出之名臣。此二人者，朕可保其始终不渝。将来二臣著配享太庙，以昭恩礼。”[44]在雍正的许多大臣中，能拥有这样崇高的礼遇，恐怕也只有张廷玉、鄂尔泰两人了。
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