这是几年前恢复九州制构想的延续，虽然那一次曹操做出了妥协，但他一直思考着这件事，北征取得的巨大成功，也许鼓舞了曹操，所以回师后就把这件事提了出来。
西汉因袭秦制，三公分别指丞相、太尉、御史大夫，相互不统属，但有制约，都直接向皇帝负责。九卿分别指掌管宗庙礼仪的奉常、掌管皇宫保卫的卫尉、掌管宫廷警卫的郎中令、掌管宫廷车马的太仆、掌管少数民族事务和外交的典客、掌管司法的廷尉、掌管财政税收的治粟内史、掌管皇室事务的宗正以及掌管山河湖海税收和手工业的少府。
东汉的三公指太尉、司徒、司空，九卿指掌管典礼的太常、掌管宫廷事务的光禄勋、掌管宫省禁卫的卫尉、掌管皇室车马的太仆、掌管司法的廷尉、掌管接待诸侯与少数民族的大鸿胪、掌管皇族事务的宗正、掌管国家财政收支的大司农、掌管皇帝器用服饰的少府。
三公向皇帝负责，并分管九卿，每人分管三个。
所以，东汉不设丞相，只有西汉设置。西汉的三公虽然互不隶属，但丞相的地位显然高于御史大夫以及太尉，与东汉三公相比，丞相的权力更大，这从它的内设机构及编制上就可以看出来。
西汉的丞相府里下设十三曹，相当于13个处，标准的编制多达382人。
这些主要的部门有：西曹，负责丞相府内的吏员任用；东曹，负责天下2000石官员的升降，包括军中的武将在内，2000石相当于部长级，在地方上就是郡太守一级，在军队里相当于将军，这个处的权力极大；户曹，负责祭祀、农桑；奏曹，负责管理政府的一切章奏，相当于唐代的枢密院、明代的通政司；词曹，负责民事法律诉讼；法曹，负责交通以及邮驿等；尉曹，负责运输，像清代的漕运总督；贼曹，负责侦办盗贼；决曹，负责刑事审判；兵曹，负责兵役；金曹，负责管理货币、盐铁；仓曹，负责管理国家粮库；黄曹，相当于丞相府总务处。
从这些内设部门可以看出，丞相府实际上就是一个标准的小内阁，人事、行政、经济、交通、司法、外交、军事无所不管。正因为它的权力太大，所以汉武帝重视尚书台，把权力从丞相手中逐步收到自己身边的一群秘书手里，削弱丞相的权力。到了东汉，干脆设新的三公，把丞相的权力一分为三，互相制衡。
从西汉到东汉，一直在围绕着皇权与相权展开斗争，天子是否强势，成为斗争的焦点。而到了东汉中后期，政治斗争中夹进来外戚、宦官，形势更加复杂化。三公在现实政治格局中已经完全被边缘化，这种局面的改变，是在曹操担任司空以后。
现在，曹操提出恢复丞相制，倒没有遇到太大的阻力。
对于曹操成为丞相，大家已经有了足够的心理准备，叫什么只是个名分而已，实质内容并没有大的改变。
这场政治改革有一个小小的由头，这一年年初，曹操还没有回到邺县，司徒赵温突然征辟曹丕，也就是征调曹丕到司徒府工作。因为曹丕的特殊地位，赵温的这项提议在外人和曹操自己看来并不是有意讨好，反而有点恶搞，因而触怒了曹操，赵温因此被免官。
作为名义上唯一与曹操地位相当的在职官员，赵温的日子并不好过，他时刻担心会做错什么事，或者犯了曹操什么忌，从而惹来杀身之祸。这种树大招风的心理一直左右着士大夫出身的赵温。
因而，为一件不大不小也算不上丢人的事被免官，对于赵温来说与其是不幸，不如说是幸运。
所以有人认为是赵温有意而为之的，目的是全身而退。
赵温被免官之后，三公只剩下曹操一人，此时恢复丞相，曹操更是理所当然地成为唯一候选人。
汉献帝建安十三年（208年）六月，汉献帝命太常卿徐璆拿着天子的符节前往邺县，拜曹操为丞相。徐璆就是那个从袁术手下逃脱，并将传国玉玺归还汉室的功臣。
曹操对这项任命也做了礼节性的推辞，甚至要把丞相让给徐璆当。徐璆再弱智或者再官迷心窍也断然不敢应承这种事，予以坚决拒绝（操以相让璆，璆不敢当）。
于是，曹操正式就任丞相，同时任命郗虑为御史大夫。
西汉的三公除丞相外，还有御史大夫和太尉，曹操此次恢复丞相制，没有恢复太尉，只恢复了丞相和御史大夫。有人认为御史大夫很重要，相当于副丞相，曹操把如此令人瞩目的职务给了名不见经传的郗虑，确实让人大出意外。
郗虑字鸿豫，兖州刺史部山阳国人，跟刘表一个县。他进入曹操阵营比较晚，之前提到过，他有一个特殊的身份，是郑玄的学生，这让他沾了不少光。以郑玄在当时文化界无人匹敌的地位，他的学生崔琰、国渊、王基等人在社会上也享有很高的知名度，加入曹操阵营后都很受重用。
郗虑从小就受教于郑玄，汉献帝建安初年来到许县，在曹操的推荐下直接做了部长级的皇帝高级顾问（侍中），后来又以侍中的身份兼任九卿之一光禄勋。
但是，对郗虑这个人汉献帝却不大喜欢。
汉献帝曾当着郗虑的面问少府孔融：“郗先生有什么特点和长处（鸿豫何所优长？）”(www.xing528.com)
孔融对郗虑也不感冒，一点不考虑当事人就在旁边，顺口说：“可以打发他到路边站岗，不能让他掌权（可与适道，未可与权）。”
打人不打脸，伤人不揭短，这是赤裸裸的羞辱。
郗虑十分恼怒，反驳孔融说：“你当年主政北海国，政治疏失，人民流散，你的能力在哪里？”
从此以后，郗虑认准孔融是自己的仇人，非要找机会整治他不可。
赵温的免职通知就是郗虑奉命传达的（虑持节奉策免温官），郗虑资历浅，与孔融等老牌士大夫们关系恶劣，加上他为人尖刻，报复心强，这些正是曹操所需要的，把郗虑提拔为高于九卿的御史大夫，虽然在外人眼里很意外，却十分符合曹操的想法。
曹操担任丞相后，立即着手推动丞相府的各项建设，选调各类人员。
原司空府的人员全部转到丞相府来，同时还根据丞相府内设机构增加的需要，选调了一些新人。
对于从司空府转入丞相府工作的所有人来说，工作性质可能变化不太大，但收入却可以增加不少。举例子来说，司空府里的处长（掾）一级官吏，品秩是300石到400石，月俸是30斛到40斛，副处长（掾属）的品秩是200石，月俸大约20斛，而转到丞相府后，处长（掾）的品秩升为400石到600石，月俸提高到45斛到70斛，副处长（掾属）的品秩虽然仍为200石，但月俸可以提高到30斛以上。
这段日子，大家都沉浸在加薪的喜悦中。
丞相府各个处（曹）中，西曹、东曹两个部门管人事，负责典选从地方到军队的高级官员，地位最为重要。曹操把冀州副州长（别驾）崔琰调过来，任西曹的处长（西曹掾），把毛玠调来任东曹的处长（东曹掾），由他们二人负责十分重要的人事工作。
早在两年前，曹操西征并州时，留下曹丕守邺县，崔琰以冀州别驾的身份辅佐曹丕。在此期间，曹丕迷上了游猎活动，不太专心工作，崔琰没有因为他是世子就睁一只眼闭一只眼，他给曹丕写了封措辞很尖锐的信，让曹丕认真思考一下袁绍父子是如何失败的，规劝他遵循正道，端正行为，把心思用到正事上来。
面对敢于直言的崔琰，曹丕也只得服服帖帖，对崔琰说：“昨天看到了先生写下的谆谆教诲，要我烧掉射猎的用具，扔掉打猎的服装，现在用具已烧毁，猎装也扔了。以后再有类似的错误，还请先生及时对我教诲（后有此比，蒙复诲诸）。”
曹丕表现的态度相当诚恳，曹操知道此事后，对崔琰也十分赞赏。
曹操任命崔琰为东曹掾时专门对他说：“先生你有伯夷一样的风范、史鱼一样的正直，贪婪的人听到你的名字就会变得清廉，壮士听到你的名字就会更加英勇（贪夫慕名而清，壮士尚称而厉），先生可以称为时代的表率，所以任命你为东曹掾。”
毛玠在司空府就从事人事工作。他以清廉公正著称，没有私欲，不贪心，没有不良嗜好，不拉帮结派，没有小圈子，敢于得罪人，这些正是做人事工作所必备的条件。曹操把典选官吏的大权交给了他。
西曹与东曹都管人事，但分工有所不同，打个比方，一个好比是组织部，一个好比是人事部，崔琰和毛玠两个人干得都很出色。
丞相府其他11个处（曹）先后担任过处长（掾）和副处长（掾属）的还有司马懿、高柔、刘晔、裴潜、傅干、杨修、王观、杨俊、徐邈、辛毗、温恢、薛夏、王凌等人，他们中的大部分人之前都已做过介绍。
丞相府里还有两个职务，地位和作用高于一般的处长，一个是主簿，类似于办公室主任；一个是长史，职责与主簿差不多，地位比主簿还要高些，类似于丞相府里的秘书长。曹操当丞相后，首任主簿是司马懿的大哥司马朗，司马懿后来也担任过这个职务。担任过丞相府长史的有杜袭、徐奕、辛毗、王必、杨修等人。
除此之外，“挂靠”在丞相府内的还有一些相对独立的部门，主要是与军事有关的部门，包括曹操的各类军事参谋人员。说他们是“挂靠”，是因为传统的丞相府里并没有他们的编制。
在曹操的丞相府里，他们人数众多，称呼也有好几种：
一种是军师，荀攸、钟繇、华歆、凉茂、毛玠、成公英等人先后担任过；
一种是军祭酒，董昭、王朗、王粲、杜袭、刘放、孙资等人先后担任过；
一种是军谋掾，徐邈、田豫、牵招、高堂隆、贾洪、薛夏、隗禧、韩宣、令狐劭等人先后担任过；
一种是丞相军事，何夔、贾诩、华歆、王朗、裴潜、刘放、孙资、邢颙、陈群、张范、张承、仲长统、陈群、卫臻等人先后担任过。
上面这些人，组成了曹操的总参谋部，他们的职务分别类似于总参谋长、副总参谋长、高级参谋、参谋处长、参谋等，组成了强大的参谋班子，服务于曹操的军事行动。
可以说，丞相府吸纳了当时最优秀的一批人才，他们在曹操身边工作，实际上承担着管理整个“曹统区”的任务。曹操喜欢把一些优秀人才先安排在自己身边工作，之后下派到地方上任刺史、郡太守、县令或屯田官等，丞相府于是成为一个高级人才的培训基地，一时间天下俊才们都以能到丞相府工作为荣。
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