二月二十一日，往阅惠州、潮州兵。
二月，上书密陈预防英人事宜。折略云“英人恃强桀骜，性复贪利。以目前状况论似宜多镇以威，未便全绥以德，否则所求或遂所望愈奢，贪得之心，会无厌足。倘敢擅入内洋，即随机应变，加之惩创。一则停止贸易；一则断其食用买办；一则开炮火攻。惟当严饬各炮台备弁……暗加严备，彼国伎俩，惟恃船坚炮利，一经上岸，则无拳无勇。”嘉庆帝谕示：“总须德威相济，不可妄动，慎之。”（《清史列传·阮元传》）
三月二十七日，回至广州，奏阇西贴防兵丁，议改别营轮班派防为抽拨长驻。
移拨省兵二百名。以百名安置阇西，把总领之；八十名安置大虎山炮台，千总领之；二十名添置焦门炮台，外委领之。
四月，新建大黄滘、大虎山炮台成。撰《广州大虎山新建炮台碑铭》。铭云：“广州省城南海中有大虎山，为内外适中扼要之地。昔人未于此建炮台者，以其东南弥望皆水，漫无逼束故也。余以丁丑冬阅虎门水师。生活费兵船出零丁、鸡颈诸外洋，遍观内外形势及澳门夷市而归，乃择于大虎山筑建炮台。或曰：山前弥望皆水，若贼船不近山，岂能招之使来受炮耶？余曰：此即昔人所以不于此建炮台之故也。岂知水虽弥漫，而沙厚积于远水之底，外潮内江，急水深泓，所浚涤而行者，皆近此山之根。爰乘小船亲测之近山者其深数十丈，若远至百丈以外渐浅矣，二百丈大舟不能行矣。筑台周一百廿丈、高丈八尺，女墙三十六，神庙、药局、兵房毕具，置大炮自七千斤至二千斤者三十位，发之能击三百丈之外，此无异对面有山逼而束之，使近出此山之前也。此台之外，有沙角炮台为第一门户，进而横档、镇远为第二门户，此大虎为第三门户。又于大虎之内新建猎德、大黄二炮台为第四。方今海宇洽羡，无事于此，此台之建，聊复尔耳。然安知数十年后，不有惧此台而阴弭其计者；数百年后，不有过此台而自取其败者？”（《揅经室二集》卷七）
是夏，撰《国朝汉学师承记序》。序曰：“两汉经学，所以当尊行者，为其去贤最近，而二氏（按指程颢、程颐和朱熹）之说，尚未起也。……我朝儒学笃实，务为其雅，务求其是。……读此可知汉世儒林家法之承授，国相学者经学之渊源，大义微言，不乘不绝。而二氏之说不攻自破矣。”《国朝汉学师承记》为江藩所作。江藩，江苏甘泉县（今扬州市）人，字子屏，号郑堂，又号节甫。监生，是汉学大师惠栋再传弟子，曾受阮元聘为淮安丽正书院山长。嘉庆二十三年应邀入两广督署为幕友，向元出示其苦心经营十年的《国朝汉学师承记》。是书由督署刊刻元为之序。
五月，再陈预防英吉利事宜一折。折略云：“定例夷人货船不准擅入内洋，……查英人惧强欺习，其伎俩长于水、短于陆；强一外洋，短于内洋。汪洋巨海中，横行无忌，不值与之相角。倘为例禁驶进炮台地界，则以石台之炮，攻木板之船，使彼望而生怯，其势如鱼困辙，一人之力，足以制彼数人。”……嘉庆帝五月十一日谕示：“国家抚驭外夷，具有一定规制，尺寸不可稍逾。……断不可孟浪从事，先启兵端；亦不可过不怯弱，使彼无所畏惧也。”（《清实录·仁宗嘉庆实录》）
五月十六日，兼署广东巡抚事。广东巡抚陈若霖调补河南巡抚。至七月二十二日卸署巡抚事。新任广东巡抚李鸿宾到粤。
七月十三日，奏署碣石镇右营守备事右哨千总王上用玩误洋务，请旨革职发遣，并将缉辅出力之署香山协守备郑位恳恩最加鼓励。嘉庆帝谕示准奏。(www.xing528.com)
七月，设沿海扮商诱缉小兵船。先是洋盗虽已投诚，而海边小盗船间尚窍发，凶莅作后，拿办数船，即已敛迹。惟中路东西有小匪船伺劫，并无枪炮，但在浅滩小港之间，官兵船大不能入浅，一经察见追拿，此船却走入浅沙，抛弃刀械，四散而去。凶谓此等如蝗有蝻，尤宜扑灭，遂立扮商诱缉法，东自南澳，西止吴川，分为三段，州县配民船，加配弁兵，扮作客商，专走浅沙小港，诱缉小匪，从此小匪亦皆净尽矣。近年因无盗，有议撤者，元曰：养猫所以捕鼠，若无鼠而不养猫，鼠又出矣。
十月十八日，往肇庆阅兵。遂次奉上谕，往广西会同钦差侍郎熙昌查办藩司富纶事。十一月初三日返至肇庆，以熙昌在湖南病故，故回广州候续派大臣。
十月，奏暹罗国进贡正船在洋遭风，副船先已抵粤一折。暹罗国为明年嘉庆六旬万寿庆节遣使备进方物。嘉庆帝十一月初一谕示，着阮元等令该副贡使暂和在粤休息，一面确查正贡使下落。
十一月十五日，奏纂《广东通志》。折略云：“检阅《广东通志》，系雍正九年所修阅，今几及九十年，其间沿革损益甚多，且原书体例本未尽善，《钦定四库全书提要》称其‘冗蔓舛驳’应即乘此查取事宜是，将通志详加纂正。……现经设局编纂，会同斟酌体例，粗有端绪。委粮道卢元伟为提调，延辛卯翰林原任浙江温处道陈昌齐、辛酉翰林刘彬华、江苏监生江藩等分任纂校，所有经费等项目系筹捐，撙节办理，约计一年有余可以成书。”（道光《广东通志·卷首》）至道光二年（1822年）三月二十八日，《广东通志》成。共书二十六篇三百三十四卷。
十一月，奏请仍以分发知县王道行署理归善县知县。十二月奏请以沈德溥调补海阳县知县。嘉庆帝均以与例不符驳回。（《清实录·仁宗嘉庆实录》）
是年，奏请潮桥埠盐定价量为调剂。嘉庆二十四年（1819年）八月又奏潮盐续有积欠，请酌疏积引一折。嘉庆二十五年（1820年）十一月奏请潮桥行盐应销二十四年正引分年带运。道光元年（1821年）九月奏称潮桥商力疲乏，恳请将捐款展缓，并暂拨运本，专办疲埠悬引。道光三年（1823年）、五年（1825年），复奏展缓潮桥盐新旧奏销限期。（《清实录·仁宗嘉庆实录》、《清实录·宣宗道光实录》）
是年，调集两省兵丁，围剿粤、桂交界之姑婆山，编成保甲。广西富、贺怀集，广东连州、阳山等处多盗，捕急则拥枪入贺、连交界之姑婆山，兵役退则又聚集劫抢富家典铺。元调集两省弁兵丁役，三路围入，将姑婆山等处一概搜净，焚拆窝穴，编成保甲，于是两省交界得安。 （《雷塘庵主弟子记》卷五）。
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