民办高校办学经费来源渠道相对单一，经费存量匮乏成了制约民办高校可持续发展的“瓶颈”。国外（尤其是发达国家）私立大学的经费来源是多种渠道的。在日本，学费是绝大多数院校的主要收入来源，占其总收入的70%左右，其中政府财政资助和社会服务收入是日本私立高校持续健康发展不可缺少的重要因素。进入20世纪80年代后，虽然由于日本经济不景气，补助金的年增长率有所降低，但从1998年的数据来看，政府资助在私立院校日常经费收入中比重仍占到11.8%。美国私立大学办学经费来源也呈现出多元化，除了学费这一最主要、最稳定的收入外，还有社会捐赠（14%）、政府资助（17%）以及私立大学的社会服务收入（23%）。多元化的收入来源，为私立高校的健康持续发展奠定了物质基础。可以说，没有多元化收入来源，美国、日本私立高等教育就不可能有今日这样的地位。与国外私立高校经费多样化形成强烈反差的是，目前我国民办高校除了向学生收取学费以外，政府给予的教育补贴相对较少，其他捐助形式收入几乎没有。因此，绝大多数民办高校学费占其总收入的85%以上，甚至100%。
民办高校这种以学费为单纯融资渠道的办学模式必然会使其在校舍、图书资料、实验室等硬件设施方面越来越难以适应教学的需要。经过十多年的发展，一些具有较大规模、较好效益的民办高校逐步摆脱了无固定校舍、无实验设施、无图书资料的困境，办学条件有了较大的改善。但毋庸讳言，由于办学成本在不断攀升，以及大量广告费用的支出直接挤占了办学经费，使学校在教学设备的添置、教学条件的改善以及教职工工资待遇的提高等方面投入减少。许多民办高校在占地面积、校舍建筑面积、仪器设备、图书资料等硬件设施方面呈现严重匮乏的状况。一大批民办高校没有自己的校舍，学校用房以租赁、借用为主，而租借的大多为民房或企事业单位闲置的厂房、旧楼，并不一定适合用作教育教学用房；有的学校在办学初期没有图书馆、阅览室、实验室，甚至连活动场地也没有，学生宿舍、食堂和教室混杂在一起，水、电、消防等设施存在安全隐患；有的学校甚至分散在四五个校区，非常不利于管理，直接影响了教育教学质量。(www.xing528.com)
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