2000—2012年，C9高校年校均论文2392篇，JRU年校均论文2871篇，RG年校均论文2241篇，AAU年校均论文2765篇。可以看出C9高校论文校均规模略高于英国RG的校均论文数，低于美国AAU和日本JRU的校均论文数。C9高校论文在数量上经历了一个明显的追赶期。2000—2005年期间，除2002年以外，C9高校论文数量均保持了20%以上的增速，2006-2012年期间，C9高校学科论文增速则均低于15%。增速放缓是从2006年开始的，到2012年增速降至8.61%。与2001年相比，2012年下降了近15个百分点。同期JRU、RG、AAU则均保持着稳定的、缓慢的增速，年均增速分别为0.71%、3.10%和3.13%，个别年份还出现负增长情况。C9高校自2006年以后论文增速放缓与学科更加重视内涵建设有关，学科建设正逐渐由重视论文数量向重视质量转变，而国外的这几个高水平大学群体则一直重视质量建设，并未追求论文数量。
被引论文比例，反映出一所高校的论文吸引全球学界关注的程度，从一个侧面揭示出一所高校论文在一定数量规模基础上的质量表现情况。从表1-1可以看出，2000—2012年C9高校被引论文比例低于JRU、RG、AAU，分别低了4.68%、7.44%、8.02%。值得注意的是，C9高校论文质量整体上与世界一流大学的差距在缩小，其中发生明显变化的是在2006年以后，比如2005年C9高校与JRU、RG、AAU被引论文比例，分别相差7.20%、9.77%、10.29%，到2006年其差距则分别下降到5.01%、7.58%、8.34%，普遍下降了2个百分点。2007年与2006年比较，C9高校与它们的差距普遍下降了5个百分点，分别降至2.71%、5.18%、6.18%，这与前文分析的C9高校在2006年以后降低论文增速，转而重视论文质量相关。
表1-1 2000—2012年C9高校与世界一流大学论文数、被引论文比重的比较情况（单位：百分比）
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续表
注：表格中论文篇数的年均值是指2000—2012年每校的均值。
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