神交社成立后，除了在上海愚园举行过一次雅集外，并未能开展什么活动；高旭曾征集稿件，准备出版《神交集》，也没有成功。从1908年年初起，陈去病等人再次从事结社的努力。
1907年12月，刘师培自日本回国。刘师培出身于治《春秋左氏传》的书香门第。1903年改名光汉，以示“攘除清廷，光复汉族”之志，同时又以“激烈派第一人”等为笔名，在上海报刊上发表过不少鼓吹革命的文字，算是一位有学问的革命宣传家。他的归来自然受到陈去病等人的热烈欢迎。1908年初，陈去病、高旭、柳亚子、沈砺等四人在上海设宴为刘师培洗尘。席上，陈去病想起了逝世不久的冯沼清，提议完成他的未竟之志，组织文社，进行反清宣传。有诗云：
星辰昨夜聚，豪俊四方来。别久忘忧患，欢多罄酒杯。文章余老健，生死半堪哀（谓冯沼清）。待续云间事，词林各骋才。
——《无畏、天梅、亚卢、嘐公翩然萍集，喜成此什》
云间事，指夏允彝等在松江组织幾社。“待续云间事”，即指步武幾社的后尘，组织反清的革命文学团体。刘师培没有对陈去病的建议明确表态，他在《步佩忍韵》一诗中说：
老木清霜黄歇浦，故人应讶我重来。海天归棹人千里，江国消愁酒一杯。尽有文章志离合，似闻欢笑杂悲哀。四方豪杰今寥落，越水吴山汩霸才。
大凡“左”得快的人“右”得也快。刘师培去了一趟日本，接受了当时最时髦的思潮——无政府主义，于是反对孙中山，大闹同盟会，最后和自己的老朋友章太炎也吵得不可开交。这时，他正准备暗中向端方自首，归顺清朝，他自然不愿多谈政治，只表示赞成以文章记述“离合之感”。
积极支持陈去病的是高旭。他在《次佩忍无畏韵》一诗中说：
到头时事何堪说，地老天荒我始来。幾复风流三百首，竹林豪饮一千杯。尽教黄种遭奇劫，端为苍生赋《大哀》。尚有汨罗须蹈去，江山如此不宜才。
这里提到了幾社、复社，提到了竹林七贤，正是神交社的老路子，他主张“端为苍生赋《大哀》”，为拯救民族的危难而写作。
柳亚子的和诗为《海上即事次巢南、慧云韵》：
天涯旧是伤心地，裾屐丛中我再来。把臂恍疑人隔世，浇愁端赖酒盈杯。琵琶天宝龟年怨，词赋江南庾信哀。莫管存亡家国事，酒龙诗虎尽多才。
诗中，提到了安史乱后流落江南，以琵琶诉怨的李龟年，提到了沉沦北国，写作《哀江南赋》的庾信，显然，在文学主张上，他是高旭的同调。
从上述陈、高、柳三人的唱和之作看，他们在结社问题上取得了一致的意见。1月12日，陈去病等人再次聚宴于上海的一家酒楼。这次的参加者除原有的五人外，又增加了《神州日报》的主编杨笃生以及邓实、黄节、朱少屏、张家珍、刘师培的妻子何震等六人。席上，一致同意结社。柳亚子兴奋之极，即席赋诗道：
慷慨苏菲亚，艰难布鲁东。佳人真绝世，余子亦英雄。忧患平生事，文章感慨中。相逢拼一醉，莫放酒樽空。
——《偕刘申叔、何志剑、杨笃生、邓秋枚、黄晦闻、陈巢南、高天梅、朱少屏、沈道非、张聘斋海上酒楼小饮，约为结社之举，即席赋此》
何震也是个无政府主义者。当时东京无政府主义刊物《天义报》即是由何震出面创办的。所以柳亚子把她比为苏菲亚，而将刘师培比为布鲁东。在中国近代史上，无政府主义以它否定一切的决绝态度倾倒了不少苦于封建压迫的年轻人，柳亚子也是如此。要认识无政府主义的本质和危害，还需要一个长期的过程。这次雅集，和神交社一样，也拍了一张照。高旭有诗道：
伤心幾复风流尽，忽忽于兹三百年。记取岁寒松柏操，后贤岂必逊前贤。
余子文章成画饼，习斋学派断堪师。荒江岁暮犹相见，衰柳残阳又一时。(www.xing528.com)
——《丁未十二月九日国光雅集写真，题两绝句》
岁寒而知松柏之后凋，高旭勉励结社同人永葆气节。他相信：“后贤”们一定会创造出比“前贤”更值得人们赞叹的业绩。清初，博野人颜元提倡“经世致用”，强调“习行”、“习动”，反对读死书、说空话，形成著名的“习斋学派”。高旭建议以之为榜样，写作于社会、国家、民族有用的文章。
大概前述五人聚会只是商量，而十一人聚会才正式决定结社，所以后者被陈去病看作是南社的权舆。他在《高柳两君子传》中说：“至丁未冬，复与余结南社于海上，而天下豪杰咸欣然心喜，以为可藉文酒联盟，好图再举矣。”不过，应该提出的是，高旭的诗题称1月12日的聚会为“国光雅集”，可见当时还没有出现南社的名称。根据现存文献资料，南社定名是在此后的几十天内。
陈去病始终不能忘情于秋瑾。2月25日，他和徐自华一起在杭州西湖为秋瑾下葬并在凤林寺举行追悼会，同时成立纪念性的组织秋社。事毕，陈去病作诗赠给徐白华及秋社同人，并遥寄诸宗元、高旭、柳亚子等人索和。陈诗云：
岳坟于墓久荒凉，苍水冤沉孰表章？不信中朝元气尽，只令儿女挽颓纲！
玄酒棻香次弟陈，衣冠如雪拜佳人。道旁妇孺争垂涕，道是鲁连耻帝秦。
诸君高谊薄云天，千里殷勤挂纸钱。我为陈词酬一斝，好将心事达重泉。
——《正月二十四日，在西泠会葬璇卿秋子，既迄事退而有作。示寄尘女士洎秋社同人，亦遥寄贞壮、天梅、亚卢索和焉》
高旭、柳亚子等均有和诗，高诗云：
胡尘滚滚待澄清，惆怅江南野吏亭。翘首天涯酹杯酒，表章义烈眼垂青。
新亭高会事成尘，痛哭荒江后死人。十万横磨剑安在？愤来我亦欲逃秦。
——《巢南在西泠会葬秋女士以诗四章索和即步原韵寄复并示秋社同人》
陈诗、高诗都发表在当时上海的报纸上。它既是对“义烈”的表彰，也是对清政府的抗议和示威。
在为秋瑾治丧的活动中，陈去病深为徐自华的侠义精神所感动，为之题诗集说：
天生风雅是吾师，拜倒榴裙敢异词。为约同人扫南社，替君传布廿年诗。
——《题忏慧诗集》
这是南社一词最早见之于文献。稍后，柳亚子也有《海上题南社雅集写真》诗，感叹于人员分散，活动寥落，注称：“南社诸子时在海上者，唯朱少屏、沈道非两人而已。”[6]大概这一时候，陈、高、柳三人已就社名问题取得了一致意见，因而可以公之于世了。
古诗云：“胡马依北风，越鸟巢南枝。”从日本归国后，陈去病便很喜欢这个南字。他不仅改字巢南，而且诗集也命名为《巢南集》。他后来解释说：“南者，对北而言，寓不向满清之意。”[7]定名南社，正是为了表现他们的反清主旨。
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