1987年5月，《国家教育委员会关于改革高等学校科学技术工作的意见》出台，对高校科技改革与发展作出了部署，指出高等学校“应根据国家需要和特点，有区别、有层次地安排研究工作”，“加强与中国科学院和产业部门研究所的联系，探索增进联合、协作的途径和模式”。“在基础性研究方面，逐步建立一批面向国内外开放的主要从事基础研究和应用研究中基础性工作的研究实验室；在应用研究与技术开发方面，逐步形成一批与产业界密切联系或结合的、以开展基础工程科学研究和综合性技术开发与试验为重点的工程研究中心。”“为了长期稳定地在某些领域进行重大科学研究，可以有重点地建立一批相对稳定、确有特色而又精干的专门研究机构。”
某科研院所的一名行政人员W老师在谈到了本院科研工作取得的成绩：[22]
去年，我们院科研工作重点抓质量建设，各类课题立项120多项，其中，国家级课题比2011年所占比重有所上升，研究的水平得到了广泛的认可，承担的许多课题对国家规划的制订具有十分重要的参考意义。院里发表了603篇学术论文，与2011年相比增加了100多篇，其中许多发表在权威期刊上，另外，我院还出版了67部学术著作，比2011年增长了8部，进一步扩大了我院的学术影响力。我院为本地经济社会发展和省委、政府服务，做好“智囊团”方面作出了积极贡献。(www.xing528.com)
国家经贸委自1992年开始实施“产学研联合开发工程”，“863计划”、“工程研究中心建设”，也对高校与科研院所的合作进行了重要探索。高校与科研院所合作的发展从新中国成立初期的政府指令型模式到20世纪80年代的政府指导推动型结合模式，到了20世纪90年代中后期出现了市场需求主导型模式，高校与科研院所合作主要以法律合同形式规定权利义务。高校与科研院所通过合作在生物工程、信息技术、新材料等领域，科技成果产业化进程明显加快，形成了大批具有自主知识产权的核心技术和成套设备，培育了一大批经济增长点，取得了明显的经济效益和社会效益。
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