合校以来，学校研究生教育在规模扩大的同时，培养质量不断提高，研究生发表的国际论文数量逐年增加，研究生积极参与学校的科研课题，成为繁荣学校科学研究事业的生力军。据统计，六大检索(SCIE、SSCI、AHCI、EI、ISTP、ISSHP)收录武汉大学为第一作者单位的国际论文的绝对数(减去各库重复数)从2000年的437篇，增加到2003年的1184篇，再增加至2006年的2512篇，其中60%以上的第一作者是研究生，90%以上由研究生参与完成(数据来源:《武汉大学国际论文统计与分析年报》)。据统计，2007年，学校研究生共发表论文4460余篇，其中在三大检索刊源期刊发表论文1950篇;2008年学校研究生共发表论文6088篇，其中在三大检索刊源期刊发表2113篇。1999—2012年学校共入选全国百篇优秀博士学位论文18篇，56篇博士学位论文获得全国百篇优秀博士学位论文提名奖，在湖北地区高校中位居第一。十余年来，学校研究生中涌现出了一大批拔尖创新人才和创新团队，在全国“挑战杯”大学生创业计划大赛、全国研究生数学建模竞赛、电子商务大赛、电子设计大赛等多项比赛中摘得桂冠，囊括2007年“新世界数学奖”、2008年美国电气及电子工程师学会(IEEE)最佳学生论文奖、2010年“百人会英才奖”、2012年“礼来亚洲杰出研究生论文奖”等多项奖项。
在2007年度在全国首次开展的“做出突出贡献的工程硕士学位获得者”的推选、表彰活动中，学校工程硕士共有4人(全国共181人)获得国家首批“做出突出贡献的工程硕士学位获得者”荣誉称号。2010年，学校法律硕士、工程硕士(测绘工程)、工商管理硕士3个专业学位被批准成为湖北省唯一一所部属高校开展专业学位研究生教育综合改革试点专业，学校当选为全国50所“工程硕士研究生教育创新院校”之一。
近年来，学校研究生教育在研究生招生、培养、专业学位、就业、学位点建设、导师队伍建设、管理体制等方面进行了全方位改革，在国内的影响力与日俱增，在很多方面都发挥了引领和示范作用。国务院学位办不仅委托学校起草《中国学位与研究生教育发展规划战略研究总报告(2005—2020)》(2004年)，由学校承办“建设研究生教育强国”主题研讨会(2008年)，而且还从“研究生教育创新计划”拨付专款对学校研究生教育改革与发展予以重点支持和立项建设。从2003年至今，在教育部“研究生教育创新计划”中，学校已有17个项目获得批准，资助总经费达188.5万元(2010年后国家只立项没有专项拨款)。在国务院学位委员会第六届学科评议组中，学校有18名学科评议组成员，比上一届增加2名，总数名列全国高校第七。
武汉大学“全国优秀博士学位论文”获奖名单(www.xing528.com)
国务院学位委员会第六届学科评议组成员名单(武汉大学)
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