1927年2月16日，武昌中山大学正式颁布了《学校组织大纲》。
大纲规定，本大学以研究高深学术、养成革命人才为宗旨，大学之中的一切组织悉依民主集中制的原则行事。学校设大学委员会、教务处、行政处、监察处以及各种常设委员会。学校设立大学院(相当于研究院，在没有毕业生前暂不设立)及文、法、理、商、医、预6科，各科下设若干系(部)。学制为预科2年，本科4年，医科5年。课程分为通习、必修、选习、政治训练4类。
大纲规定，大学委员会总揽政务，由国民政府任命，5人组成，5人中选一人为主席，所有委员必须是国民党党员，是办过教育富有经验者。大学委员除共同负责校务外，还须分任教务行政、政治训练、监察事务、自治事业等。
大纲规定，教务处由教务委员会组织，下设文、法、商、理、医、预科各科委员会。各委员会选主席一人，同时兼任各科教授会的主席。各委员会主席合组教务会议，从各科主席中选一人为教育长，教务会议由大学委员会指挥，决定全校有关教务事宜，教育长执行教务会议的决议。各科的教务工作由各科委员会议决。系主任由各科教授会选举，各系教务工作由系主任商同各科委员会筹划办理。教育长、各科委员和系主任的任期均为一年。
大纲规定，大学委员会经教授总会同意，从教师中选出3人组成行政委员会，负责行政工作，主要负责人为行政长。行政委员会3位委员中，一人负责注册部、秘书部;一人负责财务部、庶务部;一人负责图书部、仪器部及出版部。上述7个部除秘书、财务两部外，都直接受教务处指挥。(www.xing528.com)
大纲还规定，学校设立监察处，负责规章制度的监督执行;设立政治训练委员会，负责政治训练。推选董必武、陈潭秋、钱介盘(钱亦石)为武昌中山大学政治训练委员会委员。
武昌中山大学虽然开办时间不长，但特色鲜明。在招生方面，先让学生报到注册，然后于3月15日举行编级考试，规定在秘密时期参加革命工作且确有成绩者准予免去入学编级考试;在教学制度上，采用学分制，各科修满应修学分后即可毕业。
1927年7月10日，武昌中山大学举行第一届学生毕业典礼。校务委员章伯钧在大会上对黄焯等152名毕业生提出了三点希望:第一，注意革命的科学精神和革命的科学修养;第二，注意革命人格的修养;第三，实行整个的革命的三民主义。毕业典礼在“到农村中去，到军队中去”、“拥护总理的三大政策”、“打倒蒋介石”等口号声中结束。
武昌中山大学是国共两党第一次合作的结晶，其教学活动是在复杂的环境中进行的，是在破除旧教育、建设新教育的斗争中开展的，其成绩来之不易。
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