一九二〇年七月六日，冯部奉调离开常德北上抵达汉口，停留在谌家矶待命。在途中直皖战争爆发，给养、饷项均无着落，处境困难。冯曾致书孙中山表示今“虽扼于环境，未能追随，但精神结合，固已有日。”孙得信后即派徐谦和钮永建持亲笔书信前来慰勉，并携来大批革命书籍相赠。这些书交由鹿钟麟妥善保管，鹿因得以优先阅读，受到很大启发。后来鹿常常津津乐道这段阅读孙先生著作的经历。
直皖战争以皖系失败而结束，直系当权，原陕西督军陈树藩属于皖系，随由直系第二十师师长阎相文继任。陈拒阎入陕，阎率本部外，请调第七师吴新田，第十六混成旅冯玉祥两部同往，以武力接收。一九二一年冯部进抵潼关，阎相文即以冯为先锋向西安进军。经过三路激战，终于到达西安城下，陈树藩逃走。阎相文入城接任后，以冯部立下战功，电请曹锟将该旅扩编为第十一师，冯任师长。阎相文接任陕督后，因环境恶劣，任务艰巨，力不从心，不久便服毒自杀。冯玉祥继任陕西督军，也深感局面难撑，窥机企图摆脱，鹿钟麟不断为之出谋划策。冯曾说“：鹿瑞伯智勇稳练，堪任繁巨，作战有作战办法，作事有作事办法。”
一九二二年四月第一次直奉战争爆发，曹锟任命冯玉祥为后方总司令，坐镇洛阳、郑州。时河南督军赵倜，佯与直系靠近，暗与奉军勾结，冯以全力击溃赵倜部队。战争结束后，曹锟任命冯为河南督军。鹿钟麟被任为河南全省警务处处长兼省会警察厅厅长。鹿到职后，大力扭转社会风气，提倡朴素生活，禁娼禁赌，破除迷信，驱逐僧尼，捣毁神像，将庙宇寺观一律改为学校。河南信阳一带出现匪患，为害乡民，鹿钟麟又被任为河南剿匪司令，驰赴豫南进行清剿。冯玉祥所部自陕西到河南一段时期里，不断扩充军队，截至一九二二年十月底调离河南，已拥有一个师（辖第二十一、二十二两个旅）和第七、第八、第二十五三个混成旅，达二万余人。时鹿钟麟任第二十二旅旅长。(www.xing528.com)
一九二二年十月三十一日北京政府免去冯玉祥河南督军职，调任陆军检阅使，所部随同开往北京，大部驻扎南苑，其余分驻城内及通州。冯部在此驻防约二年余，加强了部队官兵的教育训练，同时进一步密切与孙中山的联系，信使来往不绝，接受孙的教导和指示。这是后来发起北京政变的内在因素。当时鹿钟麟受冯玉祥之命，也积极参与了这些工作。
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