1986年，甘肃商检局对首批提出出口食品厂、库卫生注册申请的5家食品厂（库）进行考核，其中4家达到要求予以注册颁证。1987年，甘肃商检局对5家出口食品厂、库进行卫生注册考核并颁证。1988年，甘肃商检局下发《甘肃省出口肉类产品检验与监督管理办法（试行）》，同年，对5家出口食品厂进行卫生注册考核并颁证。1989年，甘肃商检局对5家获证一年以上的食品厂进行了全面复查。1990年，甘肃商检局对3家出口食品厂、库进行卫生注册考核并颁证。
1991年，国家商检局公布《出口食品厂、库登记卫生要求（试行）》，初步建立起完整的出口食品厂、库登记卫生监管体系，当年8月1日起施行。同年10月15日，甘肃商检局下发《甘肃省出口脱水蔬菜卫生注册管理办法（试行）》和《甘肃省出口食品厂、库卫生注册质量管理考核要点（试行）》，结合甘肃省实际情况和产品特点落实出口食品厂、库登记卫生监管要求，全年对3家出口企业进行了卫生注册考核。1992年，国家商检局颁布《出口肉类、罐头、水产品注册厂问题的检査处理办法》，细化3大类产品检验监管要求。当年，甘肃商检局对5家出口食品企业进行了卫生注册考核。1993年，国家商检局印发《出口食品生产企业向国外卫生注册管理规定》，初步建立出口食品生产企业向国外卫生注册管理制度。同年10月13日，甘肃商检局下发《甘肃商检局“三证”考核评审工作程序》，建立了统一的考核评审步骤和内容。当年办理1家企业卫生注册，考核复査4家企业，获卫生注册证书的食品厂、库达到25家。
1994年，国家商检局修订《出口食品厂、库卫生注册细则》和《出口食品厂、库卫生要求》，同时下发《关于出口食品厂、库注册登记有关事项的通知》，就有关出口食品厂、库卫生注册登记的代号管理做了具体规定。当年，甘肃商检局对卫生注册资格到期的12家企业和新申请的4家食品厂、库进行了考核，对其中11家颁发了卫生注册证书。1995年，国家商检局相继发布《出口畜禽及其制品加工企业注册卫生规范》《出口罐头加工企业注册卫生规范》《出口水产品加工企业注册卫生规范》等规范文件，进一步细化了各大类主要出口产品注册的卫生要求。当年，甘肃商检局考核6家企业并颁发卫生注册证书。1996年，甘肃商检局完成8家出口食品生产厂、库的复査和考核。1997年，19家企业向甘肃商检局提出卫生注册考核、复查申请，经评审准予颁发卫生注册证书13家，6家企业复查不合格予以注销卫生注册证书。1998年，8家企业经甘肃商检局复查和考核准予注册。
1999年，国家检验检疫局颁布《质量许可和卫生注册评审员管理办法》，建立了质量许可和卫生注册评审员的选拔、培养、考核、评定和管理机制。甘肃检验检疫局当年对5家出口食品生产企业进行复查、考核，全部颁发卫生注册证书。2000年，甘肃检验检疫局对注册的全部35家企业进行了检查和清理整顿，对17家到期复查企业进行了考核，对新申请卫生注册的3家企业进行了考核并予以颁证，注销了9家常年不生产出口食品及破产的企业注册证书。2003年，甘肃检验检疫局共收到21家企业卫生注册申请，主动上门服务指导18家企业，现场评审15家企业，其中7家企业注册颁证。2004年，甘肃检验检疫局收到25家企业卫生注册申请，其中现场评审通过企业9家，整改企业16家。年度到期复查企业18家，3家企业现场评审不合格注销证书。当年除新增葡萄酒类、罐头类、蜂蜜和糖类生产企业外，出口肉类生产企业明显增多。2005年，甘肃检验检疫局共收到30家企业卫生注册申请，符合申请条件企业20家，对其中13家进行了现场咨询指导，10家企业通过文件审核和现场考核获得卫生注册证书。年度到期复查企业17家，7家企业经评审不合格，注册证书被吊销或自动失效。
2006年，甘肃检验检疫局结合实际制定《卫生注册登记工作指南》《卫生注册登记评审员工作指南》《卫生注册登记工作程序指南》等5项工作制度，并制定了《甘肃出口食品卫生登记注册初步评审和综合评审程序》及相关文件，有效提高了卫生注册登记工作效率，规范了行政许可行为。按照国家质检总局开展的“质检系统食品行政许可专项检查”工作要求，甘肃检验检疫局组织相关部门对食品安全相关的行政许可项目进行了自查，重点从行政许可工作中实行“审查、批准、监督”三分离情况、“食品许可”八公开情形、行政许可工作有效性等方面进行了对照检查。对存在的问题及时进行了纠正，进一步明确了卫生注册登记许可工作的流程和岗位责任，提高了行政许可工作的水平。当年，甘肃检验检疫局共收到22家企业卫生注册登记申请，经评审8家企业予以注册登记，14家企业未予注册登记，相关企业主要问题是基础设施不符合卫生要求或卫生质量体系未有效运行。
2007年，甘肃检验检疫局共收到62家企业卫生注册登记申请，到期换证复查企业20家，其中通过评审注册登记企业57家，评审不通过企业25家。全年证书注销和自动失效企业10家，吊销2家企业证书。其中，首次受理植物源性食品出口卫生登记申请35家次，其中通过评审登记企业33家次。通过注册登记证书到期复查换证实现“汰劣促优”，20家复查企业中有4家企业未通过评审注销证书。
2008年，甘肃检验检疫局共收到37家企业卫生注册登记申请，受理申请31家次，通过评审注册登记企业30家，评审不通过企业1家。全年复查换证企业19家，新增植物源性食品企业44家。
2009年，甘肃检验检疫局共接到卫生注册登记、换证复查、变更、扩项等各类申请62家次，其中受理申请40家次；通过评审，新增注册登记企业11家，复查换证企业14家，变更企业3家，扩项企业6家，不予许可企业6家；全年自动失效/注销企业5家，暂停出口报检企业1家。按照国家认监委关于全面清查出口食品备案企业的要求，甘肃检验检疫局结合对出口食品企业的日常监管、定期监管、监督抽查、换证复查，以及企业接待国外检查、食品安全专项整顿、日常检验检疫监管等工作，对全部83家出口食品备案企业进行了100%的清查，对其中21家企业提出了限期整改要求，并对企业整改情况逐一进行了跟踪验证。
2010年，为降低食品生产加工企业的产品因不正当商业目的、行业恶性竞争、反社会等原因遭到蓄意破坏的风险，甘肃检验检疫局向各出口食品企业下发了《关于建立实施食品防护计划的通知》，确定出口果汁、番茄酱和其他罐头生产企业23家为首批必须建立实施食品防护计划的企业，通过举办培训班等方式，指导辖区内敏感产品和对敏感国家出口的企业建立实施适合自身特点的食品防护计划，提高企业应对非传统食品安全问题的能力。截至2010年底，甘肃省共有55家企业建立食品防护计划，占89家在册企业的61.8%。当年，甘肃检验检疫局共接到卫生注册登记、换证复查、变更、扩项等各类企业申请共64家次，其中受理申请41家次；通过评审，新增备案/注册企业15家，复查换证企业19家，不予许可企业3家，变更企业3家，扩项企业1家；全年自动失效/注销企业8家，暂停出口报检企业2家。
在国家质检总局、国家认监委的正确领导下，甘肃检验检疫局结合辖区实际探索开拓出口食品卫生注册登记及监管工作，省内出口食品生产企业安全卫生管理水平不断提升。截至2010年底，全省注册登记企业共89家，其中登记类企业21家、脱水果蔬类企业20家、罐头类企业16家、果汁类企业8家、其余企业24家，分别占企业总数比例24%、22%、18%、9%、27%。按地域分布，张掖市18家、庆阳市17家、酒泉市13家、兰州市9家、其余各地市32家，分别占企业总数的20%、19%、15%、10%、36%。详见表6-1-1。
表6-1-1 2010年甘肃省出口食品卫生注册登记企业名录(www.xing528.com)
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