为了全面贯彻1958年9月中共中央、国务院在《关于教育工作的指示》精神，学院强调要以马列主义、毛泽东思想为指导，坚持贯彻“教育必须为无产阶级政治服务，教育必须同生产劳动相结合，培养德、智、体全面发展的有社会主义觉悟的、有文化的劳动者”的教育方针。学院组织一些人员编制教学计划、教学大纲。计划偏重实践，强调劳动，削弱了理论教学。明确规定每学年学生的劳动时间不能少于3个月。由于过多的挤占专业课教学时间，致使教师在教学中，对许多应该让学生掌握的理论知识因课时不够而不得不删减，影响到学习内容的系统性和完整性。
随着教育革命的深入，学院提出要革新旧的教学体系，建立无产阶级教学体系。在教学形式和教学方法上，采取学习与整风相结合、与学术批判相结合、与科学研究相结合等形式，组织学生直接参加工程施工单位的劳动和学术领域中的争鸣。
学院积极认真地贯彻党的教育方针，应该说是正确的。但由于当时受到“以阶级斗争为纲”思想的影响，在执行中又有“左”的干扰，因此把劳动列为正式课程，贯穿在整个教学过程中，挤占课堂教学和学生休息、自习时间，加重了学生的学习负担。譬如，首届入校学生就参加了3个月的建校劳动，接着又组织了师生200多名赴水利建设工地参加施工劳动。仅1959年一年中参加水利水电建设施工劳动的师生达500人次，先后到省内77个县（市）和大茅山、黄冈山、东固山、云山、西山等地135个大、中、小型水利工地和21个小水电站参加施工和劳动锻炼。(www.xing528.com)
1961年1月，根据江西省委、江西省人民委员会“关于组织省直部门支援柘林水库建设工程”的指示，学院抽调师生300余人，由教务处处长尹伟模带队到柘林水库工地参加为期4个月的劳动。
学院为保证每名学生劳动全年不少于3个月，每人发一本《劳动手册》，将劳动时间、内容等记入手册内以便备案。据统计，除在学院的东山农场、青云谱蔬菜基地、彭桥砖瓦厂劳动外，学生从1958年10月至1962年5月参加水利水电工程建设达1200人次。虽然劳动时间多，影响到正常教学工作，但是师生通过生产劳动锻炼，在提高思想觉悟，增强劳动观点、群众观点和工农感情上，却有很大的收获。仅在1959年就有16人被评为红旗突击手，26人被评为优秀共青团员。
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