公元前214年，岭南全境平定，平定后的岭南也纳入了秦王朝的郡县体制之内。
秦始皇统一六国后，采纳丞相李斯的建议，废除分封制，改行郡县制。地方行政机构分郡、县两级。郡县主要官吏由中央任免。郡设守、尉、监（监御史）。郡守掌治其郡，郡尉辅佐郡守并典兵事，郡监司监察。秦始皇最初把全国分成三十六郡，以后又陆续增设至四十一郡。
秦朝的四十一郡设置简表
（续表）
秦朝建立的中央及地方行政管理体制示意图
县，万户以上者设令，万户以下者设长。县令、县长领有丞、尉及其他属员。县令、县长主要管政务，县丞掌管司法，县尉掌握军事。
县以下有乡，其主要职能有：摊派徭役、征收田赋、查证本乡被告案情、参与对国家仓库粮食的保管工作。乡设三老掌教化，啬夫掌诉讼和赋税，游徼掌治安。
乡以下有里，是最基层的行政单位。里有里典，后代称“里正”、“里魁”，以“豪帅”即强有力者为之。里中设置严密的什伍户籍组织，以便支派差役，收纳赋税，并规定互相监督告奸，一人犯罪，邻里连坐。
此外还有负责治安、禁盗贼的专门机构，叫做亭，亭有长。亭除了主要管理治安，还负责接待往来的官吏，为政府输送、采购、传递（文书）等事。两亭之间，相距大约十里。后来成就大汉朝伟业的开国皇帝刘邦，就是泗水郡沛县下的一名亭长。
秦汉时期将岭南称为陆梁[4]，秦王朝在“陆梁地”设置了桂林、象郡、南海三郡。
南海郡下辖四县（番禺、四会、博罗、龙川），郡治在番禺（即今广州），主体范围在今广东、海南和广西东南部，面积在25万平方公里以上。桂林郡位置约在今日广西中部北部一带，面积达20万平方公里以上，郡治设在布山县（今广西贵港市）。象郡辖今广西西部、越南北部中部，治所在临尘（今广西崇左市区），面积也在20万平方公里以上。
三郡之中南海郡较为发达，是岭南百越文化的聚集中心。征伐岭南的大军全部就地安置，大军统帅任嚣首任南海郡尉，并节制岭南南海、象郡、桂林三郡，故称“东南一尉”。他在今广州仓边路附近修筑的番禺城，史称“任嚣城”。南海郡四县中的龙川，地理位置和军事价值都极其重要，大军副将赵佗被委任为龙川（今广东龙川县佗城镇）县令，龙川所管辖的是现今广东的东部和北部。赵佗在嶅山和浰水之间建造的城池，现在被称为“陀城”。(www.xing528.com)
从史书的记载来看，任嚣、赵佗在岭南的任务就是屯垦戍边，他们的部下50万人中有很多就是以有罪之身来到岭南的，朝廷并没有让他们再回到中原的打算。[5]这些人有犯罪的人、被迫害的商人、被妻子家族抛弃逐出的赘婿等等，与其说是屯垦的士兵，不如说是随军的移民。[6]赵佗也做好了率军长期驻守岭南的准备，在驻守岭南的六年后，秦二世即位，赵佗向朝廷上书请求在内地迁移30000名没有夫家的女子来岭南为士兵提供缝补的后勤工作，皇帝批准派遣15000名女子来岭南。[7]事实上这15000名女子并不是从事临时性的工作，她们将与15000名将士组成15000个家庭，而更多的将士将与土著女子成婚繁衍后代。
全球历史上，对异族异地的征伐，往往免不了清洗和灭族。幸运的是，尽管征服岭南的过程艰苦漫长，但征服后并没有出现针对百越民族的大规模屠杀。同样幸运的是，任嚣和赵佗不但是历经沙场的悍将，而且在治理地方事务上更有作为。他们并没有以来自文明地区的征服者的姿态高高在上，也没有以军阀的形象耀武扬威。他们以百越故地为家，采取温和的“和辑百越”的政策。因此，尽管随他们定居的来自中原的华夏族战士总数有限，但大都作为统治阶层很好地融入岭南，并被百越族所接受。这是历史上第一次对岭南的大规模移民，自此岭南开始进入华夏文明的体系内。
【注释】
[1]（汉）刘安：《淮南子》（广州出版社，2001年）：“秦皇使尉屠睢发卒五十万，与越人战；越人皆入丛薄中，莫肯为秦虏，相置桀骏以为将而夜攻秦人，大破之，杀屠睢。”
[2]（汉）司马迁：《史记·越王勾践世家》，北京：中华书局，1997年。
[3]（汉）袁康、吴平：《越绝书》（上海古籍出版社，1985年）：“越王子孙姓梅氏。秦并六国，越王逾零陵往南海，越人梅
从至台岭家焉，而筑城浈水上，奉王居之。乡人因谓台岭为梅岭。”
[4]（唐）张守节：《史记正义》（上海古籍出版社，1987年）：“岭南之人，多处山陆，其性强梁，故曰陆梁。”
[5]（汉）司马迁：《史记·始皇本纪》（北京：中华书局，1997年）：“始皇三十三年，发诸尝逋亡人、赘婿、贾人略取陆梁地，为桂林、象郡、南海，以适遣戍。”
[6]（清）梁廷枏：《南越五主传》（载《岭南史志三种》，广州：广东人民出版社，2011年）：“谪有罪者五十万人徙居焉，使与其土人杂处。”
[7]（汉）司马迁：《史记·淮南王列传》（北京：中华书局，1997年）：“使人上书，求女无夫家者三万，以为士卒衣补。秦皇帝可其万五一千人。”
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