关于排版，左图右文，便于对照。在常规排版上，尽量做到左面是《文渊阁四库全书》原文原图，右面是今文、注释、提示。如此编排，读者可以很方便地左右对照查阅。在特殊排版上，有时几张图片，甚至几十张图片连续排在一起，这样做既是为了保持原书原貌，又可保持文字连续性、整体性。
比如本书序号第210号至213号，总共4张图片排在一起，并集中在一起编注。集中编排的目的是方便读者查询资料，领会上下文。在《文渊阁四库全书》原书中，这4张图片本来就是一个整体。
关于页序。《文渊阁四库全书》原书是逆翻页，竖排。时代变了，阅读习惯也变了。为了便于今天及将来的读者阅读，我们改竖排为横排，改逆翻页为顺翻页，对原著中因尊崇朝廷及皇权、上司而另起段、空格的办法，不再照旧，而是按照今天的行文格式处理。
关于“今文”。为使“今文”内容准确，我们借助了许多工具书，求助了许多专家、教授，力求准确无误。对于有些易识的繁体字，限于页码空间，未加注释。比如“於”（于）字等。
关于“注释”。我们根据版面面积，尽量做到应注尽注。注释条目尽量选择容易混淆、难以理解、容易出错的三类：(www.xing528.com)
容易混淆的内容。许多常用、常见的书名、人名，常被专家、学者甚至专业出版社弄错。比如本书第417面的“文中子曰”，“文中子”是人名，指隋朝的王通，多被误译为书名。再如本书第282面的“又治《庄》《列》《周易》《参同》《龙虎太丹》诸书”，被许多专家误译为“又治《庄》《列》《周易》参同龙虎大丹诸书”。
难以理解的句子。比如本书第9面有两个常见的句子，“是俗语讹音与字变矣”和“不言过而言为者……宜以《尚书》为正耳”，许多专家理解稍有不同，意思却大不相同。再如本书第45面，“是故，延牙遂之武当……托言发兵，实避其殃”，多种版本不一。为解决这类问题，我们专门请教多位权威专家，对整句进行白话文全译。
容易出错的段落。比如本书第515面“范忠宣永州命下”整段内容，《中国古典译著丛书》《中华处世哲学》《忍经·正经·反经》等多部丛书译注各不相同，特别是“其子告惇以少师执政日与司马公论议多不合，得免行”一句中的“其子”，多误译为范忠宣的儿子，其实这儿的“其子”应该是韩维的儿子。还有的把这句话意思搞反了。对于这类的句子，我们用白话文全译整个段落。
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