1917年7月7日上午10时，祖父在南京军署就任代理大总统职，下关中外兵舰鸣炮祝贺。同日，发布就任代理大总统职通电：“上海孙中山先生、岑西林、汪精卫……诸先生鉴：国家多难，复辟之事，竟成事实，国璋闻变以后，连电各省与诸帅筹商出师，声罪致讨……黎大总统因变起仓卒，出避外署，冬日来电，援引大法，嘱以代理之任。……国璋自维才望勋绩，无一可胜重寄，而念国家政权，不绝如缕，法律事实，又无可诿，不得已遵于七月六日宣告恭代，权在南京就职。……诸君硕德宏猷，手造民国，为国璋所钦佩……尚祈在远不遗随事指导……翘起待命，不胜拳拳。”7月8日，又致电孙中山、唐绍仪、梁启超、蔡元培等先生磋商政局。7月16日，接段祺瑞第六次促祖父北上电。祖父复电：“请劝黎复职。”
父亲说：“周夫人和大姑父都不同意爷爷北上。”祖父的幕僚们（如恽宝惠等）也有人担忧，祖父迟迟不愿北上就任的原因：一是知道国内还有阻力；二是怕进京后会处于类似黎、段之争的境地，他对段太了解了。在这期间，祖父又多次电请黎复职，黎则多次电复“绝不复职”，并促其“早日进京，以安大局”。据《年谱》记载，7月26日，祖父与段祺瑞派来的代表商量北上的条件：疏通西南，化除党见；调江西都督李纯来南京接任江苏督军之职；李纯之缺由陈光远接任；湖北督军由王占元接任；将陆军第十五、十六师从南京调进北京，担任总统府的护卫，并由总统直接调遣；继续劝黎复职等等，来人一一承诺。祖父知道，副总统可以在异地遥领，而大总统则不能在异地任职，必须进京。
祖父接段祺瑞催祖父北上的第七封“四哥快来”的电报后对家人说：“你们看芝泉这个粗啊。”7月29日祖父通电北上，30日晚离宁乘专车赴京，行至浦口站，十余艘军舰鸣炮十余响以示欢送。祖母回忆说：“从南京坐火车进京，一路上只要停站，就是鞭炮、锣鼓、人山人海的欢迎，爷爷都亲自下车、摘了帽子答礼。”《年谱》记载，抵达天津时受到总统府大礼官率各部代表及梁启超、林长民等人的欢迎。8月1日抵达北京，段祺瑞等军政要人到车站欢迎。祖父立刻乘车进谒黎元洪。黎元洪与祖父的对话《年谱》有详细记载，主要是祖父一再劝其复职，黎元洪则一再表示不再复职，即请祖父正式就职，黎赴天津休养。下午在怀仁堂就职，接见有关官员及各师师长，各员向总统三鞠躬，祖父答礼。
是年9月，继祖母周夫人病重，于10日病逝于总统府。父亲说：“爷爷吊唁周夫人，是先行国礼，后行家礼。周夫人病重时曾要求爷爷，下葬时她的棺材要挨着百年后的爷爷，爷爷答应了。但在下葬入家坟时，几位大爹和大姑都不同意她的棺材挨着爷爷，应排在先去世的奶奶吴夫人之后。大爹们甚至跳下坑去阻止。爷爷后来还是听从了大爹们的意见。”9月21日，祖父谢绝政府为周夫人拨发的丧葬费数万元。
祖父在代理大总统任内，内政、外交事务繁杂，南北两方在政见及新旧国会问题上争执不断，并不断有零星战事发生。在与南方国民党人的关系、有关国家统一、是战是和等问题上，祖父主张同南方国民党人以议和为主，而段祺瑞及其段系人马则持对南方以作战为主的意见。与段祺瑞及段系人马从有不同意见到矛盾不断深化，正如祖父和一些有识之士早已料到的一样，大权实际已被权欲心极重的段祺瑞及段系人马所垄断，祖父积极向各省劝和之政策和行动为段系人马所阻。1918年3月，祖父在积极为倡导和平，指使直系督军、将领为反战而努力奋斗之时，段祺瑞却在为自己争当总统作准备，授意其手下组织“安福俱乐部”，利用金钱收买议员，意在操纵下届总统选举。祖父得知后十分气愤，已有不恋大位之意。父亲说：“爷爷对家里人说：‘这个总统我不想做了，下了任咱就回老家。’还对子侄们说：‘你们以后都不要做官，你们没那个聪明。’”(www.xing528.com)
《年谱》记载，民国七年（1918年）7月16日祖父发表谈话，不再参选下届总统，谓“西南如从策略上举我，彼同时必举副者，我不就，听副自代，我乃承认。新国会将来举徐世昌，我极赞成。……退职后不住京津，将归河间。”
“安福系”悉由“安福俱乐部”而来，本拟举段祺瑞为总统，只因段准备打内战而对日本借巨款事发，舆论沸腾，大失民心，亦不敢再做总统梦，遂造成共同拥护徐世昌参选之局面。此时，仍有人鼓励祖父继续竞选大总统。《年谱》记载，9月2日祖父面谕府中属员：“总统选举有期，大局维持有人，余下野后当于实业教育方面以效国家，东海（徐世昌）为人淡泊无私，他当选后对待府中人员不至多所更动，余甚望诸君此后仍当热心从事，以全始终。”并饬师景云向各军队宣布此意。
是年9月4日，徐世昌当选大总统。关于副总统制，祖父谓：“副总统一席余决不愿当选，余意不如以留待时局解决，公举西南首领，以示公平，将来南北纷扰不难迎刃而解。”同时亦拒徐拟聘“特别高等顾问”一职。10月10日上午9时，祖父至怀仁堂，与徐氏同向国旗行三鞠躬礼。礼毕，祖父东向致颂，徐氏西向致答词；词毕互相鞠躬，由大礼官送祖父回居仁堂，出总统府回地安门帽儿胡同本宅。小住几天后即回河间老家。此次两位总统正式交接，为民国期间唯一一次新旧总统交接礼典。民初之新旧总统和平交接何其难也！
免责声明：以上内容源自网络，版权归原作者所有，如有侵犯您的原创版权请告知，我们将尽快删除相关内容。
