1.五联会
建国前夕的1949年，正当新旧政权交接和嬗变之际，为了维护学校正常秩序的需要，云大教职员生工警分别成立了各自的组织，计有教授会、讲师助教会、职员会、学生自治会和工警联谊会等，各会定有会章，分管各自工作。同年5月，为了统一管理学校，维持校务进行，五会实现联合，组成云南大学五联会。至1950年11月，五联会活动结束。
2.临时校务执行委员会和临时校务管理委员会
1949年12月云南起义以后，至1950年2月解放军进驻昆明以前，为了维护学校正常秩序和各项工作，学校于1950年1月21日成立了云南大学临时校务执行委员会，由秦瓒任主任委员。
1950年秋，此时昆明已成立了军管会，根据西南文教育部关于接管所辖公立学校的指示，市军管会文管部特派张一夫为联络员来到云大，负责接管工作。为了顺利接管，学校又成立了“云南大学临时校务管理委员会”。至此，前执行委员会工作结束。管委会活动至1951年10月，期间其组成如下：
云南大学临时校务管理委员会
主任委员：秦瓒
副主任委员：寸树声
委员：王士魁 张瑞纶 方国瑜 杨克嵘 杜棻 张福延 张一夫 陈复光 徐文宣 王祖烈 张永立 赵瑾 关学禹
管委会下设教务处、总务处、秘书室、人事室等行政机构，以及聘任、经济、图书、教学研究、修建、人助金评议等委员会。
秦瓒（1898—1988），字镇略，河南固始人。上海圣约翰大学毕业，留学美国，入哥伦比亚大学。回国后，曾任河南大学、北京大学、西南联大教授。(www.xing528.com)
3.校长负责制的建立
1951年10月5日，政务院为了使全国各级各类学校逐渐步入正规化，以推进教育事业的发展，决定学校建立校长负责制，为此，特命云南省政府副主席周保中兼任云南大学校长，是为云大历史上第五任，也即中华人民共和国成立后首任校长。
周保中（1902—1964），云南大理人，原名奚李元，白族，中共党员。云南陆军讲武堂毕业，曾任国民革命军副师长。后去苏联学习。回国后历任东北抗日联军第二路军总指挥、解放军东北军区副司令员、西南行政委员会政法委员会主任等职。从此，云大领导体制推行校长负责制，中国共产党云南大学委员会成立以后，则实行党委领导下的校长负责制。
1952年9月，经国家主席毛泽东亲自签署任命书，调清华大学副教务长李广田任云大副校长，主持日常校务。
4.行政组织系统
1951年云大实行校长负责制，至1952年时，全校共有5院20系，及其先修科、先修班、干部班、附属单位等。共有教职员工616人，其中教师319人，职员135人，工警162人，共有学生2288人，其教职员工与学生之比约为1∶3.7，教师与学生之比约为1∶7.2，教师与职工之比约为1∶1，各种机构较为合理。同时期的校、处、院、系、科的主要行政负责人员略如表4-1：
表4-1 云南大学行政负责人员略表（1952年）
续 表
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