1986年，全省设立2个固定监测点，各县（市、区）分别设3～5个流动监测点，每年监测面积占当地灭鼠面积的1/3，3年一个周期，循环流动监测，保证监测覆盖面。3月，发现长岭血凝阳性材料16份。4月，农安县新阳乡发现2份血凝阳性材料。鼠间鼠疫流行范围在扩大，长岭从1985年3300公顷扩大到1986年10000公顷。鼠密度早春时西部地区十几个县平均密度为每公顷0.92只，比1984年同期提高20%，但鼠间鼠疫疫情仍被及时控制。
1987年，全省有7个县达到国家规定标准。1988年，大安县、镇赉县达到国家控制区标准。建立鼠疫固定监测点6处，流动监测点52处，监测面积1398814公顷，占灭鼠面积35.08%。开始试行鼠疫血清学检验质控工作。
1989年4月，对前郭和乾安县鼠疫防治工作进行考核，未发现阳性材料。考核组在两县自行考核灭鼠面积5%的基础上，抽检自行考核面积的20%。以10公顷面积为一个考核样方、用一日钢闸法，进行灭鼠质量考核。根据国家《控制鼠疫工作标准和考核方法》规定，前郭、乾安两县经过40年的长期努力，鼠疫防治工作已达到稳定控制标准。1988～1989年，在黄鼠密度高的地区进行药物灭鼠，灭鼠面积达20万公顷，鼠密度控制在每公顷1.5只左右。1990年，全省15个鼠疫县（市）有14个达到稳定控制标准。
1981～1990年，在12个县（市、区）设立51个固定监测点，338个流动监测点。
1991年，在15个鼠疫县（市）设立18个鼠疫病情监测组，其中，固定监测组4个、流动监测组14个，监测面积达125万公顷，占全省鼠疫疫源面积的31.27%。鼠情监测结果：全省4月份黄鼠密度为0.47只/公顷，在1250030公顷面积上开展疫源检索。用间接血凝方法检黄鼠血清17534份，放免方法检黄鼠血清20387份，均未发现阳性血清。分别在通榆、长岭、乾安、双辽4县开展沙土鼠鼠情监测，沙土鼠的分布、数量及动态初步摸清。同时采取冬季毒杀对策，沙土鼠数量降低，沙土鼠情得到控制。
1995年，省动物鼠疫监测在12个县（市、区）设立监测组，共设监测组170个，其中，设固定监测组45个，流动监测组125个，监测总面积达264万公顷，占全省灭鼠面积的66.3%。动物鼠疫监测主要以病原学和血清学方法监测为主。监测点用细菌学方法共检验黄鼠2289组42948只，不明病死鼠20组175只，其他动物18组105只；检验各种蚤类2476组38161匹，蜱类5组82匹，均未检出鼠疫菌。用间接血凝方法检验黄鼠血清264807份，其中阳性17份；沙土鼠血清390份，结果均为阴性；其他动物血清1196份，犬血清中做出3份阳性，其余为阴性。用放免法检验黄鼠血清141841份阳性22份，其他动物血清301份，阳性5份，其余均为阴性。
1997年，检测血清24098份，完成任务120.49%。(www.xing528.com)
1998年，全省组建14个监测组，完成2个固定监测点和37个流动监测点的监测工作，监测面积20.5万公顷，占全省疫源地面积的5.15%。黄鼠数量调查779公顷。对有沙土鼠的通榆、长岭、双辽、乾安县鼠的数量进行调查和监测，全省血清学检验22873份，全部为阴性。在通榆县探索地理信息系统（GIS）、全球卫星定位系统（GPS）和遥感技术（RS）在鼠疫监测中的应用研究。1991～1998年，吉林省鼠疫处于静息期，除镇赉国家级监测点外，其他县级防疫站鼠疫监测以血清学监测为主，不做细菌性检验。
1998年10月，全省恢复鼠疫强毒室并承担鼠疫细菌检验任务。投入60万元装备鼠疫实验室，其中，10万元用于装备省地方病一所强毒室，另外50万元装备县（市、区）强毒室，11个鼠疫疫源县（市、区）的鼠疫实验室全部按标准建成使用，12个县级鼠疫强毒室恢复标准化运行。在洪水灾害前期，及时下发《关于做好洪水灾区鼠防工作的紧急通知》《吉林省洪水灾区灭鼠方案》《吉林省洪水灾区鼠疫控制方案》《吉林省洪水灾区鼠疫监测方案》，编发鼠疫防治宣传材料。全省鼠疫疫源地受灾县（市、区）分别组成防治监测组8个，分布23个点工作，打样方290个，扑获鼠149只，鼠密度为0.51%；检验黄鼠血清961份，对不明原因死鼠进行细菌学培养6只，结果全部为阴性。小型鼠数量调查，布夹2800个，扑鼠136只，扑鼠率4.86%。家栖鼠数量调查，布块2832个，扑鼠267只，扑鼠率9.43%。
1999年，共组建15个监测组，设43个监测点，完成2个固定监测点和18个洪水灾区流动监测点及23个常规监测点的监测工作，监测面积25.0万公顷，占全省疫源地面积的6.28%。黄鼠密度为0.53只／公顷；对通榆、长岭，双辽、洮南、乾安县的沙土鼠分布数量进行调查和监测，密度为0.38只／公顷。全省血清学检验6997份，全部为阴性。
2000年，全省组建15个动物鼠疫监测组，完成2个固定点和39个流动点的黄鼠监测任务，其中，洪水灾区完成17个流动点，常规监测完成21个流动点；完成3个流动点的沙土鼠监测任务。间接血凝方法检验黄鼠血清20500份，对不明死鼠进行细菌学检验，未发现阳性材料。1991～2000年，吉林省鼠疫监测仍以病原学及血清学为主，10年共采用鼠疫细菌学方法剖检活黄鼠11589只，另有长爪沙鼠各种蚤、蜱等，未检出鼠疫菌。采用IHA方法检验黄鼠血清230211份，长爪沙鼠血清178份，检验结果均为阴性。（见表2-31）
表2-31 1986～2000年吉林省鼠疫监测点统计表
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