1986年，吉林省贯彻执行“预防为主”的卫生工作方针，加强疫情报告制度。鼠疫、天花、霍乱3种烈性传染病基本消灭，麻疹、脊髓灰质炎、百日咳、白喉4种传染病已基本得到控制。全省各种传染病总发病率为329.64/10万。
1987年，全省各种传染病总发病率353.48/10万。1988年，全省各种传染病总发病率哦298.71/10万。
1989年，全省各种传染病总发病率为329.56/10万，比1988年上升10.32%。发病率上升的主要病种有肝炎、性病，其他传染病的发病率均有所下降。各种传染病的总死亡率为0.66/10万，比1988年下降13.16%。
1990年，全省各种传染病的总发病率为331.80/10万，比1989年上升了0.32%。各种传染病的总死亡率为0.60/10万，比1989年下降1.64%。
1991年，全省各种法定传染病总发病率为227.76/10万，比1990年下降33.66%。总死亡率为0.41/10万，比1990年下降31.76%。肝炎的发病得到控制，发病率比1990年下降35.2%。
截至1992年末，全省收到法定报告传染病24种，总发病率为203.69／10万，比1991年下降11.63%，发病率排在第一位和第二位的传染病分别是菌痢、病毒性肝炎。传染病总死亡率为0.17/10万。
1993年，全省卫生防疫工作以防治病毒性肝炎和消灭脊髓灰质炎为重点，全省各种传染病总发病率为208.93/10万。
1994年，全省共报告法定甲、乙类传染病16种，即霍乱、肝炎、痢疾、伤寒、淋病、梅毒、麻疹、百日咳、流脑、猩红热、出血热、狂犬病、布病、斑疹伤寒、乙脑、疟疾，总发病率为230.54/l0万，前5位传染病依次为：肝炎(133.43／10万)、痢疾(70.33/10万)、淋病(12.87/10万)、出血热(5.09/10万)、猩红热(3.84/10万)。全年报告的甲、乙类传染病死亡率为0.33／10万，病死率0.14%，病死率较高的为狂犬病、乙脑、流脑、出血热和霍乱。(www.xing528.com)
1995年10月，国家卫生部将新生儿破伤风调整为乙类传染病，并纳入常规疫情报告系统。全省全年共报告甲、乙类传染病18种45144例，总发病率为183.52/l0万。其中，霍乱154例，病毒性肝炎26168例，痢疾13221例，伤寒499例，淋病2640例，梅毒17例，麻疹58例，百日咳l4例，流脑242例，猩红热845例，出血热1238例，狂犬病2例，钩体病1例，布病31例，斑疹伤寒2例，乙脑4例，疟疾2例，新生儿破伤风1例。全省传染病发病率与1994年同期比下降21.94%。
1996年，法定报告甲、乙类传染病26种，实际发生并报告16种，计47532例。法定报告传染病发病率下降到183.85/10万，其中，霍乱18例，病毒性肝炎27427例，痢疾15284例，淋病2214例，梅毒113例，出血热1067例，猩红热809例，流脑270例，麻疹115例，伤寒99例，布病89例，百日咳17例，新生儿破伤风6例，炭疽2例，狂犬病、疟疾各1例。
1997年，全省共报告法定管理的甲、乙类传染病17种，其中甲类1种（霍乱），乙类16种。总发病数64060例，死亡52例，总发病率为245.82/10万，死亡率为0.2/10万，病死率为0.08%。1997年比1996年的总发病率上升34.1%，上升原因是，从1997年度开始将丙类传染病肺结核纳入乙类进行疫情报告管理，致使总发病数增加。占前5位的有病毒性肝炎（124.32/10万）、痢疾（58.39/10万）、肺结核（42.21/10万）、淋病（11.86/10万）、出血热（295/10万）。另外，猩红热、梅毒、伤寒、流脑的发病率分别为1.86/10万、1.53/10万、1.37/10万。发病率上升幅度较大的传染病有梅毒、淋病、伤寒。
1998年，全省法定报告传染病总发病率为164.87/10万，总死亡率为0.11／10万，总发病率与1997年同期累计比下降32.93%，死亡率下降23.68%。无甲类传染病发生。
1999年，全省共报告法定传染病15种，发病率为186.98/10万，比1998年下降10.37%，死亡率为0.14/10万，比1998上升10.37%，法定报告传染病发病率前6位的是肝炎、结核病、痢疾、淋病、梅毒、出血热。与1998年相比，传染病发病率下降的有12种：脊髓灰质炎、狂犬病、乙脑、霍乱、猩红热、流脑、痢疾、伤寒、新生儿破伤风、肝炎、肺结核、淋病。与1998年相比传染病发病率上升的有7种：疟疾、布病、艾滋病、梅毒、麻疹、出血热、百日咳。全省无暴发疫情。
2000年，全省报告法定传染病17种，总发病数为40093例，发病率为150.86／10万，与1999年相比下降19.32%；死亡数为25例，死亡率为0.09/10万，病死率为0.06%。与1999年相比，死亡率下降33.82%，病死率下降17.97%。法定报告传染病发病率前6位的是：病毒性肝炎69.07/10万，比1999年下降22.74%；肺结核36.30／10万，比1999年下降6.29%；痢疾19.47/10万，比1999年下降27.56%；淋病11.74／10万，比1999年下降25.83%；梅毒7.92/10万，比1999年下降11.69%；出血热4.62／10万，比1999年下降10.90%。法定传染病报告发病率上升的有2种：麻疹0.44/10万，比1999年上升272.86%；伤寒0.01/10万，比1999年上升95.91%。（见表2-7）
表2-7 1986～2000年吉林省甲乙类传染病发病率统计表
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