“内地化”为中心的行省制方案，以龚自珍的设计方案最具有代表意义。龚自珍向有经世抱负，对边疆史地，尤其是干戈叠起的西北边疆，一直十分留意，而且洞悉先机。具体来说，龚自珍的内地化方案包括三大方面：夺伯克之权，新疆建省；移民新疆；开发新疆。
首先，在制度设计上，废除军府制，建立行省制。具体来说，他的建省方案包含两个层面：建省，夺权。第一，龚自珍构想的新疆行政建制是：设兵部尚书、右都御史级地方总督一员，兵部侍郎、右副都御史级地方巡抚一员，布政使一员，按察使一员，巡道三员，提督一员，总兵官三员，知府十一员，知直隶州三员，知州二员，知县四十员。[10]第二，鉴于伯克制弊端，龚自珍主张降低伯克地位。在政治上，除仍然建议赏给哈密、辟展两郡王协办府事官名号，排班在道府之下、同知之上外，对其他札萨克和伯克，则以知县、知州夺取大部分权力，在各回城伯克中，遴选一人为协办县事，排班在知县之下，县承之上；在经济上，废除乾隆朝制定的民族隔离政策、特别是对汉人到新疆经商及到南路屯田的限制，在“开垦则责成南路，训练则责成北路”的思路下，在新疆引入内地租佃制。撒屯田为私田，允许内地富裕民众“自占土地”，“以万人耕者授万夫长，以千人耕者授千夫长，回人之贫者以之为佃”，最终通过内地富裕民众雇佣大批贫困回民为佃农，争夺伯克们对民众的控制权从而削弱伯克权力。[11]
其次，移民垦屯，进而实行编户齐民。乾隆朝平定新疆后，除令原先驻防的满洲、绿营官兵开垦屯田，更陆续由内地增调屯田兵，同时徙民到哈密、乌鲁木齐、伊犁等处。嘉庆朝松筠在伊犁将军任内，也令驻防旗兵引水辟田。但规模都不大，而且意在嘉惠八旗兵，对于舒缓内地对新疆的供给帮助不大。龚自珍提出的移民开发新疆计划，规模宏大得多。他拟订了一个七年移民计划，建议委任大臣负责有关边政，先期在新疆移垦区开辟道路，兴修水利。移徙对象分为强迫性和鼓励性两类。鼓励移徙的对象为：京师游食的土著之民，直隶、山东、河南、陕西、甘肃之民，山西愿徙之土著，江南省凤、领、淮、徐之民，山西大同、朔平性情强悍、敢于行路之民。强迫移徙的对象为：江西、福建种芋草之奸民，各省生齿日繁之旗人，大省、小省各按配领遗行若干丁。[12]其中，凡移徙丁、户，官给盘费，旗人加厚；经安插后，再给蒙古帐房一间及牛、犁、种籽及相应土地。同时，对“新迁人等，及旗人回人等”“未能知书者”，在大规模屯田三十年后开科取士，之后把所屯之田全部分于屯田之民私有作为世业，“公田变为私田，客丁变为佃户，戍边变为土著”，兵农合一而作为边疆防御主要力量。龚自珍提出移民开垦计划，高瞻远瞩，兼具政治和经济作用。从政治角度来看，移民可以增加清朝在新疆的基层力量，为建省建立基础。从经济角度来看，效益更为显著，不单可以释除内地供给新疆的压力，还可以舒缓内地人口急剧膨胀的压力，及解决“生齿日繁”而不事生产的旗丁和“不士、不农、不工、不商”，“不肯治一寸之丝、一粒之饭以益人”的浮民问题。(www.xing528.com)
再次，开发新疆资源。由于新疆地域广大，因而可供开采的金、银、铜、铁及其他各种非金属矿藏比比皆是。比如伊犁都兰哈拉地方及奇台、巴里坤之间扎哈心地方的银矿，奇台的湖图斯金矿、塔城的达尔达木图山金矿，和田、叶尔羌一带的玉石，自古闻名，价值很高。嘉庆十九年（1814）吏部尚书英和就认为：“新疆地方岁支兵饷百数十万两，内地颇受其累。其地向有金矿、银矿……如办理有效，足敷该处兵饷，则内地经费日见宽舒。”[13]但是由于清政府遵循“新疆总以镇静为本，不宜轻易更张”的宗旨，并没有从事有效开发。对此，龚自珍主张在政府主导下予以开发，“设采办红铜事务监督一员，用内务府人员，三年更调，驻扎吐蕃州。其甘肃省嘉峪关设监督一员，专司内地往准回贩易之税。除稻米、盐茶、大黄、布绸外，一切中国奇淫之物，不许出关，以厚其俗；除皮货、西瓜外，不许入关，以丰其聚。铜务关务，皆所以剂官俸，给兵糈也”。
龚自珍意识到，衰世要自改革，对新疆而言就是加强控制，内地化。由于现实与意识形态需求，清帝国版图迅速扩大。在大一统情况下，华夷关系逆转，帝国之内在皇权主义的不断调控下，四夷“华化”，同时，随着西力东渐，西方成为新“夷狄”。在此情况下，一方面，龚自珍把原本用来统治汉族的政策扩及整个帝国；另一方面，龚自珍也意识到在人口分布和经济繁荣方面，内地和新疆之间存在严重的不平衡性，因而内地化的总体方案下，讲究“损益之道”，通过行省制下有组织的移民实边，充实新疆人口，开发新疆资源，夯实新疆经济基础，削弱新疆和中原内地的政治经济文化发展不平衡，将中原的长治久安与新疆的边防建设、经济开发有机结合，肯定二者之间能够形成相互依存、互为呼应的关系。“联异域为一家”，确保国家整体结构稳定。这种思考问题的角度，超越了军府制依赖军事控制的局限，使新疆治理进一步向政治驾驭转变。正是如此，作为新疆建省第一人，在《西域置行省议》六十年后，以龚自珍建议为底本的新疆建省方案最终成为现实。
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