大学治理是实现大学功能的过程和活动，而大学内部的治理体系则是大学治理活动的基本载体，是在大学内部实现“善治”的手段和方法，是不同于传统大学内部管理的体制创新和机制创新。从传统意义上讲，管理体制主要是指管理系统的结构和组成方式，是为了实现管理目标而采取的具体的管理形式。“大学内部的管理体制”简单理解就是关于大学内部管理权限划分、管理机构设置以及机构间隶属关系等结构和组成方式的总称，主要涉及大学内部的权力结构、决策体制以及组织形式三个方面的内容，其核心是大学内部的正式制度体系。传统的大学内部管理体制，特别是公立高校内部的管理体制，通常是建立在科学管理主义基础上，以提高管理效率为基本目标，以“科层制”组织结构为基本的组织形式，以基于大学内部权力结构的领导体制、决策体制和执行体制等正式制度性约束为核心的大学内部管理模式。不难看出，传统的大学内部管理体制与大学治理有明显的区别，从价值和追求方面来看，大学内部管理体制追求的目标是管理的效率，而治理关注的则是大学作为人类社会特殊学术组织的整体效能。从功能和作用方面来看，大学内部管理体制的主要作用是建立和运行大学内部的正式制度约束体系，强调按章办事和上下层级间的命令与服从；而治理不仅关注正式制度和正式制度下的正式约束，同时，也更多地关注非正式制度和非正式约束，特别强调不同的利益主体间沟通、协调与合作机制。
可以将“大学内部治理体系”理解为：为了实现大学的“善治”目标，以现代大学精神和价值为导向，以制度设计和制度安排为主要手段，以多主体民主参与以及协同合作为基本运行逻辑，包括正式制度约束和有效的非正式约束两个方面内容的大学规则和秩序体系。不难看出，“大学内部治理体系”与传统的“大学内部管理体制”的相同点是都带有明确的工具理性倾向，都是实现大学内部科学管理的基本模式和具体方法；而相较于“大学内部管理体制”而言，“大学内部治理体系”的价值追求更为全面，制度构成更为宽泛，行动方式更为多样，是在“协同共治”理念观照下，系统和完整地实现大学“善治”的主要途径和重要方法。(www.xing528.com)
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