早在1992年，经甘肃省林业厅批准，设立了“高台县黑河流域自然保护区”；2004年，甘肃省人民政府批准功能区划，定名为“甘肃高台黑河湿地省级自然保护区”。2006年，成立张掖市黑河流域湿地管理局；2008年，张掖市委、市政府提出了“顺应自然，建设生态张掖”的发展思路，并调整张掖市黑河流域湿地管理委员会成员，决定在原甘肃高台黑河湿地省级自然保护区建设的基础上，申报建立甘肃张掖黑河湿地国家级自然保护区。2009年3月，甘肃省人民政府下发《关于调整甘肃张掖黑河湿地省级自然保护区范围的批复》，同意在原甘肃高台黑河湿地省级自然保护区基础上，将临泽、甘州境内黑河沿岸的湿地纳入保护区范围，面积由原来的3.65万hm2，扩大调整到4.1万hm2，建立甘肃张掖黑河湿地省级自然保护区。同时，向国务院上报《甘肃张掖黑河湿地省级自然保护区晋升国家级自然保护区的请示》。9月，通过国家环保部初审。11月20日，在北京召开的国家级自然保护区评审委员会上，来自全国各大院校、科研机构以及国务院各部委的30名专家，对全国申请晋升的66处自然保护区进行评审。张掖市申报的甘肃张掖黑河湿地自然保护区得到与会专家全票赞同，顺利通过国家级评审。与会专家一致认为，张掖市申报建立甘肃张掖黑河湿地国家级自然保护区，从国家安全战略和河西走廊生态保护等多个方面考虑，具有很强的重要性、必要性、科学性和可行性，有利于水源涵养与持续、均衡利用，同时在生态、遗传、经济等方面具有极高科学研究价值，符合晋升国家级自然保护区的条件和标准。2011年4月16日，经国务院审定，正式批准建立张掖黑河湿地国家级自然保护区，随后，成立张掖黑河湿地国家级自然保护区管理局，对张掖市黑河流域湿地进行全面统一管理。
与张掖市管理机构对口，1999年成立高台县野生动植物保护管理站，2004年成立高台县黑河湿地自然保护区管理总站，2007年成立高台县黑河流域湿地管理站，2011年成立高台县黑河湿地国家级自然保护区管理局。(www.xing528.com)
从湿地资源保护管理机构的沿革可以看出，当地政府和人民群众对湿地资源保护管理的重视程度，因此，建设高台黑河国家城市湿地公园是一项顺应民心，惠及子孙的生态工程。
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