元顺帝北逃后，朱元璋组织人马进行了多次北伐，洪武二十年正月癸丑日，他“命宋国公冯胜为征虏大将军，颍国公傅友德为左副将军，永昌侯蓝玉为右副将军，南雄侯赵庸、定远侯王弼为左参将，东川侯胡海、武定侯郭英为右参将，前军都督商暠参赞军事，率师二十万北伐（征讨纳哈出）”（《明太祖实录》卷180）。该年六月，纳哈出归降大明，辽东地区元蒙残余势力大体上被扫清。（《明太祖实录》卷182）随后，朱元璋下令在朵颜山地区设立泰宁、朵颜、福余等羁縻卫所，直接面对漠北鞑靼或瓦剌的进攻，起到辅助性抵挡与防御的作用。这些羁縻卫所与陕西、山西正北外围地区（相当于今天内蒙古包头、呼和浩特与集宁一带）设立的镇虏卫、玉林卫、云川卫、宣德卫、官山卫、察罕脑儿卫等一样，起到“缓冲”功能，一旦失去了，也无大碍，这是洪武时期大明北疆最外的一道防线或言第三道军事防线。
北疆第二道军事防线就是洪武中晚期起在大明北疆上密布的诸王，他们是甘州肃王朱楧、宁夏庆王朱
、西安秦王朱樉、山西太原晋王朱
、大同代王朱桂、宣府谷王朱橞、北平燕王朱棣、大宁宁王朱权、广宁辽王朱植、开原（今铁岭北开原市）韩王朱松等10多个“塞王”（《明史·诸王传》卷117、卷118）。到朱元璋驾崩为止，不说他的二十子朱松因年幼尚未来得及就藩，单就大宁“以善谋称”的宁王兵力就达到80 000人，加上辽东都司140 000兵士，应该讲朱元璋构建的第二道防线是相当牢固的，且富有“弹性”：其向西随时准备对付北元的侵扰，向东可以看住朝鲜的一举一动，而大明皇帝则可待在南京明皇宫里“遥控”指挥。
洪武时期在北疆上构建的第一道军事防线，就是自西北经正北再向东北开设了数百个军事卫所：在西北今甘肃、内蒙古和新疆东北部相接之处的军事要冲地带，洪武时期广设的卫所主要有安定卫、曲先卫、阿端卫、罕东卫、甘肃卫、甘州五卫、岷州卫、凉州卫、西宁卫等，在甘肃镇（今张掖）设置陕西行都司，统摄这些卫或所。（《明史·西域二·西番诸卫传》卷330；《明史·地理三·河南陕西》卷42）
在大明帝国正北地区设立陕西都司、山西行都司、大宁都指挥使司等几个“大军区”统制机构。陕西都司治所设在西安，下辖宁夏卫、宁夏中卫、山丹卫、永昌卫、凉州卫、镇番卫、庄浪卫、庄浪所、洮州卫、岷州卫、靖虏卫、西安诸卫。（《明史·地理三·河南陕西》卷42）
在陕西都司东北方向的山西大同设立山西行都司，下辖大同左卫、大同右卫、大同前卫、大同后卫、蔚州卫、朔州卫、天成卫、高山卫、阳和卫、玉林卫、东胜卫、万全左卫、万全右卫、怀安卫、怀来守御千户所等；在山西行都司南边的太原则设立山西都司，下辖太原左卫、太原右卫、太原前卫、振武卫、蒲州千户所、雁门千户所等。（《明史·兵二·卫所》卷90）
由山西行都司向东在大宁（北京偏东北方向）设置大宁都指挥使司。“洪武二十年九月置，（治大宁卫），二十一年七月更名（为北平行都指挥使司），领卫十。”它们是大宁左卫、大宁右卫、大宁中卫、大宁前卫、大宁后卫、新城卫、富峪卫、会州卫、榆木卫、全宁卫和开平卫等。（《明史·地理一》卷40；《明太祖实录》卷185）(www.xing528.com)
从大宁开始，大明帝国北疆逐渐延伸到了辽东地区。洪武四年设置辽东卫指挥使司，以刘益为指挥同知，负责处理辽东卫指挥使司军务。（《明太祖实录》卷61）后又下令设立“定辽都卫指挥使司，以马云、叶旺为都指挥使，吴泉、冯祥为同知，王德为佥事，总辖辽东诸卫军马，修治城池，以镇边疆”（《明太祖实录》卷67）。洪武八年九月癸丑日，大明在辽阳将“定辽都卫（改建）为辽东都指挥使司，置定辽前卫指挥使司，以辽东卫为定辽后卫指挥使司”（《明太祖实录》卷101）。其“治定辽中卫，领卫二十五，州二”（《明史·地理二》卷41）。
到洪武晚期时，辽东都指挥使司已发展到了相当广阔的区域，其下辖主要卫所有：定辽左卫、定辽右卫、定辽中卫、定辽前卫、定辽后卫、铁岭卫、东宁卫、沈阳中卫、海州卫、盖州卫、金州卫、复州卫、义州卫、辽海卫、三万卫、广宁左屯卫、广宁右屯卫、广宁前屯卫、广宁后屯卫、广宁中护卫、广宁卫、广宁后卫、广宁中屯所、广宁中左所、宁远卫、山海卫、安乐州等等。（《明史·兵二·卫所》卷90；谭其骧：《中国历史地图集》第七册（元明时期），中华地图学社出版，1975年第1版）
从辽东都指挥使司的管辖与军事势力覆盖范围来看，它“东至鸭绿江，西至山海关，南至旅顺海口，北至开原”（《明史·地理二》卷41），可能相当于整个辽东半岛。
这样，大致到了洪武晚期时，在大明帝国北疆上从西向东建立起了陕西行都指挥使司、陕西都指挥使司、山西行都指挥使司、山西都指挥使司、大宁都指挥使司和辽东都指挥使司等环环相扣的六大“军事区”，密布数百个卫（所），驻扎着近百万的军队，构成了严密的大明帝国北疆第一道军事防线，以此来阻挡和抵御剽悍的蒙古人南下侵扰与抢掠。
在这三道北疆军事防线中最为核心的是第二道，即老朱皇帝在北疆上分封的10多个“血脉相连”的藩王所组成的强大军事战略防线，就连里边的第一道防线上的各指挥官也得听从藩王的指挥。当然这是有战事的情况下才会这样，平时大家各司其职，和睦相处。所以说朱元璋在北疆地区的布防极有水平、极富弹性，有张有弛、张弛结合。
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